Необходимо было решить вопрос и с организацией новых баз флота в прибалтийских республиках. 10 ноября нарком ВМФ Н. Г. Кузнецов издал приказ № 00170, в котором потребовал назначить комиссию для разработки тактико-технического задания «на Главную базу КБФ в районе Палдиски»[894]. От комиссии требовалось начать свою работу уже 15 ноября и завершить ее не позднее 12 декабря 1939 г. По итогам своей работы комиссия должна была представить наркому ВМФ на утверждение тактико-техническое задание на базу, схему распределения территорий на карте и ориентировочные сметно-финансовые расчеты[895]. В развитие данной темы, 11 ноября 1939 г. нарком ВМФ направил Военному совету КБФ очередной свой приказ, где определил структуру военно-морских баз КБФ в Прибалтике[896]. Параллельно с прибалтийскими базами, в системе Главной базы флота Кронштадт полагалось сформировать командование и штаб Кронштадтской военно-морской базы. Этим же приказом были введены в действие «Временное Положение о командире Кронштадтской военно-морской базы» и «Временное Положение о командире военно-морской базы Лиепая». Срок выполнения данного приказа был обозначен 20 ноября 1939 года[897].
14 ноября 1939 г., Главный морской штаб ВМФ составил и направил начальнику Штаба КБФ капитану 1-го ранга Ю. А. Пантелееву «Оперативно-тактическое задание на сооружение базы Краснознаменного Балтийского флота в порту Палдиски» и «Таблицу расчета кораблей, частей и соединений, предположенных к базированию на порт Палдиски на 1.1.43 г.», которые были представлены на утверждение Правительства[898]. Согласно заданию, военно-морскую базу Палдиски следовало построить на полуострове Пакри «с расположением основных сооружений в районе порта Палдиски». База была предназначена для постоянного базирования, отмобилизования и бесперебойного снабжения в мирное и военное время сил, базирующихся на данный район[899]. В Палдиски было определено местопребывание Военного совета, Штаба, Политического управления, Военной прокуратуры и Трибунала КБФ, Управления тыла и Главного военного порта[900].
20 декабря 1939 г. нарком ВМФ Н. Г. Кузнецов своей директивой № 4280сс поставил в известность председателя СНК и наркома по иностранным делам СССР В. М. Молотова об утверждении тактико-технического задания на строительство военно-морской базы Палдиски, которое 15 декабря было выдано Наркомату по строительству СССР. По ориентировочным сметно-финансовым расчетам, общая стоимость сооружений военно-морской базы в Палдиски составила 502 млн рублей. Из общей стоимости основное направление кредитов следовало направить на: а) гидротехнические сооружения – 199 млн руб.; б) мастерские судоремонта – 18 млн руб.; в) склады жидкого топлива и боезапаса – 40 млн руб.; г) тепло-, энерго– и водоснабжение – 34 млн руб.; д) расквартирование и культурно-бытовое обслуживание – 78 млн рублей[901].
Исходя из общих задач по строительству и сроков готовности базы Палдиски, Наркоматом ВМФ совместно с Наркоматом строительства на 1940-й год был установлен объем работ на общую сумму в 120 млн рублей. Для продвижения постройки базы, нарком ВМФ Кузнецов просил председателя СНК СССР Молотова решить вопрос о выделении соответствующего кредита Наркомату строительства СССР на проведение работ, намеченных в соответствии с титульным списком[902]. В итоге, Совет народных комиссаров СССР в декабре 1939 г. принял постановление о выделении необходимых средств Наркомату строительства на производство строительных работ в Палдиски в 1940-м году[903]. (В дальнейшем, 25 февраля 1940 г. Комитет обороны при СНК СССР издал постановление № 90сс, где утвердил титульный список строительства военно-морской базы в Палдиски на 1940-й год общим объемом на 120 млн рублей[904].)
19 ноября 1939 г. нарком ВМФ Н. Г. Кузнецов издал приказ № 0040, где определил состав и очередность строительства береговых батарей в Эстонии и Латвии. В течение 1939-го года следовало установить на временных основаниях, с последующим переводом в 1940-м году на бетонную основу, шесть 130-мм береговых батарей, построить две 152-мм и одну 130-мм береговые батареи, а также установить шесть 45-мм батарей. Также, в 1939-м году нужно было построить временные позиции для 180-мм железнодорожных батарей. В течение 1940-го года Кузнецов потребовал соорудить в Прибалтике три 180-мм башенные береговые батареи, установить на временных основаниях, с последующей заменой в 1941-42 гг. на 152-мм батареи на постоянных основаниях, три 130-мм береговые батареи, а также установить на постоянных основаниях три 130-мм и одну 100-мм береговые батареи[905]. Помимо этого, начальнику Инженерного управления ВМФ было поручено произвести до 1 мая 1940 года изыскания и выбор позиций для установки в 1941-42 гг. одной 406-мм башенной береговой батареи, трех 305-мм башенных береговых батарей, трех 180-мм башенных береговых батарей, трех 152-мм открытых береговых батарей[906]. Общая сумма ассигнований на строительство береговых батарей и оборонных объектов на Балтике на 1939–1940 годы, утвержденная Комитетом обороны при СНК СССР, составила свыше 219 млн рублей[907].
23 ноября 1939 г. нарком ВМФ Н. Г. Кузнецов подписал приказ № 0042, где потребовал выполнить ряд организационных мер по созданию береговой обороны в новых районах. Во-первых, Кузнецов приказал сформировать в 1939-м году три 130-мм трехорудийные береговые батареи (№№ 23, 25 и 26) и шесть 45-мм четырехорудийных батарей (№№ 241–246)[908]. Во-вторых, нарком приказал перевести в 1939-м году в районы Палдиски и Вентспилса 180-мм железнодорожные батареи №№ 12 и 17, построив в этих местах временные позиции для данных батарей, а также 83-й зенитный артиллерийский дивизион в составе трех 76-мм четырехорудийных батарей[909]. Формирование вышеуказанных батарей следовало закончить уже к 15 декабря 1939 г.
Согласно этому же приказу наркома ВМФ, в течение 1940-го года также предстояло сформировать на Краснознаменном Балтийском флоте три 180-мм башенные батареи (№№ 314–316), из которых одну батарею на полуострове Симпернес и одну батарею на полуострове Сворбе, одну 180-мм открытую батарею южнее полуострова Кюбассар (№ 317), пять 130-мм (типа «Б-13») четырехорудийных батарей (№№ 42–46), одну 100-мм четырехорудийную батарею № 149 на полуострове Дагерорт и четырнадцать 76-мм (типа «3-К») четырехорудийных батарей на механической тяге (№№ 501–514)[910]. Формирование всех указанных батарей требовалось завершить к 1 марта 1940 года.
Для выполнения такого грандиозного объема строительно-монтажных работ в Прибалтике, туда срочно перебрасывались многочисленные инженерно-строительные части флота. В соответствии с расчетами Главного морского штаба ВМФ, для проведения берегового строительства были назначены следующие инженерные части: из состава 33-го инженерного батальона в районе мыс Пакри-порт Балтийский (Палдиски) – 4 саперные роты, 1 техническая рота, 1 учебная рота (с 28 декабря 1939 г.), на острове Большой Рооге – 1 саперная рота (с 28 декабря 1939 г.); из состава 34-го инженерного батальона на мысе Церель – 3 саперные роты, 1 техническая рота, 1 учебная рота (с 31 декабря 1939 г.), в Кейгусте – 2 саперные роты (с 31 декабря 1939 г.); из состава 35-го инженерного батальона в Виндаве – 2 саперные роты, 1 техническая рота, 1 учебная рота (со 2 января 1940 г.), на мысе Михайловский – 1 саперная рота (со 2 января 1940 г.), в Либаве – 2 саперные роты (со 2 января 1940 г.); из состава 36-го инженерного батальона на мысе Симпернес – 3 саперные роты, 1 техническая рота, 1 учебная рота (с 10 января 1940 г.), на мысе Дагерорт – 1 саперная рота (с 10 января 1940 г.), на мысе Тоффри – 1 саперная рота (с 10 января 1940 г.)[911].
Несмотря на заданные высокие темпы строительства береговых батарей, осуществить к началу войны с Финляндией создание полноценной Береговой обороны в странах Балтии не удалось. Ситуация объяснялась поздним началом развертывания оборонного строительства, медленными и нерегулярными поставками строительных материалов в Прибалтику, суровыми зимними условиями, а главное, начавшимися боевыми действиями с Финляндией. После начала войны перевозки по морю резко сократились, а ввиду общего обледенения Финского залива, наступило закрытие навигации. Все грузы направлялись по железной дороге в Палдиски, куда они начали поступать лишь в конце января 1940 г. Значительная часть грузов из-за задержек в пути, в связи с военными действиями, поступила в базы только в марте-апреле 1940 г.
Ситуация с оборонным строительством усугублялась нерешенностью вопроса определения границ земельных участков, занимаемых советскими воинскими частями. Советскому правительству уже к декабрю 1939 г. стало понятно, что отсутствие решения об аренде земельных участков и строений ставит под угрозу срыва весь замысел размещения советских войск на территории Прибалтийских государств. 27 ноября заместитель наркома иностранных дел ССР В. П. Потемкин выразил эстонской стороне мнение, что все вопросы, связанные с базами, требуют скорейшего решения