Внутри сохранился уникальный резной семиярусный иконостас работы известного мастера Оружейной палаты Карпа Золотарева. Иконы в иконостасе написаны мастерами Оружейной палаты под руководством Федора Зубова. В храме сохранилась изразцовая печь XIX века.
К церкви примыкает Лопухинский корпус (1683–1686 гг.) – палаты, в которых жила царевна Екатерина Алексеевна, а с 1727 г. и до смерти в 1731 г. Евдокия Федоровна Лопухина (в монашества Елена), первая супруга Петра I, возвращенная из ссылки внуком, императором Петром II. Архитектурный декор Лопухинского корпуса выполнен в единой стилистике с декором Преображенской церкви.
Храм был закрыт в 1922 г. Вновь освящен 18 декабря 1982 г.
Спаса Преображения в Новоспасском монастыре собор (Крестьянская площадь, дом № 10). История Спасского монастыря берет свое начало со времен великого князя московского Ивана I Даниловича Калиты.
Им был основан придворный Спасский монастырь, главным храмом которого являлся храм Спаса Преображения на Бору. В 1490 г., расширяя территорию великокняжеского дворца, Иван III распорядился перенести обитель за реку, вследствие чего, монастырь получил наименование Новоспасского («монастырь Спаса на Новом»).
В 1496 г. был завершен и освящен собор во имя Спаса Преображения. Его строителями были итальянские зодчие, создавшие в эту эпоху много храмов и других сооружений в Москве.
В 1645 г. частично разобран, и на его основании по образцу кремлевского Успенского собора возвели современное церковное здание. Оно представляет собой пятикупольный, четырехстолпный, трехапсидный храм, с южной и западной сторон окруженный папертью. В южной части паперти, на ее сводах сохранилось изображение родословного древа российских государей. Начинают этот сюжет равноапостольная княгиня Ольга и ее внук, равноапольный великий князь Владимир, поливающие из сосудов корень царственного древа. Все правители изображены в полный рост, с нимбами вокруг головы. Собор поражает своею монументальностью.
Расписали его в 1689 г. Над росписью стен, сводов и колонн работали иконописцы под руководством известного костромского мастера Гурия Никитина. На правом столпе изображены устроители Спасского собора – цари Михаил Федорович и Алексей Михайлович. В руках они держат изображения самого собора. На стенах храма, вблизи царских врат в начале XVIII века были написаны портреты всех русских патриархов. Иконостас поражает своими размерами: длина его составляет 22 метра, высота – 24 метра. В нем расположены в пять ярусов 77 икон. До революции здесь находился чудотворный Нерукотворный Образ Спасителя, перенесенный из Вятки в Москву в 1647 г. Впоследствии этот образ был утрачен и ныне на его месте находится копия. В подклете собора расположена усыпальница рода Романовых и их родичей с храмом преподобного Романа Сладкопевца. Над входом в усыпальницу – портал с мозаичной иконой Нерукотворного образа Спасителя.
Собор был закрыт в 1918 г., и его помещения использовались под архив ВЧК – НКВД. Богослужения возобновились в 1991 г. Среди святынь в соборе находятся: чтимая Смоленская икона Божией Матери XVI века – вклад инокини Марфы, матери царя Михаила Федоровича, икона Божией Матери «Всецарица» – список с чудотворного образа, находящегося в Ватопедском монастыре на Афоне. К этой иконе обращаются с молитвами об исцелении онкологических больных. В соборе также находятся мощевики с частицами мощей апостола и евангелиста Марка, святителя Иоанна Златоуста, преподобного Серафима Саровского, преподобномученицы великой княгини Елизаветы Федоровны.
Спаса Преображения в Переделкине церковь (7-я улица Лазенки, дом № 42).
Первоначально здесь находилась усадебная церковь в имении Лукино. Современное церковное кирпичное здание выстроено в 1815–1819 гг. на средства графини Разумовской. Перестраивалась в 1870-е гг. в псевдорусском стиле. Увенчанный куполом световой ротонды одноапсидный бесстолпный храм получил четыре малые главы, составившие с барабаном каноническое пятиглавие. У западных и южных дверей появились два массивных крыльца на фигурных столбах. В убранстве храма широко использованы поливные полихромные изразцы. Особенно щедро они применены на северной паперти, примечательной резными белокаменными столбами, увитыми виноградными лозами. В интерьере сохранились Царские врата XVII века, в правом приделе – иконостас XIX века. Остальное убранство, хоры и настенная живопись – 1950-х годов. В храме три придела: украшенный тремя главками и крыльцом-папертью – святителя Филиппа, митрополита Московского, северный же (левый) – великомученицы Варвары и южный (правый) – апостолов Петра и Павла. Посвящение придела святителю Филиппу связано с тем, что село Лукино в XVII в. принадлежало боярскому роду Колычевых, из которого происходил владыка.
Храм был закрыт с 1930-х годов по 1949 год. С 1952 г. рядом с ним находится резиденция патриарха Московского и всея Руси.
Спаса Преображения на Песках церковь (уничтожена).
Первое упоминание о деревянном храме в этой местности на высоком правом берегу реки Неглинной относится к 1621 г.
Каменная пятиглавая церковь была выстроена в 1657 г.
Шатровую колокольню возвели в 1670-е – 1680-е гг. В 1774 г. в новой трапезной устроили придел Трех Святителей.
По всей видимости, тогда же перестроили и верх храма.
В нем сохранялась икона Спасителя старинного письма, напрестольный серебряный крест XVII века, Требник, пожертвованный в храм в 1684 г.
Храм снесли в середине 1930-х годов, и на его месте выстроили типовое школьное здание, в котором ныне размещается Министерство юстиции РФ (Большой Каретный переулок, дом № 10).
Спаса Преображения на Песках близ Арбата церковь (Старопесковский переулок, дом № 4а).
Современное церковное здание с приделом святителя Николая выстроено в 1706–1711 гг. на месте деревянного храма, выстроенного в стрелецкой слободе в 1639 г. стрельцами полка Тимофея Полтева. Пятиглавный храм с шатровой колокольней представляет собой типичный образец посадских храмов XVII в. Храм имеет перспективные порталы, килевидные кокошники с раковинами, украшен наличниками. Главный престол был освящен во имя Спаса Преображения, а в трапезной создали придел во имя Николая Чудотворца. В 1763 г. в трапезной был устроен придел архангела Михаила. В 1812 г. церковь была разграблена французами и пострадала от пожара. Восстановили ее к 1814 г. Ограду с воротами построили в 1849 г., а в 1891 г. ворота соединили с колокольней парадным порталом с новым большим притвором. Рядом с церковью расположен Пушкинский сквер, созданный Н. Львовым, внуком прославленного архитектора и поэта, в память о том, что А.С. Пушкин жил и часто бывал в этой местности. Церковь изображена на знаменитой картине В.Д. Поленова «Московский дворик» (1878 г.). Храм обладал прекрасными колоколами, в которые звонил знаменитый мастер звона К.К. Сараджев. В конце XIX – начале XX в. трудами настоятеля Сергия Успенского при храме были созданы богадельня, приходская школа, попечительство по борьбе с пьянством. В 1919 г. отец Сергий был арестован и освобожден в 1923 г. по старости. В 1929 г. из закрытой церкви Неопалимой Купины в Зубове в храм Спаса на Песках был переведен племянник и тезка о. Сергия – Сергий Успенский. Позднее, в 1937 г. он был арестован и расстрелян, а в наши дни – причислен в лику священномучеников. Портреты обоих Успенских написал П.Д. Корин при подготовке к созданию монументального полотна «Русь уходящая».
В конце 1920-х гг. закрыли библиотеку и церковно-приходскую школу при храмах, здания, в которых они помещались были отобраны у храма. В 1932 г. церковь закрыли. С 1979 г. по 1990 г. храмовое здание занимало объединение «Союзмультфильм». В 1991 г. храм был передан Церкви. Богослужения возобновились в 1993 г. В 1995 г. началась его полная реставрация, новая роспись храма и иконостас были завершены к Рождеству 2004 года.
Спаса Преображения в Преображенском церковь (уничтожена).
Каменная церковь Спаса Преображения с приделом апостолов Петра и Павла в селе Преображенском, рядом с деревянным храмом была выстроена к 1768 г.
В 1781 г. она перестраивалась. В начале XIX века церковь отличалась крайней бедностью. В 1880-е гг. стараниями купца Ф.Н. Котова и других прихожан храм начали благоустраивать. Второй придел благоверного князя Александра Невского освятили 19 октября 1886 г. Тогда же был перестроен и увеличен Петропавловский придел.
Ремонтные работы также производились в 1902 г. Храм, остававшийся действующим до 6 июля 1964 г., взорвали через четыре дня – в ночь с 10 на 11 июля. На его месте – свободное пространство Преображенской площади.
Спаса Преображения в Пушкарях церковь (уничтожена).
В окрестностях улицы Сретенки в допетровскую эпоху существовало несколько стрелецких слобод, каждая из которых имела свой приходский храм. В Пушкарской слободе, в центре Сретенки и в прилегающих к ней переулках, во 2-й половине XVII века артиллеристы (пушкари) построили почти одновременно две церкви – преподобного Сергия Радонежского и Преображения Господня. Последний был деревянным, и в 1683 г. стрельцы вместо него выстроили каменный храм. Верхние ярусы колокольни были достроены в 1753 г. В XVIII веке в церкви были два боковых придела – Казанской иконы Божией Матери и святителя Николая.
Петровским временем датировались тридцать три иконы. Известный художник М.И. Скотти был автором икон Благовещение Пресвятой Богородицы на Царских вратах, написанной на медной овальной доске, и Распятие Христово на полотне в третьем ярусе пятиярусного иконостаса.
Современники отмечали золоченые бронзовые чеканные Царские врата, на створе которых было выбито: «1807 г. 1 октября». Впечатляло и бронзовое паникадило на 56 свечей, украшенное майоликой. Немалую ценность имели набор богослужебных серебряных сосудов 1820 г. и двадцать книг XVII–XVIII веков из приходской библиотеки.