Ко второй половине дня 21 апреля бой прекратился. 1-я рота понесла тяжелые потери – были практически полностью уничтожены две разведгруппы, всего погибло 26 человек. Еще три человека 334-го отряда погибли в течение двух дней, когда под огнем мятежников с места боя выносили изуродованные тела разведчиков. Помощь в выносе тел погибших оказывала рота 154-го отряда под руководством капитана Лютого. После этого боя длительное время 334-й отряд фактически был небоеспособен. Люди были психологически сломлены. Они ждали другой войны, но война оказалась не такой, как о ней снимали фильмы…
В ночь с 20 на 21 сентября 1985 года РГСпН № 333 173-го ооСпН под командованием старшего лейтенанта Сергея Кривенко, после высадки с вертолетов, проведя засаду на дороге Шерджанак – Кандагар уничтожила автомобиль и ехавших в нем четырех американских советников с охраной. Это позже стало ясно из захваченных документов одного из них – Чарльза Торнтона. Из этого случая советская пропаганда извлекла максимум возможного – в центральных газетах появились статьи о том, что американцы засылают в Афганистан своих военных представителей со всеми вытекающими из этого последствиями.
В конце 1985 года для перекрытия Иранской границы, с западной стороны, привлекая личный состав 5-й гв мсд и 70-й омсбр, в Шинданде был сформирован 411-й ооСпН, который получил название «8-й отдельный мотострелковый батальон». Командиром отряда был назначен капитан А. Г. Фомин. К концу года отряд был переведен в Фарах, откуда и начал работать по предназначению.
В конце января 1986 года 154-й и 334-й ооСпН, совместно с батальоном 66-й омсбр в течение двух суток провели захват укрепленного района «Гошта». Огневое подавление осуществляли батарея гаубиц Д-30, батарея «Град» и 335-й вертолетный полк. Потери войск при штурме УРа составили два человека убитыми (пехотинец и бортстрелок вертолета). В результате штурма было захвачено большое количество оружия и боеприпасов.
19 марта 1986 года разведотряд 15-й обрСпН на вертолетах днем высадился на перевалочный пункт мятежников в районе населенного пункта Кулала. В ходе боя разведчики, под командованием помощника начальника оперативного отделения штаба 15-й обрСпН старшего лейтенанта Лукьянова Сергея Константиновича, уничтожили 10 мятежников, попытавшихся огнем с места задержать продвижение спецназовцев. В бою спецназ понес потери – погибло пять разведчиков: В. Коваленко, П. Рожновский, А. Кушниров, В. Осипов, М. Мочернюк.
28 марта 1986 года разведотряды 334-го и 154-го ооСпН переправились через реку Кунар и захватили в районе Кареры господствующие высоты. В течение часа разведчики с помощью приборов ночного видения изучали и уточняли обстановку в районе горы Спинай, на которой находился базовый лагерь мятежников. Затем быстро провели её захват, уничтожив из бесшумного оружия часовых. Участвовавший в операции Лукьянов захватил пленного, который показал, что неподалеку находится еще один, более крупный, базовый лагерь. Благодаря этой информации еще один лагерь был захвачен и уничтожен. Вскоре разведчикам удалось незаметно приблизиться к огневой позиции ДШК и захватить его. С утра 29 марта мятежники предприняли отчаянные попытки отбить лагерь, однако благодаря умелой организации боя все атаки противника были отбиты. Разведчики использовали боеприпасы, захваченные на складах мятежников, а потому и «не жалели патронов».
В разгар дня, подразделения афганской армии, прикрывавшие разведчиков, без видимых на то причин бросили свои позиции и отступили. В 14 часов был получен приказ на отход. Отход осталась прикрывать группа старшего лейтенанта Александра Чихерева (он прибыл в Афганистан из состава 14-й обрСпН и погибнет через полгода в черных горах под Джелалабадом). Отойти оказалось сложно – по спецназовцам уже прицельно били три ДШК и мятежники подошли почти вплотную. Были ранены Лукьянов, начальник штаба 154-го ооСпН майор Анатолий Пятунин (через три года он умер в Таллинском госпитале после ампутации обеих ног) и еще около двадцати разведчиков. Вскоре прилетели два Ми-8, которые забрали раненых.
Работа вертолетов осложнялась близостью Пакистанской границы, что могло иметь свои последствия, однако заместитель командира 335-го вертолетного полка Юрий Иванович Владыкин, получив просьбу одного из командиров групп о помощи, бросил в эфир, зная, что все его переговоры записываются, и потом будут прослушиваться военной прокуратурой: «задачу понял, работать не могу, работать запрещаю, повторяй мои маневры…!» После чего ввел вертолет в пике и открыл огонь по мятежникам. Под шквалом огня вертолетов, мятежники начали отходить.
К вечеру с пакистанской территории к Карере начали подтягиваться грузовики с коммандос. Вертолетчики зашли вдоль колонны и обработали её НУРСами. Когда прилетели пакистанские «Пумы», вертолетчики их не трогали. «Пумы» начали высаживать на господствующие высоты десант. Ночью вертолеты прикрывали операцию по выносу раненых и убитых. На следующую ночь эту операцию повторили: разыскивали потерявшихся разведчиков, а так же раненых и погибших товарищей.
Всего в бою в районе Кареры 154-й ооСпН потерял убитыми десять человек: переводчик старший лейтенант Х. Д. Розыков, мл. с-т М. Н. Разливаев, ефр. С. В. Косичкин, рядовые В. М. Великий, А. В. Егоров, А. В. Подолян, В. Б. Эйнорис, В. В. Якута еще двое (Москвинов и Буза) пропали без вести, но позже было установлено, что в ходе боя они были убиты, а мятежники захватили их тела и унесли в Пакистан.
В 1986 году 173-й отряд провел ряд результативных налетов на крупные базовые районы мятежников: «Горы Хадигар», «Васатичигнай», «Чинарту» и другие. Данные районы были полностью очищены от мятежников, инфраструктура была уничтожена, и в результате базы, как очаги противодействия существовавшему режиму, перестали существовать. В ходе захвата укрепленного базового района «Васатичигнай» сержант Валерий Викторович Арсенов при обстреле закрыл собой командира 3-й роты старшего лейтенанта А. Кравченко. За свой подвиг сержант Арсенов был удостоен высокого звания Героя Советского Союза посмертно.
Операция в укрепрайоне «Чинарту» была проведена без потерь в результате грамотно спланированного и четко проведенного налета. Разведотряд 173-го ооСпН на вертолетах высадился непосредственно на укрепрайон, в котором находилось не более 70-ти человек. Вся операция заняла 8 часов. Было захвачено и уничтожено большое количество оружия и боеприпасов.
В июле 1986 года разведывательной группе из 22-й бригады удалось захватить 14 тонн опия-сырца, который моджахеды переправляли на восьми машинах из Пакистана. За это местные наркодельцы приговорили командира бригады полковника Герасимова к смерти.
В мае 1987 года спецназ провел весьма результативную операцию: 12 мая 1987 года в ущелье в районе Абчикан досмотровая группа № 424 во главе с лейтенантом Е. С. Барышевым из 668-го ооСпН во время облета обнаружила большой караван мятежников. Командир ведущего вертолета Ми-8мт капитан Николай Майданов высадил группу спецназа на входе в ущелье, а ведомый Юрий Кузнецов на выходе, и прикрывающая пара Ми-24 приступила к уничтожению заблокированного каравана. Охрана каравана попыталась сбить спецназовский заслон (всего было высажено 17 разведчиков, из них два офицера), но не выдержала вертолетного огня и стала метаться по ущелью. Через некоторое время Майданов привез еще 22 человека во главе с замкомандира отряда капитаном Воробьевым. Из отряда на помощь вышла бронегруппа. Подгруппа лейтенанта Клименко удачно захватила позицию ДШК, что позволило контролировать господствующую высоту. Вместе с бронегруппой, которой командовал старший лейтенант Савин, подошла приданная отряду артиллерия: четыре Д-30 и две машины «Град-В». К вечеру, для прикрытия действий группы досмотра в ущелье вошли две БМП-2. Группу досмотра лично возглавил капитан Воробьев. Во время досмотра двое разведчиков получили ранения. В ходе досмотра было обнаружено большое количество развьюченных животных, а позже были обнаружены и скинутые тюки. К моменту наступление сумерек подошла вторая бронегруппа с транспортными машинами, для вывоза трофеев, но головной БТР подорвался на мине, и колонна остановилась. Ночью мятежники предприняли попытку отбить груз, но разведчики отразили атаку. В бою получили ранения трое спецназовцев. В связи с тем, что уже было ясно, что караван не обычный, а больше сил в отряде не было, командование 40-й армии выслало на помощь спецназовцам роту 56-й одшбр из Гардеза. Рота была остановлена в районе Абчикана, в связи с тем, что никаких сигналов взаимодействия отработано не было, и была большая вероятность обстрела своих подразделений. Ночью мятежники еще раз попытались отбить караван, но снова встретили отпор и какое-то время вели по своему каравану минометный обстрел. Утром пара Су-25 отбомбилась по районам, по которым предположительно могли быть выдвинуты резервы противника. С утра приступили к разбору забитого каравана. Всего было захвачено (по информации С. В. Козлова): 16 ПЗРК «Хуньян» («Стрела-2м» китайского производства), ПУ РС – 5 ед., РС 9м22 м – 24 ед., БО – 7 ед., БМ-82 – 1 ед., ЗГУ – 1 ед., ДШК – 1 ед., СГМ – 1 ед., АК – 2 ед., один миноискатель, 700 кг медикаментов и шифровальная машина производства США.
На месте было уничтожено: ПЗРК – 1 ед., РС – 530 ед., выстрелов к БО – 570 ед., ПГ-7 – 950 ед., 82мм мин – 410 ед., 14,5 мм – 30 000, 12,7 мм – 61400, 7,62 мм – 230 000, мин «Клеймор» – 90 ед., мин ПМН – 170 ед., ручных гранат – 90, ВВ – 340 кг, 700 кг медикаментов, 193 верблюда, 62 мула, лошади и ишака, 47 мятежников. Это был, наверное, самый большой результат спецназа в Афганистане.
Однако, все же не обходилось без трагедий. 31 октября 1987 года одна из групп 186-го ооСпН при перехвате каравана с оружием понесла большие потери. Из 20 человек погибли 11, в том числе и командир группы старший лейтенант Онищук. Дело обстояло следующим образом: 28 октября 1987 года старший лейтенант Олег Онищук получил приказ выдвинуться в район кишлака Дури и организовать засаду на возможном караванном пути мятежников. Онищук считался уже опытным командиром группы – на его счету уже было 10 взятых им караванов. Группа Онищука устроила засаду и вечером 30 октября с расстояния 700–800 метров огнем стрелкового оружия остановила машину мятежников. Духи попытались отбить машину, но разведчики навели на противника пару Ми-24, которые рассеяли «духов».