В тот же день на совместном заседании Пленума ЦК КПСС, СМ и ПВС СССР было принято решение о возвращении МГБ в состав МВД. 23 апреля 1953 года приказом МВД № 00142 ответственность за шифровально-дешифровальное дело было возложено на 8-е Управление МВД. Его начальником стал полковник Иван Тихонович Савченко (1908–1999), а его заместителем — генерал-майор А. И. Копытцев. Также в Управлении был создан Научно-технический совет (далее — НТС), к которому перешли функции Ученого совета ГУСС.
В том же году 8-м Управлением МВД были изданы две части учебника по криптологии: «Часть первая. Курс раскрытия шифров замены, гаммирования и перестановок» (автор М. И. Соколов) и «Часть вторая. Курс раскрытия кодируемых текстов и их осложнений» (авторы: Б. А. Аронский, В. Ф. Самсонов, И. В. Гусаков, В. И. Садиков, Н. А. Цыганков и А. Г. Выгодский).
24 апреля 1953 года ГУСС Постановлением РМ СССР была ликвидирована и разделена на три части: Специальная служба органов госбезопасности (8-ое Управление МВД), Специальная служба ГШ СА и Специальная служба Главного штаба ВМФ. ВШК перешла в подчинение 8-го Управления и стала называться Высшей школой 8-го Управления МВД. Однако ее штатное расписание и списки преподавательского и учебно-вспомогательного состава сохранились без изменений.
6 июня 1953 года был арестован министр внутренних дел Л. Берия. Указом ПВС СССР он был лишен полномочий депутата Верховного Совета, снят с должности первого заместителя председателя СМ СССР и министра внутренних дел, лишен всех званий и наград, а дело о его «преступных деяниях» передано на рассмотрение Верховного Суда СССР. Одновременно с Л. Берией были арестованы или отстранены от должности Л. Е. Влодзимирский, С. А. Гоглидзе, В. Г. Деканозов, Б. З. Кобулов, П. П. Лорент, В. Н. Меркулов, Б. П. Обручников, Л. Ф. Райхман, Н. С. Сазыкин, П. А. Судоплатов и ряд других руководителей МВД.
13 марта 1954 года Указом ПВС СССР был создан Комитет государственной безопасности (далее — КГБ) при СМ СССР. 8-е Управление МВД стало 8-м Главным Управлением (далее — ГУ) КГБ. Его начальником стал генерал-майор Василий Андреевич Лукшин (1912–1967), а его заместителем — генерал-майор А. И. Копытцев. «Положение о КГБ при СМ СССР» было утверждено Президиумом ЦК КПСС и введено в действие Постановлением СМ СССР от 23 декабря 1958 года.
16 марта 1954 года в МВД для обеспечения собственной шифрованной связи был создан 2-й спецотдел, начальником которого стал полковник И. И. Филаткин. 24 апреля 1956 года начальником спецотдела приказом МВД № 387 был назначен бывший инструктор Отдела административных органов ЦК КПСС полковник К. Е. Елисеев. По состоянию на 25 марта 1959 года в спецотделе работало 38 человек.
14 февраля 1955 года руководством КГБ было принято решение о выделении шифрованно-документальной связи из системы правительственной связи: телеграфная служба Отдела «С» была передана в 8-й отдел 8-го ГУ КГБ при СМ СССР.
8-е ГУ КГБ должно было выполнять две основных функции: во-первых, разработка шифров и систем криптографии для КГБ и МИД; во-вторых, обеспечение надежности и безопасности специальной связи СССР. Кроме того, персонал его перехватывал и пытался дешифровать радиообмен между иностранными правительственными учреждениями, используя искусственные спутники Земли, специальные суда и аппаратуру, размещенную в зданиях советских посольств.
ГУ в разные периоды времени возглавляли:
1. Лукшин Василий Андреевич (27.03.1954 — 16.03.1961).
2. Лялин Серафим Николаевич (16.03.1961 — 18.10.1967).
3. Емохонов Николай Павлович (02.07.1968 — 08.07.1971).
4. Усиков Георгий Артемович (август 1971 — август 1975).
5. Андреев Николай Николаевич (август 1975–1991).
29 апреля 1954 года начальником 8-го ГУ было утверждено новое «Положение о курсах усовершенствования офицерского состава частей Спецслужбы при Высшей школе 8-го Главного Управления». На Высшую школу (далее — ВШ) дополнительно были возложены функции рабочего аппарата НТС 8-го ГУ, подготовка научных кадров, научно-техническая информация, редакционно-издательская и библиотечная работа. Кроме того, на ВШ была возложена организация и проведение чекистской и языковой подготовки в 8-м ГУ. После отмены подготовки криптологов на дневном отделении ВШ единственным местом их подготовки осталось вечернее отделение.
В июне 1954 года Председатель КГБ Иван Александрович Серов утвердил новое «Положение о вечернем отделении Высшей школы 8-го Главного Управления по подготовке инженеров-криптографов». В этом Положении указывалось: «Вечернее отделение является отделением закрытого типа с 4-годичным сроком обучения и имеет целью подготовку криптографических кадров для работы в 8-м Главном Управлении».
Комплектование вечернего отделения производилось из числа сотрудников 8-го ГУ в возрасте до 40 лет, которые имели законченное среднее образование и опыт практической работы по специальности в дешифровальной службе. Тем, кто окончил вечернее отделение, присваивалась квалификация «инженера-криптографа» по специальности «ручные и машинные шифросистемы».
Значительное место в работе ВШ занимали курсы по подготовке и переподготовке криптологов разных профилей из числа сотрудников, уже занятых на криптологической работе, а главное — для вновь пришедших, в том числе окончивших «закрытое» отделение мехмата МГУ, где с 1954 года спецдисциплины не преподавались. На курсах были группы как для лиц с высшим образованием, так и для лиц, имевших среднее образование. Срок обучения на курсах устанавливался от трех месяцев до полутора лет. Эти курсы функционировали с 1954-го по 1964 год.
На курсах учились не только сотрудники 8-го ГУ, но и проводилась подготовка криптологов для специальных служб ГРУ ГШ СА, ВМФ, а также для Главного управления гидрометеослужбы при СМ СССР.
В январе 1960 года был принят закон «О новом значительном сокращении Вооруженных сил СССР», в соответствии с которым существенно сокращались и кадры КГБ. В связи с этим ВШ 8-го ГУ КГБ, имея в своем составе профилирующие кафедры, аспирантуру, вечернее отделение и курсовую систему, вошла в структуру (в сокращенном виде) ВШ КГБ как 4-й (технический) факультет.
Сначала факультет готовил на вечернем отделении по полной вузовской программе только инженеров-математиков для Государственного комитета по радиоэлектронике. Однако успехи спецслужб быстро поднимали его авторитет, и в 1961 году опять было принято правительственное постановление о подготовке криптологов высшей квалификации.
Перед факультетом была поставлена новая задача: набирать одаренных математиков из числа выпускников средних школ на пятилетнее обучение. По предложению авторитетных научных работников службы возглавить эту работу был приглашен профессор математики Иван Яковлевич Верченко (1907–1996).
В 1960 году по предложению 8-го ГУ и ТУ КГБ Ученый совет 8-го ГУ был реорганизован в Спецсовет № 1 ВШ КГБ под председательством А. М. Куренкова, которому были переданы все функции Ученого совета.
В мае 1962 года на факультете было создано дневное отделение по подготовке инженеров-математиков, а с 1 февраля 1970 года началась подготовка военных инженеров для частей специальной службы.
Достаточно вовремя завершилась работа по созданию первых учебников по основным криптологическим курсам. В частности, книга Л. А. Кузьмина объемом свыше 500 страниц была посвящена анализу дисковых (роторных) шифраторов, а книга Б. П. Антонова — линейному шифрованию телеграфных сообщений. По этим учебникам в течение нескольких лет выпускники факультета изучали тонкости криптологии.
Первый выпуск новой волны молодых криптологов состоялся в 1966 году. Уже через несколько лет их число превысило сотню, и они стали играть существенную роль в спецслужбах КГБ, СА, ВМФ и промышленности. Самые сильные из них регулярно возвращались на факультет как аспиранты, что укрепляло связь кафедры с оперативными подразделениями.
Начальниками факультета в разные периоды времени были:
1. Баженов Евгений Фомич (1960–1963).
2. Верченко Иван Яковлевич (май 1963–1972).
3. Бондаренко Владимир Иванович (январь 1972–1988).
4. Погорелов Борис Александрович (1989–1991).
Спецкафедру (криптографии) № 7 возглавляли:
1. Пондопуло Георгий Иванович (1960–1976).
2. Шанкин Генрих Петрович (1977–1991).
4-й (технический) факультет ВШ КГБ набирался опыта и заслужил заметный авторитет в спецслужбах страны. В 1970-х годах Коллегия КГБ дважды принимала решение о превращении его в самостоятельное высшее военное учебное заведение. После первого из них И. Я. Верченко «по горячим следам» разработал предложения, согласно которым факультет должен был превратиться в учебное заведение со статусом Военной академии.
Однако это предложение не нашло поддержки ни у руководства ВШ, ни в Управлении кадров КГБ, поскольку ставило факультет в более привилегированное положение по сравнению с «материнской» ВШ. И. Я. Верченко был рассержен, вступил в конфликт с начальством и отказался от продолжения руководства факультетом, хотя и продолжал читать на нем свой лекционный курс.
Начальником факультета был назначен генерал-майор Владимир Иванович Бондаренко (1918–?) — заместитель начальника ГУ КГБ, который прошел Отечественную войну и командовал ранее несколькими подразделениями ГУСС. Для быстрейшего решения возникших проблем В. И. Бондаренко стал искать себе надежного помощника, и в апреле 1972 года Л. А. Кузьмин был назначен заместителем начальника факультета вместо Е. Ф. Баженова (1914–1978), который ушел в отставку. Так начался новый этап развития Технического факультета ВШ КГБ и его кафедры криптографии.
Под руководством Юрия Владимировича Андропова на должности Председателя КГБ в период с 1967-го по 1982 год органы госбезопасности существенно укрепили и расширили свой контроль над всеми сферами жизни государства и общества. Усилилось их политическое влияние в партийной номенклатуре: Ю. В. Андропов был избран членом Политбюро ЦК КПСС, потом секретарем ЦК и впоследствии занял высший партийный пост Генерального секретаря ЦК КПСС.