После отражения налета Кинг решил продолжить поиск судов немецкого конвоя и отправил эсминец «Грейхаунд» расправиться с замеченным около острова Антикитер моторным баркасом. Не очень верное решение, поскольку одиночный корабль попал под вторую волну немецких бомбардировщиков и не имел никаких шансов отбить нападение. В 13.50 он был атакован сразу восемью пикирующими бомбардировщиками Ju.87. Три удачно сброшенные бомбы превратили эсминец в развалину, и он быстро затонул кормой вперед. Для спасения уцелевшего экипажа Кингу пришлось выделить эсминцы «Кандагар» и «Кингстон», а следом за ними ушли легкие крейсера «Глостер» и «Фиджи», задачей которых являлось общее прикрытие спасательной операции. Это «общее прикрытие» стало крупной ошибкой Кинга – в предыдущих боях крейсера практически исчерпали запасы зенитных боеприпасов. В итоге эсминцы, не выдержав атак с воздуха, стали поспешно отходить назад к основным силам флота, а главной целью немецких бомбардировщиков стал «Глостер». Механик Артур Стивенс, находившийся на борту этого крейсера, вспоминал:
«Помню, как я стоял там, глядя вверх, и видел идущий вниз бомбардировщик Ju.87. Я рассмотрел и пилота, который выдвинул из фюзеляжа подвеску, чтобы сбросить бомбу. Закрепленные под самолетом одна 250‐кг и четыре зажигательные бомбы вскоре закружились в воздухе, направляясь прямо в корабль. Полагаю, что они попали в переднюю часть крейсера, где-то в районе полубака. Но точно не уверен, так как наблюдал, куда смотрит пилот… А смотрел он, вероятно, вниз на корабль, и уж точно не на меня, хотя мои глаза были к нему прикованы. Взглянув по сторонам, увидел, что по левому борту пестрая команда уже спускала на воду спасательный катер. Когда он достиг воды, я прыгнул и ухватился руками за канат, думая, что он прикреплен к шлюпбалке. Однако впопыхах его кто-то обрезал, и у меня в руках оказался один лишь воздух. Я упал между бортом корабля и катером, погрузившись в воду, и все усилия направил на то, чтобы выбраться на поверхность. Последнее, что я почувствовал, были руки, втянувшие меня на борт катера».
Первые две бомбы, попавшие в крейсер, снесли на нем грот-мачту и повредили котельное отделение. После трех следующих попаданий «Глостер» потерял ход, и весь был объят пламенем. Команда, в спешке покидавшая корабль, ожидала помощи от своих коллег с «Фиджи», но, как оказалось, напрасно. Крейсер «Фиджи» лишь разбросал по воде спасательные круги и плотики, полным ходом удирая на юг. Из всей команды «Глостера» 725 человек ушли на дно вместе с кораблем, а остальные большей частью попали в плен к немцам. В 15.43, после нескольких сильных взрывов, «Глостер» повалился на борт и начал медленно погружаться в воду, находясь в 12 км от острова Пори.
По иронии судьбы, карьера крейсера «Фиджи» завершилась всего через несколько часов после гибели напарника. Уже в сумерках, в 18.45, корабль в охранении двух эсминцев обнаружил юго-западнее Крита пилот одиночного Bf.109 из I(J) /LG 2. Взлетев с аэродрома Молаи на Пелопоннесе, истребитель на пределе своего летного радиуса нанес исключительно эффективный удар. 250‐кг бомба упала у борта крейсера в районе миделя, прошла наискосок и взорвалась, разворотив днище корабля. Вода хлынула внутрь, затопив отсеки и существенно снизив скорость накренившегося крейсера. А в 19.15 уже практически неподвижную цель атаковал одиночный Ju.88, который пилотировал лейтенант Бреннер из 2./LG 1. Поскольку для немецкого летчика особых сложностей в прицеливании не было, «Фиджи» получил еще три попадания 250‐кг бомбами и в 20.15, перевернувшись, пошел на дно. Из числа его команды погибли 276 человек.
На следующий день, около 8 часов утра, свыше двадцати Ju.87 из I /StG 2 под командованием гауптмана Хитшхольда настигли в море эсминцы «Келли» и «Кашмир», обстреливавшие ночью захваченный немцами аэродром в Малеме. Несмотря на все попытки уклониться от падающих бомб, участь кораблей решилась очень быстро. После первой же атаки затонул в течение двух минут «Кашмир», получивший попадание прямо в центр корпуса. 82 человека из его команды погибли и 14 получили ранения. Затем опрокинулся и отправился ко дну «Келли» – погибли еще 130 человек. На счастье британцев, барахтавшихся в воде, поблизости находился эсминец «Киплинг», который ценой легких повреждений в результате обстрела с воздуха спас 279 матросов и офицеров из числа обоих экипажей. Немцы в ходе атак потеряли один «юнкерс», сбитый зенитным огнем.
Проигрывая сражение за Крит в результате господства люфтваффе в воздухе, командование британского флота приняло решение атаковать немецкие самолеты на земле, использовав для этого единственный находившийся в этом районе авианосец «Формидебл». В качестве главной цели выбрали аэродром на острове Карпанто (архипелаг Додеканес), где размещались пикирующие бомбардировщики Ju.87. Нужно заметить, что вся эта операция была направлена главным образом на повышение морального духа английских войск, поскольку на авианосце базировались всего 15–20 самолетов, половину из которых составляли истребители. Трудно было ожидать от них эффективного налета. Тем не менее для выполнения операции собрали крупные силы. В состав морского соединения «А» под командованием вице-адмирала Уиппела вошли авианосец «Формидебл», линкоры «Куин Элизабет» и «Бархэм», а также девять эсминцев в качестве кораблей ПВО.
25 мая эскадра «А» вышла в море, а в ночь на 26 мая она находилась уже в 150 км северо-восточнее Карпанто. В 3.30 на авианосце приступили к взлету восемь бомбардировщиков-бипланов «Фэйри Альбакор». Однако два самолета так и не смогли подняться в воздух, и еще два вскоре вернулись обратно из-за технических неполадок. Час спустя, согласно плану, с палубы взлетели еще четыре истребителя «фулмар», чтобы появиться над немецким аэродромом на рассвете. Налет для немцев оказался полностью неожиданным, но значительных потерь на земле они не понесли. На аэродроме сгорело всего два или три самолета – согласно докладам британских экипажей, это были Ju.87 и CR.42. Еще несколько самолетов получили повреждения. «Фулмары», прикрывая отход, выполнили 24 самолето-вылета – их пилоты заявили две победы в воздушных боях ценой двух потерянных истребителей. К 7.00 все оставшиеся «альбакоры» и «фулмары» вернулись на корабль, и британское соединение спешно начало отходить на юго-запад, в сторону Северной Африки. Команды кораблей находились в сильном напряжении, ожидая ответных мер со стороны люфтваффе. Они последовали в 13.20, когда британскую эскадру обнаружили экипажи пикирующих бомбардировщиков Ju.87 из II /StG 2 во главе с майором Эннеккерусом. Всего в налете приняло участие около 20 «юнкерсов». Британский историк С. Пак так описывал атаку:
«Только сейчас мы заметили стаю Ju.87 в чистом голубом небе, расцвеченном солнечными лучами. Они уже приступали к пикированию, не обращая внимания на наш зенитный огонь. Конечно, их главной целью являлся авианосец. Капитан командовал: «Право на борт!.. Лево на борт!..» Авианосец тут же следовал командам, ложась вначале на левый борт, а через несколько секунд – на правый. Однако с командного мостика мы продолжали видеть неумолимо приближающиеся самолеты противника. А потом услышали свист падающих бомб. Фонтан грязной воды взлетел на высоту 25 метров справа от носовой части корабля. Через пять секунд – новый фонтан, еще выше и еще ближе. Миллионы брызг искрились на солнце, подобно бриллиантам. Еще два близких разрыва бомб. Мы продолжали маневрировать, уклоняясь. А затем – попадание. И сразу в носовой части авианосца по правому борту возник пожар. Бомба угодила в одну из башен 114‐мм орудий, сорвав взрывом обшивку. Однако море было спокойным, корпус ниже ватерлинии остался невредимым, и поэтому в огромную дыру попало совсем немного воды. Бомбардировщики продолжали пикировать под трассами и разрывами зенитных снарядов. Последовали еще несколько близких взрывов, а потом страшный удар потряс «Формидебл». Корма авианосца буквально подпрыгнула, когда 500‐кг бомба прошла сквозь правый кормовой спонсон 114‐мм орудий и взорвалась на правой раковине. Почти невозможно описать свои ощущения, когда корма корабля подскочила вверх и опустилась обратно в воду. Задрожал весь корабль. С мрачным удовлетворением мы осознали, что испытали то же самое, что и множество других моряков наших кораблей за последние шесть дней».
Внешние повреждения авианосца «Формидебл» оказались не очень серьезными – пострадали башни универсальных орудий и одна из катапульт для запуска самолетов. 12 моряков погибли и 10 получили ранения. Однако внутри корабля были изолированы семь отсеков с пробоинами, заполнявшиеся водой. В итоге авианосец на полгода вышел из строя, отправившись на ремонт в Норфолк. Слишком дорогая плата для англичан за малоэффективную боевую операцию. Среди других британских кораблей во время воздушного налета сильные повреждения получил эсминец «Нубиэн». Взрывом ему разворотило корму, где находилось хранилище глубинных бомб, однако гребные винты остались целы, и корабль своим ходом добрался до базы. Зенитчикам удалось сбить всего один немецкий бомбардировщик, экипаж которого погиб.
27 мая на острове Крит находилось уже около 30 тыс. немецких солдат, которые полностью окружили гарнизоны союзников в Гераклионе и Ретимо. Налеты авиации окончательно сломили волю защитников к дальнейшему сопротивлению, и на следующий день началась их эвакуация. Она продолжалась по ночам в течение четырех суток. 1 июня 1941 года остатки гарнизонов острова сдались в плен. Потери союзников за всю кампанию составили примерно 22 тыс. солдат, из которых 16 тыс. оказались в плену. Остальные были убиты или пропали без вести. На море британцы лишились трех легких крейсеров и шести эсминцев, уничтоженных бомбовыми ударами с воздуха.
Немецким войскам операция по захвату Крита также обошлась очень дорого. Из 15 тыс. парашютистов, участвовавших в высадке, 6600 выбыли из строя. Около 4500 десантников было убито или пропало без вести. В период с 13 мая и по 1 июня немцы потеряли 220 самолетов, в том числе 119 Ju.52. В результате непосредственного воздействия противника были сбиты 167 машин, в том числе 80 – Ju.52, 55 – Bf.109 и Bf.110, 23 двухмоторных бомбардировщика (He.111, Do.17 и Ju.88) и 9 пикирующих бомбардировщиков Ju.87.