Поражение в войне с Тройственным Союзом придавали военной доктрине Парагвая фаталистический характер. Предыдущий военный опыт привел к выработке концепции тотальной войны, во многом схожей с идеями генерала Людендорфа и Сикорского. Скорость развертывания войск на ТВД в Чако находилась в прямой зависимости от состояния мобилизационных запасов и путей сообщения. Это наложило свой отпечаток на планы сторон.
Несмотря на разногласия в оперативных вопросах высшие парагвайские офицеры и лидеры Либеральной партии не ставили под сомнение необходимость всеобщей мобилизации сил и средств для достижения победы в Чако. Понимая, что окончательная победа над Боливией недостижима, создатели парагвайской концепции ведения войны ставили перед собой задачу ликвидации военного присутствия противника в Чако и закрепления за собой стратегически важных пунктов в центральной его части. При разработке отдельных положений этой доктрины учитывался русский и немецкий опыт маневренной войны. Многие приемы, которые использовали парагвайцы в ходе боевых действий, проистекали из специфических условий гражданской войны в России. Тем не менее, применение опыта европейских войн было ограничено, поскольку ТВД (театр военных действий) – дебри Чако и предгорья Анд – сильно отличался от европейских равнин. В этом плане наиболее близкой по идее для парагвайцев была доктрина японской императорской армии эпохи русско-японской войны: нанести частное поражение Боливии, и, воспользовавшись его политико-экономической нестабильностью, заключить выгодный мир, опираясь на поддержку Аргентины, своего старшего стратегического партнера.
Третьестепенная страна, какой является Парагвай, могла выиграть войну только в случае “интегральной мобилизации государства”. Несмотря на трудности в обеспечении войск необходимым оружием, парагвайское военное министерство планировало провести всеобщую мобилизацию и использовать все возможные ресурсы для достижения победы. При этом предполагалось заставить работать на войну все государственные органы и частные предприятия, подвергнуть регламентации жизненные потребности фронта и тыла. Одним из ключевых элементов мобилизации стал контроль за средствами массовой информации. Настраивая общество на “интегральную” войну, либералы и их русские советники постарались учесть ошибки 14 года и оптимально распределить ограниченные ресурсы страны между фронтом и тылом. Этот вопрос усложнялся тем фактом, что десятая часть парагвайцев была заражена проказой. Всего в годы войны были мобилизованы свыше 140000 человек, три четверти из которых попали на фронт.
Парагвайское командование деятельно готовилось к военным операциям. На протяжении нескольких лет оно изучало театр военных действий (ТВД) и своего вероятного противника. В становлении разведки большую помощь оказал отдел G2 аргентинского Генерального Штаба. Сбор информации проводился не только в военной области, но и политической области. Так, после размещения заказов у Виккерса, Парагвай обратился за оружием к Франции. На рубеже 30х годов при Генеральном Штабебыла создана картографическая секция. Её возглавил И.Т.Беляев, который был зачислен на действительную военную службу в чине полковника. Инструкция, данная ему Военным министерством Парагвая, гласила:
«Во исполнение данных директив необходимо:
– регистрировать все племена и поселения в восточной части Чако, описывая точки расположения, количество, материальное и моральное состояние, отношения к касикам (вождям), список которых приложить.
– передать под ответственность всех касиков племен необходимые орудия труда и материалы для жизнедеятельности.
– пригласить с собой в столицу страны представителей от каждого племени, с которым удастся вступить в контакт.
– принять меры для вакцинации индейцев с целью предохранения их от инфекционных заболеваний.
– выполнение означенных функций обязывает все гражданское население и военные органы Республики на местах оказывать посильную помощь.
– по возвращению из экспедиции все полученные данные, карты, планы и т.д. подлежат обязательной сдаче в архив.
– маршруты и внутренний порядок в экспедиции выбираются автономно с учетом необходимости достижения поставленной цели и экономии времени и ресурсов.
– при несчастном случае члены экспедиции приравниваются в правах к раненным (или убитым) на войне, а члены их семей – к членам семей раненных (или убитых) на войне».
Военное министерство с октября 1924 года по декабрь 1931 года организовало тринакдцать наземных экспедиций. Каждая из них длилась от двух недель до полугода. В ходе них составлялись подробные карты, делалось описание местности, как с военной, так и с гражданской точек зрения, велись дневниковые записи. Немаловажным результатом экспедиций Беляева оказались контакты с племенами гуарайо, ленгва, чакомоко и мака племенами, населявшими Чако. В составе экспедиций, кроме военнослужащих Парагвая и индейцев-проводников, принимали участие русские, успевшие к тому времени осесть в стране: братья Игорь и Лев Оранжереевы, Орефьев-Серебряков, сын известного русского полярника, участника первых рейсов ледокола «Ермак» Александр Георгиевич фон Экштейн-Дмитриев.
Изучение ТВД и контакты с аборигенами дали существенные преимущества дипломатам из Асуньсьона на переговорах, но не вели к окончательному разрешению территориального спора. С каждым голом становилось всё более очевидным военное решение проблемы Чако. Исследование потенциального противника было возложено на небольшое военно-статистическое бюро, созданное при Генеральном Штабе. Его данные не радовали правящую верхушку Парагвая. После мобилизации численность войск противника оценивалась в 95000 человек, из которых половина могла появиться на фронте.
С 1924 года парагвайское командование разработало четыре сценария войны с Боливией. Первый из них был представлен генерало-майором П.Эскобаром и полковником М.Рохасом в августе 1924 года. Они скептически оценивали результат столкновения в глубине Чако. Опираясь на авторитет генералов Людендорфа и Джемса, он предлагал отвести главные силы за реку Парагвай, оставив четыре тет-де-пона на правом берегу. Согласно плана в случае войны с Боливией требовалось разместить 780 офицеров и 11600 солдат в четырёх пунктах: Баия-Негра, Фуэрте Олимпо, Порто-Касадо и Вилья Айес. Здесь можно было бы использовать преимущество коротких коммуникаций и моральный потенциал народа. Эскобар и Рохас предлагали использовать водную артерию для попеременного сосредоточения сил на каждом из них. Попеременно сосредотачивая на каждом из плацдармов превосходящие силы, генерал планировал уничтожать противника по частям. При благоприятном ходе событий войска должны были перейти в наступление и овладеть фортом Баливьян, занятием которого планировалось окончить войну. С точки зрения мирового военного опыта этот план был наиболее очевидным. С определёнными оговорками этот план поддержал и военный министр М.Скенони. Эта концепция территориальной обороны также исходила из комплекса неполноценности по отношению к Боливийской армии, однако не была разделена всеми.
План Эскобара столкнулся с решительным сопротивлением со стороны некоторых старших военачальников. Одним из его оппонентов был подполковник Хосе Феликс Эстигаррибия, который возглавил Генеральный Штаб в 1929 году. Из его "мемуаров", с самого начала подполковника Эстигаррибии, который был начальником Генерального штаба в 1929 году. Эстигаррибия, знавший Чако, считал, что отход к реке Парагвай позволит противнику без труда достичь до восточного берега реки Парагвай, что означало его конечную цель. Этого мнения придерживались военный министр М.Скенони, его русские советники и майор Р.Франко, ставший знаменосцем бескомпромиссной борьбы с боливийской экспансией. К чисто моральному аспекту – активным боевым действиям, добавлялись соображения экономического плана: в случае реализации плана Эскобара, боливийцы занимали богатые правобережные луга, где имелось достаточно воды, и разработки квебрахо,
В своих «мемуарах» Эстергаррибия пишет, что настаивал на ведении активных боевых действий. При этом он предполагал использовать опыт русской гражданской войны. Свою точку зрения он обосновывал концепциями генералов Э.Бастико и Ф.Кюльмана, прогнозировавших повышение маневра на войне. Однако парагвайский исследователь подполковник Антонио Гонсалес считает, что стратегические концепции Эстигаррибии не выходят за рамки общих слов, поскольку никаких письменных доказательств этого не сохранилось. Конфликт между командующим бригадным генералом М.Рохасом и начальником штаба привёл к переводу Эстергаррибии в Чако. В 1930 году он был назначен командиром I пехотной дивизии со штабом в Пуэрто-Касадо. Прибыв на будущий ТВД, командир дивизии принял решении о вынесении базы развертывания в окруженном болотами фортинеИсла-Пой, который должен был стать местом концентрации его войск. Линией снабжения стала узкоколейная дорога, идущая от Пуэрто-Касадо вглубь Чако. При помощи инженерного батальона она была проложена до Минас-Куэ (145 км). Сменивший Х.Эстергаррибию на посту подполковник Х.А.Айяла при помощи небольшой группы офицеров стал автором плана войны с Боливией.
Первый набросок плана был сугубо оборонительным. Он был подготовлен в самом начале 1931 года и учитывал недостатки, выявившиеся в ходе всеобщей мобилизации, проведённой год назад. Анализируя возможные планы противника, Айяла, считал, что главными целями наступления противника будут Асуньсьон и Консепсьон. Для эффективного противодействия противнику предлагалось продлить обе железных дорогм, ведущие вглубь Чако от Пуэрто-Пинаско и Пуэрто-Касадо. Конечными их пунктами должны были стать Фортин Толедо и Кампо Эсперанса. Под перманентной угрозой со стороны противника считалась и Баия-Негра, которую следовал укрепить фортификационными сооружениями. Однако, это направление считалось второстепенным и, в случае угрозы Консепсьону, войска из этого района следовало эвакуировать. По мнению Айялы, основные бои должны были развернуться на линии Бокерон-Нанава. Для защиты этого направления в состав Первой Дивизии передавались 3 (