Памятники монастырского некрополя находятся внутри Воскресенского собора и на территории монастыря, к югу и к северу от подземной церкви Константина и Елены. В настоящее время сохранилось 74 надгробия. Некрополь, как и весь архитектурный ансамбль, пострадал в годы Великой Отечественной войны. Многие памятники были разбиты, некоторые сдвинуты с места захоронения или исчезли. Документы монастырского архива и литературные источники позволяют получить сведения о несуществующих ныне захоронениях и воссоздать историю монастырского кладбища.
Наиболее древняя часть некрополя - усыпальница XVII века - находится внутри Воскресенского собора. Первые захоронения относятся к 1665 году. Под лестницей, ведущей в придел Голгофы, по распоряжению патриарха Никона были погребены художник Петр Заборский и иподьякон Никита Никитин,
Уже при строительстве собора частично была воспроизведена та система гробниц-святынь, которая существовала в храме-подлиннике в Палестине. По церковному преданию, под Голгофой находились захоронения первого человека Адама и первого ветхозаветного священника Мельхиседека. На этом месте в храме Гроба Господня в Иерусалиме существует придел Иоанна Предтечи, иначе называемый Адамовым. С XII века, времени владычества крестоносцев, в этом приделе помещались гробницы исторических лиц - первых иерусалимских королей Готфрида Бульонского и Болдуина (об этом гласит текст каменной коррективы, укрепленной в 1680-е годы у входа в одноименный придел Воскресенского Новоиерусалимского собора).
Система гробниц Иерусалимского храма в какой-то степени повлияла на размещение наиболее древних памятников некрополя Воскресенского монастыря. В первую очередь это можно отнести к гробнице самого патриарха Никона - по завещанию он был похоронен именно в приделе Иоанна Предтечи, что должно было поставить в один ряд патриарха - «первосвященника» русской церкви с первосвященником ветхозаветным.
Такую же аналогию можно усмотреть в том, что ближайшие ученики Никона, настоятели Новоиерусалимского монастыря, были похоронены в первом ярусе колокольни, - там, где в храме-подлиннике хоронили иерусалимских патриархов. В церкви Всех Святых под колокольней сохранились могилы архимандрита Герасима (1659 - 1665) и архимандрита Германа (1681 - 1682). В связи с разрушением собора места захоронений других настоятелей монастыря неизвестны, но из документов архива явствует, что традиция захоронения их внутри собора продержалась до второй половины XVIII века. Например, в 1771 году в соборе был погребен архимандрит Никон (1768 - 1771).
В южной части Воскресенского собора, где сосредоточены наиболее ранние захоронения, в приделе Архангела Михаила погребен Иван Шушерин - первый «жиз-неописатель» патриарха Никона.
С захоронениями этого периода связаны замечательные памятники поэзии и эпиграфики конца XVII века - стихотворные эпитафии. Наиболее яркой из них является эпитафия патриарху Никону, высеченная на белокаменной плите. Автор ее - архимандрит Герман. В эпитафии изложена история жизни, изгнания и смерти патриарха.
Вторая стихотворная эпитафия принадлежит архимандриту Никанору. Она помещена над захоронением архимандрита Германа и говорит о нем как о «рачителе писания хитроученом», «сочинителе изрядных песнопений» и «сложного писания» над гробом патриарха.
С течением времени внутри собора и на территории монастыря появляются захоронения местных землевладельцев и лиц, сделавших крупные вклады в монастырь. Первое захоронение такого рода - могила Василия Юшкова (ум. 1726) в приделе Архангела Михаила. Он был стольником вдовствующей царицы Прасковьи Федоровны, матери императрицы Анны Иоанновны. В 1723 году В. Юшков был сослан в Нижний Новгород, а последние годы своей жизни провел в вотчине, находящейся недалеко от Воскресенского монастыря.
Одна из дочерей Василия Юшкова была замужем за полковником И. М. Самариным. Могилы членов семьи Самариных находятся вне стен собора, к югу от подземной церкви. Самарины были в дальнем родстве с известными славянофилами из кружка И. С, Аксакова - Д. Ф. и Ю. Ф. Самариными.
Родственные связи и близость земельных владений к Воскресенскому монастырю определили состав монастырского некрополя в XVIII веке. Здесь мы находим представителей древних дворянских фамилий - Нащокиных, Олениных, Загряжских, Голицыных, Наумовых и других.
Лица, захороненные в монастыре, находились в родстве с видными государственными и общественными деятелями, деятелями культуры.
Алексей Степанович Бестужев-Рюмин и его дочь Наталья Алексеевна, вышедшая замуж за местного помещика А. Карпова, - представители старого дворянского рода Бестужевых-Рюминых, из которого вышли известные государственные деятели периода царствования Петра I, Анны Иоанновны, Елизаветы Петровны, декабрист М. П. Бестужев.
Семья Шуваловых может служить интересным примером родственных связей, определявших захоронения в Воскресенском монастыре. В 1749 году был сделан крупный вклад в монастырь женой фельдмаршала П. И. Шувалова Марфой Егоровной, урожденной Шепелевой. На монастырском кладбище находим могилы ее дальних родственников М. И. Шепелевой и ее мужа В. А. Сухово-Кобылина - родителей известного драматурга А. В. Сухово-Кобылина. Здесь же погребения сестры П. И. Шувалова Екатерины (в замужестве Олениной) и ее дочери Е. И. Хитрово.
Иногда лица, делавшие крупные вклады на поновление приделов собора, получали разрешение на захоронение в этих приделах. Предводитель дворянства Волоколамского уезда Б. А. Загряжский (дальний родственник тещи А. С. Пушкина) и его жена были похоронены в приделе Двенадцати и семидесяти апостолов.
В начале XIX века сын великого русского полководца А. В. Суворова Аркадий Александрович Суворов дал крупный денежный вклад на поновление придела Благоразумного разбойника в подземной церкви, позже переименованного в честь иконы богоматери «Утоли Моя
Печали». В 1806 году здесь была похоронена вдова полководца Варвара Ивановна Суворова, урожденная Прозоровская. Аркадий Александрович, по свидетельству современника, «складом ума, характером и воинскими дарованиями напоминавший отца», погиб при переправе через реку Рымник в 1811 году. Он был погребен рядом со своей матерью в том же приделе. Обе надгробные доски из чугуна сохранились.
Что касается поздних могил, второй половины XIX века, то это захоронения лиц, принадлежавших к разным сословиям.
Наиболее поздним является погребение А. С. Цуриковой (ум. 1907). Она была женой промышленника П. Г. Цурикова, сделавшего большой вклад на ремонт монастыря. Сохранился памятник из лабрадорита с мозаичным изображением Марии с младенцем, выполненным по эскизу известного русского художника В. М. Васнецова.
Памятники Новоиерусалимского некрополя представлены несколькими типами. К наиболее ранним относятся памятные доски, вмурованные в стены, саркофаги, белокаменные плиты. Эти типы надгробий самые распространенные. Они видоизменялись, но просуществовали до конца XIX века. В 50-е и 60-е годы XVIII века появляются каменные медальоны, вмурованные в стену, которые украшались коронами, ангелами, причудливым растительным орнаментом. В конце XVIII века барочный декор сменился классическим - надгробные плиты украшены более мелкими, упрощенными деталями, розетками, драпировками, монограммами. Наряду с саркофагами появились и новые типы памятников - «пирамиды» и «жертвенники», сохранившиеся во фрагментах. Для памятников XVIII - XIX веков характерно разнообразие материалов: известняк, чугун, гранит, мрамор, лабрадорит.
Памятники некрополя помогают установить не только круг лиц, захороненных в Новоиерусалимском монастыре, но порой являются важным источником для изучения истории монастыря, его социально-культурных связей.
АРХИТЕКТУРНО-ЭТНОГРАФИЧЕСКИЙ МУЗЕЙ ПОД ОТКРЫТЫМ НЕБОМ
Стремление сохранить уникальные памятники народного деревянного зодчества, познакомить с ними большой круг людей привело к созданию в различных областях РСФСР, и союзных республиках музеев-заповедников под открытым небом. Филиал Московского областного краеведческого музея - архитектурно-этнографический музей - начал создаваться рядом с ансамблем Новоиерусалимского монастыря в 1970-е годы. В настоящее время в этом музее установлены четыре деревянные постройки: церковь, часовня, крестьянская усадьба и ветряная мельница.
В настоящее время на территории Московской области сохранилось немного памятников деревянного культового зодчества. Это скромные по своим размерам церкви клетского или ярусного типа. Отсутствие шатровых храмов объясняется непосредственной близостью Подмосковья к центру государства. Церковные власти могли здесь строго контролировать исполнение архитектурных канонов середины XVII века, запрещавших шатровые завершения у церквей.
Церковь Богоявления привезена в музей из села Семеновского Пушкинского района. Она была построена в 1673 году на пустоши Подберезники рядом с селом Архангельско-Тюриково (ныне село Новоархангельское Мытищинского района). В начале XVIII века церковь обветшала, и в селе Архангельском построили новую. Старую же отдали на «погорелое место» в Семеновское. При этом здание несколько упростили и поставили на белокаменный цоколь. В XIX веке сруб обшили тесом, кровли и главку покрыли железом, к трапезной пристроили колокольню. При перевозе в музей памятник был реконструирован архитектором Б. П. Зайцевым.
Семеновская церковь относится к распространенному в Подмосковье клетскому типу. Название «клетский» («клецкий») связано с тем, что храм имеет в основании клеть - прямоугольный сруб, похожий на сруб обычной крестьянской избы. Клетские храмы являются, по-видимому, наиболее древним типом русских деревянных церквей, они были распространены повсюду, но чаще их можно встретить в центральной России. Семеновская церковь состоит- из квадратной в плане клети самого храма, к которой с востока примыкает пятигранный («по-круглому») алтарь, а с запада прямоугольная в плане трапезная. Рубленный «в обло» (наиболее примитивное соединение, при котором оставались выпущенными концы бревен), храмовый сруб плавно расширяется кверху, образуя повал, который позволяет вынести подальше от стен свесы кровли, предохраняя тем самым сруб от дождя. Кровля храма устроена на четыре ската.