2004 — 75-летие Патриарха Московского и всея Руси Алексия II.
3 февраля — в Свято-Троицкой Сергиевой лавре на открытии VIII Всемирного Русского Народного Собора Патриарх провозгласил, что настала пора заново осмыслить значительную роль Православия в мировой истории, в начертании судьбы человечества.
23 февраля — Святейший награждён орденом «За заслуги перед Отечеством» 1-й степени.
Май — официальный визит в Россию Предстоятеля Русской Зарубежной Церкви митрополита Лавра.
9 июня — перенесение мощей святителя Филарета (Дроздова) в храм Христа Спасителя.
2005, январь — по инициативе Патриарха Алексия начал работу православный кинофестиваль «Лучезарный Ангел».
Май — участие в праздновании шестидесятилетия Победы.
Июль — посещение Татарстана, Владимирской и Ярославской епархий.
Август — поездка в Калужскую епархию, в Санкт-Петербург и на Валаам.
Сентябрь — визит в Азербайджан, посещение Тульской епархии и участие в торжествах по случаю 625-летия Куликовской битвы.
Ноябрь — поездки в Нижегородскую епархию « в Молдавию.
2006, февраль — под руководством Патриарха Алексия на X Всемирном Русском Народном Соборе выработана и провозглашена «Декларация о правах и достоинстве человека».
Май — достигнуты договорённости о грядущем восстановлении канонического общения с Русской Зарубежной Церковью; Святейший посетил Латвию.
3 июля — Предстоятель Русской Православной Церкви возглавил работу Всемирного саммита религиозных лидеров, проведённого по его инициативе.
Сентябрь — 45-летие епископского служения Алексия II; пастырский визит в Калининградскую епархию.
Конец сентября — визит в Санкт-Петербург.
2007, март — на XI Всемирном Русском Народном Соборе Патриарх воззвал к властям России предпринять шаги по преодолению чудовищной бедности населения страны.
Апрель — ухудшение состояния здоровья Патриарха во время его пребывания в Германии, курс лечения в швейцарской клинике.
17 мая — в храме Христа Спасителя Патриархом Алексием II и митрополитом Лавром подписан Акт о восстановлении канонического общения с Русской Православной Церковью и Русской Православной Церковью заграницей.
Сентябрь — паломничество на Валаам.
1—4 октября — поездка во Францию, первый официальный визит Предстоятеля Православной Церкви в католическую страну после великого разделения Западной и Восточной Церквей 1054 года. Выступление на сессии Парламентской ассамблеи Совета Европы, в котором заявлено о решительном неприятии какого-либо отступления от норм морали в современном западном обществе.
Ноябрь — споры по поводу реформы школьного образования. Заявление Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II о том, что необходимо введение изучения основ культуры Православия и других традиционных религий в разных регионах России.
2008, февраль — визит в Россию митрополита Лавра.
20 февраля — открылся XII Всемирный Русский Народный Собор, посвящённый проблемам молодёжи.
15 апреля — заявление Патриарха Алексия по поводу разграбления православных святынь Косова и убийства православных жителей этого края, насильственно отторгнутого от Сербии.
24 июня — Архиерейский Собор, в котором впервые участвовали представители Зарубежной Церкви.
26—28 июля — поездка в Киев на торжества, посвящённые 1020-летию Крещения Руси.
12 сентября — освящение в Свято-Даниловом монастыре возвращённых из США колоколов.
16 сентября — Великое освящение Покровского собора Марфо-Мариинской обители милосердия.
20—23 сентября — посещение Санкт-Петербурга, Кронштадта и последнее паломничество на Валаам.
Октябрь — поездка в Константинополь (Стамбул).
23—25 октября — пастырский визит Патриарха Алексия в Белоруссию.
Конец ноября — отдых в Испании прерван из-за ухудшения здоровья Патриарха; лечение в Мюнхене.
30 ноября — в сослужении архиереев и духовенства Московского Патриархата, Сербской и Русской Зарубежной Церквей Святейший совершил литургию в мюнхенском кафедральном соборе в честь новомучеников и исповедников Российских.
1 декабря — возвращение в Москву.
2 декабря — в день памяти святителя Филарета Патриарх Алексий совершил молебен в храме Христа Спасителя.
4 декабря — литургия в Успенском соборе Московского Кремля. Последнее Святое причастие Патриарха Алексия II. После полудня — молебен у раки Патриарха Тихона в Донском монастыре. Последняя речь Предстоятеля.
5 декабря — кончина Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II в загородной резиденции Переделкино.
7 декабря — Великая панихида у гроба усопшего.
9 декабря — отпевание Патриарха Алексия II в храме Христа Спасителя, захоронение в Елоховском Богоявленском кафедральном соборе.