В 1556 г. Фердинанд I создал Придворный военный совет, который стал руководить строительством пограничных королевских крепостей. Крепости строили, как правило, по проектам итальянских инженеров, обычно из камня. Однако, когда нужно было спешить, использовали дерево, плетень и землю, которые особенно в первое время составляли главный строительный материал. Строительство и ремонт крепостей в течение всех полутора столетий борьбы с османской экспансией требовали большого труда крепостных крестьян. Когда опасность была велика, для укрепления отдельных крепостей собирали крепостных крестьян из близлежащих местностей. В начале 50-х годов Государственное собрание установило размер отработок на строительстве и ремонте в шесть дней и предписало оплачивать этот труд. Позже оплата исчезла и эту барщину стали называть «даровой труд». В 1567 г. ее увеличили до 12 дней в году. При этом было установлено, население какой территории занимается укреплением той или иной крепости. В этих работах принимало участие и население пользовавшихся определенными привилегиями сельских поселений — местечек (так называемых аграрных городков).
Не участвуя, как и дворянство, в войнах с оружием в руках, крестьяне вносили свой вклад в оборону габсбургской Венгрии. Они оплачивали содержание части войск, внося налоги в пользу государства. Численность единиц налогообложения («ворот») на его территории в XVI в. составляла в среднем 40–50 тыс., но из-за ущерба от войн она постоянно уменьшалась. Государственное собрание, представлявшее интересы венгерских магнатов и дворян, сохранило за собой право квотирования налогов. Оно определяло обычно размер налога по 2 флорина с «ворот», что давало казне 80-100 тыс. флоринов. Большую сумму давали так называемые регалии (таможенные сборы, налог на горнодобывающее ремесло) — 400 тыс. флоринов. Кроме того, казна получала доходы со свободных королевских городов и с королевских имений. Годовой доход казны превышал 500 тыс. флоринов. Это было больше, чем доходы королей Венгрии в 1490–1526 гг., хотя Габсбурги владели лишь третью прежней территории. И все эти деньги поступали от непосредственных производителей — крестьян и горожан.
Полученные средства, как и повинности крестьян прилегавших к крепостям местностей, шли на содержание прежде всего гарнизонов крепостей. Но средств этих не хватало. По решению Государственного собрания 1543 г. в пограничных крепостях следовало держать 16 тыс. воинов (12–13 тыс. легковооруженных кавалеристов-гусар и 3–4 тыс. пехотинцев). Один из письменных источников от 1577 г. оценивает численность воинов в гарнизонах 48 пограничных крепостей Венгрии в 16 801.
Основную массу находившихся в крепостях пехотинцев составляли венгры, бывшие крестьяне; мелкие дворяне становились профессиональными военными. В незначительном числе здесь были наемники-немцы, а также выходцы из югославянских земель. Численность гусар была в 10 раз больше численности тяжеловооруженных кавалеристов-немцев. Подавляющую часть лодочников сначала составляли сербы, но потом возросла доля венгров. Характерной чертой эволюции войска Венгрии было почты полное исчезновение тяжеловооруженной конницы. Крепости являлись базой для действий легкой конницы гусар. Гусары вели борьбу с вторгавшимися отрядами османов, совершали набеги на пограничные районы занятых османами областей, обеспечивая сбор налогов у жителей этих районов в пользу габсбургского королевства Венгрия.
В ходе постоянных военных действий гарнизонов крепостей гусары превратились в типичный для венгров род войск. Этот процесс зашел достаточно далеко уже к началу 40-х годов XVI в. и завершился позже. Южные славяне, бежавшие во владения королей Венгрии после 1526 г. и составившие там основную массу гусар, к началу 40-х годов понесли невосполнимые потери, а источников пополнения у них не было. Они служили главным образом османам в качестве марталосов. Их место в венгерской армии все больше занимали мадьяры, тем более что театром военных действий стала этническая территория мадьяр. Они мужественно сражались против османов, но 30-40-е годы оставили массу жалоб на их чудовищную жестокость по отношению к беззащитным крестьянам. В крепостях служили и западные наемники — немцы, итальянцы, испанцы, австрийцы, мораване, — однако их роль в пограничных войсках никогда не была значительной.
Расстояние между пограничными крепостями составляло 10–20 километров, а то и больше. Между ними не было гарнизонов, которые могли хотя бы на какое-то время приостановить продвижение совершавших набеги османских отрядов. Здесь обитали так называемые свободные хайдуки — крестьяне и пастухи, бежавшие из порубежья занятых османами территорий. Они действовали самостоятельно, совершая налеты на владения османов и грабя, соревнуясь с османами, население, подвластное Габсбургам.
Известна лишь одна попытка широких народных масс выступить против османов. Осенью 1526 г. серб Иован Черный, бывший когда-то «конным слугой» Яноша Запольяи, организовал объединенное боеспособное войско, в котором к началу 1527 г. насчитывалось 10–15 тыс. воинов, в основном сербов, которые переселились в начале 20-х годов в южные районы королевства Венгрии. К ним примкнули венгерские крестьяне и, по терминологии хрониста Яноша Зермега (1504–1584), «бродячие воины», видимо наемники различного этнического происхождения. Иован объявил себя потомком сербских деспотов и «ниспосланным богом» вождем борьбы против османов.
Учитывая боеспособность сербских воинов, Янош Запольяи направил войско Иована в районы южного Алфёлда для охраны границ. Местные феодалы рассматривали этих воинов из простонародья как нарушителей феодальных привилегий. Уже в конце 1526 г. местные сторонники Яноша Запольяи выступили против Иована: сначала потерпели поражение, а потом захватили столицу Иована — Сабадку (Суботицу). Поэтому осенью 1527 г. Иован Черный перешел на сторону Фердинанда I, рассчитывая на то, что тот будет вести войну против османов. Посланное Яношем войско под начальством воеводы Трансильвании Петера Переньи, состоявшее из дворян, саксов, крестьян из области Дьюлы, в апреле 1527 г. потерпело поражение от армии Иована: из 2 тыс. пехотинцев удалось спастись лишь 50; в бегство обратилась 10-тысячная конница.
Преследуя противника, сербы по долине Мароша вторглись в Трансильванию, дойдя до Хацега в Сасшебеша (современный Орэштие). Лишь 25 июня в битве у Седа самый опытный военачальник Яноша Имре Цибак разбил войско Иована, который бежал в Сегед, где против него выступили горожане. Иована поймали и казнили, войско его рассеяли, но не уничтожили полностью: 1 тыс. кавалеристов Янош принял к себе на службу в качестве наемников и в дальнейшем использовал в борьбе против Фердинанда I.
В движении Иована имелись элементы антифеодальной борьбы, связанные с выступлением против сербских воинов местного дворянства. Однако у нас нет, по-видимому, достаточных оснований квалифицировать эти события как антитурецкое и антифеодальное движение. Его значение состоит в том, что венгерское дворянство в критический момент борьбы с османами подчинило собственным классовым интересам дело защиты страны, выступив против народных масс, которые в силу своего социального и профессионального положения могли бороться против османской экспансии.
Руководство военными действиями осуществляли венгерские феодалы, состоявшие на службе у Габсбургов. Командование находилось в руках королевского и государственного главных капитанов (командующих). Первому подчинялись находившиеся в стране наемники, второй командовал дворянским ополчением и стоял во главе постоянного войска. Этот командующий был членом наместничества, которое в отсутствие короля в качестве его коллективного наместника являлось высшим центральным органом управления. В заседаниях Придворного военного совета, главной задачей которого было руководство войнами против османов, принимал участие один из советников органа финансового управления — Венской палаты (камеры). Палате отводилась определенная роль в обеспечении обороны материальными средствами.
В 1564 г. Фердинанд I разделил свои страны между сыновьями на три части. Непосредственно заинтересованные в борьбе против османов Венгрия, а также Чехия, Нижняя и Верхняя Австрия перешли под власть императора Максимилиана II (король Венгрии Максимилиан I, 1564–1576). Штирия, Каринтия и Крайна, которым также угрожали османы, достались эрцгерцогу Карлу (1540–1590). С 1577 г. пограничными крепостями Хорватии и Славонии руководили эрцгерцог Карл, Венгрии — эрцгерцог Эрнст (1553–1595), второй сын императора Максимилиана И. В Граце действовал особый военный совет, в ведении которого были крепости Хорватии и Славонии — так называемые вендские крепости. Венский Придворный военный совет ведал крепостями Венгрии. В 1590 г. Эрнст взял на себя руководство и хорватско-славонской линией обороны. Ранее линия крепостей была разделена между семью (шестью) главными капитанами (командующими). Они осуществляли военный суд, предоставляли военнослужащих военным и комитатским судам для исполнения их приговоров. Они командовали войсками, принимая участие в военных действиях.
Самую главную статью расходов страны составляло содержание линии крепостей. Подсчитано, что на это уходила вся сумма налога, собираемого с крестьянства. Самые же постоянные и устойчивые доходы — с регалий (с рудников и таможен) — шли на содержание королевского двора и на другие расходы королевской семьи.
Приостановка экспансии османов являлась задачей не только Венгрии и Хорватии, но и наследственных владений Габсбургов, Германской империи. Послы Венгрии, участвовавшие с 1521 г. в рейхстагах, подчеркивали общую для всех опасность османской угрозы. То же делали и хорватские сословия. Рейхстага признавали, что оборонительная линия в Венгрии — это ближайшая оборона немецкой нации, которую следует укреплять, снабжать припасами, воинами и т. д. Отмечалось также, что если сильный враг подчинит Венгрию, то он сможет распространить затем свою власть на всю империю. Власти Крайны рассматривали в качестве своего щита Хорватию. Это признавал и сам Фердинанд I, оказывавший вследствие этого помощь хорватским и славонским крепостям.