Профессор А. Фархварсон с конца 1715 года преподавал в Петербургской Морской академии. Ему принадлежат пособия по навигации и астрономии, а также первое в России издание «Начал» Евклида (1739). После открытия в 1715 году Морской академии в Петербурге в московской Навигацкой школе стали учить только арифметике, геометрии и тригонометрии. С этого времени Магницкий становится старшим учителем Математико-навигацкой школы и руководит её учебной частью.
С 1732 года и до последних дней своей жизни Л.Ф. Магницкий являлся бессменным руководителем Навигацкой школы, что в значительной мере способствовало распространению математических знаний в России. Сухаревская башня, в которой располагалась Математико-навигацкая школа, получила нарицательное имя и была чем-то вроде математического факультета, где получили образование многие учителя математики того времени. Именно Магницкому был поручен, начиная с 1714 года, набор учителей для цифирных школ, утверждённых тогда по всей России как прообраз нового всеобщего обучения.
Биографические сведения о Магницком скудны. В частности, даты его рождения и смерти известны из надписи на его надгробном камне, оставленной сыном Иваном. Однако из документов фонда Житенного Осташковского монастыря, ныне хранящихся в Тверском областном государственном архиве, известно, что «1742-го года при бытности строителя Аарона прибыло книг: 1. Триодь цветная дачи Леонтия Магницкова в десть». «Опись церковная» Житенного монастыря составлена в 1744 году и содержит полное перечисление книг, полученных монастырём в 1731, 1732, 1733, 1734, 1736, 1737 и 1742 годах, отдельно за каждый год. С учётом этих сведений есть основание предположить, что Магницкий умер не раньше 1742 года, если, конечно, его дарственная не «задержалась» на пути к монастырю. Даже в наши дни книги поступают в библиотеки с задержками.
Из надписи на могильном камне:
«В вечную память... добродетельно пожившему Леонтию Филипповичу Магницкому, первому в России математики учителю, здесь погребенному, мужу... любви к ближнему нелицемерной, благочестия... ревностного, жития чистого, смирения глубочайшего, великодушия постоянного, нрава тишайшего, разума зрелого, обхождения честного, праводушия любителю, в слугах... отечеству усерднейшему попечителю, подчиненным и отцу любезному, обид от неприятелей терпеливейшему, ко всем приятнейшему и всяких обид, страстей и злых дел всеми силами чуждающемуся, в наставлении и юных в рассуждении, совете друзей искуснейшему, правды как о духовных, так и гражданских делах опаснейшему хранителю, добродетельного жития истинному подражателю, всех добродетелей собранию; который путь сего временного и прискорбного жития начал 1669 года июня 9-го дня, наукам изучился дивным и неудобовероятным способом, его величеству Петру Первому великому императору и самодержцу всероссийскому для остроумия в науках учинился... в 1700 году, и от его величества, по усмотрению права ко всем всеприятнейшего и к себе влекущего, пожалован, именован прозвищем Магницкий и учинен российскому благородному юношеству учителем математики, в котором звании ревностно, верно, честно, все прилежно и беспорочно служа... и, пожив в мире сем 70 лет, 4 месяца и 10 дней, 1739 года, октября 19-го дня 20 по полуночи в 1 часу, оставя добродетельным своим житием... пример оставшим по нем, по шестидневной болезни... благочестно скончался...
Не по должности надписал горькослезный Иван, нижайший раб, сын ему любезный».
В память о Л.Ф. Магницком в 1969 году в городе Осташкове установлена памятная плита.
Прими, юне, премудрости цветы...
Арифметике любезно учися,
В ней разных правил и штук придержися,
Ибо в гражданстве к делам есть потребно,
Лечити твой ум аще числит вредно.
Та пути в небе решит и на мори,
Еще на войне полезна и в поли.
Обще всем людям образ дает знати,
Дабы исправно в размерах вступати.
Определение дроби: «Число ломаное ничтоже ино есть, токмо часть вещи, числом объявленная спречь полтина есть, половина рубля...»
Определение прогрессии: «Прогрессио есть пропорция, или подобенство чисел к числам в примножении, или во суменшении яковых либо перечнев».
Определение арифметической прогрессии: «Арифметическое прогрессио или пропорция есть, егда три или многая числа коеждо их от друг друга равное разнство, но разныя пропорции имать, и сие или единаким пошествием, яко 2, 4, 6, 8, 10, 12 или не единаким, яко 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13».
Определение геометрической прогрессии: «Геометрическое прогрессио или пропорция есть, егда три или многая числа, едину и туюжде между собою пропорцию, но разнства различная имут и сие единаким пошествием, яко 2, 4, 8, 16, 32, 64, 128, или не единаким, яко 2, 4, 6, 12, 18».
Добавим к сказанному некоторые соображения о мировоззрении Л.Ф. Магницкого, изложенные А.П. Денисовым в его книге «Леонтий Филиппович Магницкий» (М., 1967).
«Чтобы дать более полное представление об облике Магницкого, насколько это допускают имеющиеся исторические материалы, необходимо хотя бы вкратце охарактеризовать его мировоззрение.
Деятельность Л.Ф. Магницкого ярко свидетельствует о том, что он был убеждённым сторонником Петра I в его реформе просвещения в стране. Своей педагогической работой в стенах Навигацкой школы и созданием уникального труда «Арифметики» он много сделал для осуществления реформы просвещения и для распространения знаний в России.
Анализ учебника Магницкого в части, посвящённой кораблевождению, даёт ясное представление о его далеко не передовом взгляде на устройство мира. Признавая шарообразность Земли, Магницкий в то же самое время, ссылаясь на догматы православной веры, преподносит читателю основные положения геоцентрической системы мира в следующих выражениях: «О виде или фигуре мира заемше от учительнеиших древних же и нынешних мужей согласно мудрствующих, изряднее же от божественного писания предлагаем яко весь мир сферовиден есть и шароподобное положение имать, яко же вси древний философи согласно прияше, и многими свидетельствы подтвердите. Аристотель убо со всеми естествословцы утверждая глаголет, всему небеси в круг обтицати, и круговидну быти, такожде и высочайшую страну мира отвсюду оно быти. И по сих благочестивые меры догматов умству, есть истинно и верительно, и чувству нашему согласно».
Приведённое высказывание неопровержимо доказывает, что детство и юность Магницкого, прошедшие в церкви, монастыре и в Славяно-греко-латинской академии, наложили печать теологии на его мировоззрение. Он не признавал гелиоцентрической системы. Если в типографии Киприянова, где в качестве редактора работал Магницкий, и выходили иногда книги, в которых наряду с геоцентрической системой одновременно преподносились и взгляды Коперника, то это, несомненно, происходило не по инициативе Магницкого.
Можно предположить, что Магницкий, вероятно, даже хотел бы помешать распространению идей Коперника через издание книг типографией Киприянова, но не имел возможности сделать этого. Во всяком случае в его довольно большой книге «Арифметика» мы не находим ни единого упоминания о Копернике, его идеях, законах Кеплера, предположений о существовании других обитаемых миров и пр. В то же время «Арифметика» содержит немало теологических рассуждений.
Как же Магницкий представлял себе положение Земли в пространстве? Обратимся к «Арифметике». Там сказано об этом в следующих выражениях: «О свойственном же месте земли аще и различно мудрствуют ложение ее естественно быть, обаче нам сия несогласия ничтоже препятствия приносят в науках. О них же тщимся, и сего ради о месте ее идеже ложение имать глаголати оставляем приемше круго-видность токмо земли такожде и круговидное небесе состояние якоже выше солнца же и луны и прочих звезд подобное движение и всея сферы небесе и земли в колико колес и каждаго колеса во множайшия и древнейшия части сечение». Из приведённого высказывания видно, что, уклоняясь от прямого ответа на вопрос о положении Земли в пространстве, Магницкий в то же время явно тяготеет к геоцентрической системе.
Профессор Д.Д. Галанин, исходя из анализа «Арифметики» и различных фактов из жизни и деятельности, характеризует мировоззрение Л.Ф. Магницкого в следующих выражениях: «Однако Магницкий оставался верным последователем школы Лихудов и системы Аристотеля. На него можно смотреть как на последнего и наиболее выдающегося сторонника отживших философских учений в России.
Непосредственный его преемник и, можно сказать, ученик Михайло Ломоносов уже далеко шагнул вперёд, опередив не только русскую, но и западноевропейскую науку». И далее: «Я думаю, что в своё время, когда Магницкий писал «Арифметику», когда он был преподавателем Навигацкой школы, он был передовым человеком общества, резко отличаясь от консервативного обывателя, склонного к старой вере, к сохранению старых традиций, к сохранению тех форм и того уклада жизни, который ему, обывателю, завещала «святая старина». В силу этого либерализма Магницкий был на стороне первых реформ Петра I; он приветствовал и гражданский шрифт, и новое начало года, и изгнание из обращения лишних букв алфавита. Но жизнь опередила автора «Арифметики». Новое мировоззрение, в котором на место догматов веры было поставлено изучение природы и её явлений, осталось чуждым защитнику реформ, и он с ужасом, с ненавистью, со всей горячностью своей пылкой натуры восстаёт против этого нового течения».
Но ведь к началу педагогической деятельности в Навигацкой школе Магницкому уже был 31 год, и он, прошедший многолетний путь в церквах, монастыре и Славяно-греко-латинской академии, был человеком со сложившимся мировоззрением. В рукописном курсе Навигацкой школы и «Арифметике» Магницкий не только не говорит о передовых взглядах на устройство мира, но даже излагает в «Арифметике» ряд положений геоцентрической системы. Никакие документы и материалы не показывают, что Магницкий был пропагандистом идей Коперника, Кеплера, Галилея и Джордано Бруно.