5 декабря Нижний Новгород вновь был атакован со стороны Арзамаса большим отрядом «воровских людей», среди которых были «нижегородцы и арзамастци и алатырцы дети боярскне, и татаровя, и черемиса, и мордва, и бортники, и всякие подымные люди» во главе с Нефедом Собакиным, Степаном Сурвацким, Андреем Подбельским и Степаном Низовцовым.
Воины Алябьева опять выступили из города и «воров наголову побили и воевод воровских и языков поймали болши трехсот человек, а побили и потоптали воровских людей… на пятинадцати верстах и болши… а знамена и набаты поймали, а ушло тех воровских людей немного, врознь, потому что стала ночная пора». Все «воровские» командиры оказались в нижегородских тюрьмах.
Совет поручил Алябьеву с войском продолжить боевые действия, распространяя их на весь уезд и по возможности дальше. Крупный бой нижегородцев с тушинцами произошел в тот день в районе села Кадницы на Волге, где «воровские люди» были также разгромлены.
В донесении от 7 декабря сподвижники Лжедмитрия II Никифор Плещеев и Карп Навалкин жаловались, что «под Нижним государевых людей изменники нижегородцы разогнали» и просили Яна Сапегу о помощи.
Новые отряды тушинцев подходили к Нижнему с запада, со стороны Мурома, вдоль Оки. 10 декабря войско во главе с муромцем Тимофеем Лазаревым и князем Семеном Вяземским было встречено Андреем Алябьевым у Ворсмы. Вот как сам он опишет дальнейшие события пермякам: «Сошли в собранье в селе на Ворсме, от Нижнего за сорок верст, и воры встретили на две дороги, за пять верст от Ворсмы; и милосердый Бог мне, Ондрею, и государевым людям над воры помочи подал и воров побили, и языки многие поймали, и топтали, и побивали до села Ворсмы, и побив в селе стали и выграбив зажгли, а зажегши пошли в село Павлово; и к Павлову пришли воры, на две дороги, многими полки… знамяна поймали, а достальные воры розбежалися врознь».
А потом, угрожая «учинить, как над Ворсмою», Алябьев разослал послания старостам, целовальникам и крестьянам стародубских сел Яковцева, Вачи и Пуреха: «а под Нижним, канун Николина дня, мордву, и бортников, и арзамасцев, и иных многих воров побили наголову, а под Балахной воров же, атамана Тимоху Таскаева с товарищи побили наголову и повесили в Нижнем». Алябьев именем царя Шуйского требовал от крестьян этих селений прислать к нему повинные челобитные. Такая же грамота, направленная в Муром, дополнялась угрозой погрома.
В результате в декабре нижегородцам удалось решительно переломить ситуацию. Уже к 16 декабря они привели к присяге Василию Шуйскому Гороховец и Ярополч. А затем «села Павлова и Белавина и Матюшевские волости бортники, и иных государевых дворцовых сел и деревень, и поместных, и вотчинных и монастырьских, и Муромского уезда стародубцы и гороховленя, и села Везников и Сарыева и Шуя город и уезд, и старосты и целовальники и все крестьяня, государю царю и великому князю Василью Ивановичу всеа Русии добили челом, вины свои принесли и крест ему, государю, целовали». В дальнейшем ополченцы из всех этих мест участвовали в боях с тушинцами. До конца декабря в Нижний Новгород прислали отписки с изъявлением поддержки города Лух и Кострома.
Успехи нижегородцев в борьбе с тушинцами не остались незамеченными. По приказу Яна Петра Сапеги на Нижний выступил крупный польско-русский отряд во главе с Тимофеем Лазаревым и князем Семеном Вяземским. Перед ними была поставлена задача — захватить Нижний Новгород и подчинить его самозванцу. А 25 декабря 1608 года в Нижний Новгород из Москвы пришла царская грамота с призывом вместе с соседними уездами еще активнее бороться против Лжедмитрия II.
Облегчали обстановку для Нижнего операции войск Шереметева, большая часть которых зимовала в Чебоксарах: двигаться по замерзшим рекам посаженная на корабли рать не могла. В декабре из отряда началось было дезертирство в отряды Лжедмитрия II, перебежала часть арзамасских дворян во главе с Родионовым и Федором Васильевичем Левашевым (впрочем, последний вовремя успел вернуться). Тем не менее воины Шереметева, среди которых оставалось и немало нижегородцев, разгромили крупный тушинский отряд под командованием курмышанина Глядкова и арзамасца Полочанинова в сражениях под Чебоксарами 22 декабря 1608 года, под Свияжском 1 января 1609 года и Царевококшайском (ныне Йошкар-Ола) в конце января.
Обстановка была благоприятной для наступательных операций. Не дождавшись от Мурома выражений покорности, нижегородцы, как и обещали, двинулись туда походом под командованием Алябьева и городских голов Микулина и Износкова.
И тут они встретились с отрядом тушинцев под командованием Вяземского и Лазарева. В бою у села Бурцева (эта битва порой называется сражением под Богородским) в 20 верстах к югу от Нижнего Новгорода 6 января Вяземский потерпел поражение и отступил к селу Ямгородскому. Но там Алябьев на следующий день настиг противника и довершил разгром. Князь Вяземский и Лазарев были схвачены и повешены в Нижнем «без государева ведома» как «воровские воеводы». Их тела сбросили под волжский лед. Около 40 арзамасских дворян во главе с Федором Васильевичем Левашевым перешли на сторону нижегородцев.
В дневнике Сапеги можно прочесть оправдания потерпевших поражение тушинцев, которые 22 января пришли в лагерь под Москву: нижегородцы, «видя их нерадение, ночью ударили на них и разгромили их, и много пленных воинов увели в Нижний».
Владимирский воевода Лжедмитрия II Михаил Вельяминов прозорливо увидел в действиях Алябьева прямую угрозу и 11 января просил Сапегу прислать в Муром «роты две или с три», «чтобы государевым (т. е. тушинским. — В.Н.) людем не было порухи никоторые». Через два дня Вельяминов, сообщая, что нижегородские «изменники» идут на Муром и Владимир, умолял Сапегу прислать в помощь литовское войско уже в количестве пяти-шести рот.
В Нижний Новгород 12 января приехали из Москвы «сын боярской Роман Пахомов да посадской человек Родион Мосеев», которые были ранее посланы «ко святейшему Ермогену патриарху московскому и всеа Русии». Они от имени самого Гермогена поведали, что «на Москве святейшему Ермогену патриарху Московскому и всеа Русии, и всему освященному собору и христоименитому народу, от богоотступников от бояр и от польских и от литовских людей гоненье и теснота велия».
Энергичные действия в защиту порядка, крепкие стены кремля, серьезные военные силы, связь с основными силами Шереметева делали Нижний Новгород одним из центров начавшегося общероссийского движения против Лжедмитрия II. Город уже тогда, в начале 1609 года, воспринимал себя как центр общероссийского сопротивления самозванцу и являлся таковым.
В Нижний Новгород шлют из Луха схваченных там «воров», сюда бегут лояльные Шуйскому дворяне из Суздаля и Арзамаса. Лисовский овладел Галичем, разорив город, и костромичи, галичане и вологжане обращаются за помощью «из Нижнего ратных людей». Нижегородские стрельцы идут на выручку Юрьевцу и Шуе. Следуя грамоте Шуйского, Нижний входит в сношения с Вяткой и Пермскою землею. 26 января вятичи сообщали пермякам о примере и успехах нижегородцев. 31 января в Пермь из Нижнего ушла отписка с рассказом о победах войск Андрея Алябьева и с призывом: «И вам бы, господа, прося у Бога милости, в тот час итти со всеми людьми к царствующему граду Москве на разорителей веры крестьянской, на польских и на литовских людей, на Володимер или вам на которые городы податнее; а к нам тотчас отписати, и мы со всеми людьми и с Понизовою силою, которые ныне стоят под Шацким, пойдем на Коломну, а с Тулы Иван Заруцкой, а из Колуги бояром велим итти прямо к Москве, чтоб нам к царствующему граду Москве притти всем в один день».
Нижний Новгород из осаждаемого города превратился во всероссийский центр контрнаступления на врагов престола и порядка. Но не все было так просто и победно.
Успех еще сопутствовал нижегородскому воеводе в бою с тушинцами 6 февраля у села Кадницы, где Алябьев вынудил отступить к Арзамасу большой отряд тушинцев. Но 15 февраля нижегородское войско безуспешно штурмовало сам Арзамас. Более того, Алябьев был вынужден спешно начать отход к Нижнему Новгороду. При отступлении его войско 16 февраля было серьезно потрепано вблизи Собакинского леса. Поэтому не случайно, что Алябьев не подчинился указанию правительства Шуйского немедленно идти к Москве «с нижегородскою и балахонскою казною» (грамоты от 17 и 18 февраля 1609 г.).
В марте Алябьев вновь переключился на Муром. 18 марта там вспыхнуло восстание против тушинцев: попытка польского ротмистра Крупки его подавить провалилась, и назначенный Лжедмитрием II воевода Толбузин бежал во Владимир. «Жители Мурома встретили нижегородцев „с образы и крест царю Василью Ивановичю целовали“. 27 марта 1609 г. — наиболее боеспособные части войска А. С. Алябьева — московские стрельцы и астраханские казаки во главе с А. А. Микулиным и Б. А. Износковым, дворянские конные отряды нижегородцев во главе с кн. И. Д. Болховским и арзамасцев во главе с Я. С. Прокудиным и Ф. В. Левашевым (всего около 1 тыс. чел.) подошли к Владимиру», — зафиксировал Пудалов.
Владимирцы, узнав о приближении войск Алябьева, подняли восстание, схватили своего воеводу Вельяминова и притащили в соборную церковь, чтобы он исповедался и причастился перед смертью. Вельяминов будет забит камнями до смерти как враг Московского государства. 27 марта войска Алябьева вошли во Владимир.
Вместе с кинешемским и шуйским ополчениями 12 апреля они успешно отразили нападение на город польско-литовских отрядов Лисовского и Стравинского. Из Владимира нижегородцы отправили грамоты в Арзамас, Шацк и Мещеру с призывом перейти под власть московского правительства.
Удерживая Муром и не удаляясь далеко от Нижнего Новгорода в ожидании подхода «понизовой рати» Шереметева, Алябьев совершил успешный рейд в Касимов. Сотню нижегородских стрельцов во главе с Федором Семеновичем Мостининым он отправил в Юрьевец, где население присягнуло на верность Шуйскому. Затем отряд Мостинина принимал участие в боевых действиях в Костромском уезде.
Царь 17 мая послал Алябьеву грамоту, в которой благодарил за службу. Но воевода так и не решил поставленной задачи — пробиться к Москве. За что — вместе с благодарностью и пожалованием обширного поместья на Нижегородчине за прежние победы — получил и царский выговор.