Приспособленный под склад храм был весь разгорожен на множество помещений-клетушек, которые разобрали к концу 1991 г. В 1991–1993 гг. восстановили перекрытия ярусов в колокольне. В 1998–1999 гг. с северной стороны к зданию пристроили деревянную шатровую часовню-крестильню. В 2000 г. Троицкому храму вернули часть исторической территории, и начались работы по ее благоустройству. Были отмечены памятные места в окрестностях села Голенищева, расчищен святой источник Ионы митрополита, над ним установили крест. К этому источнику, а также к источнику митрополита Киприана у старого моста, ныне совершаются крестные ходы. С западной стороны храма, где в XIX веке существовало кладбище, поставили крест во имя всех мучеников и исповедников Российских. Памятный крест установили также на Трехсвятской горке в четырех километрах от храма, откуда началась история села. Вскоре после обретения мощей святителя Тихона, патриарха Московского и всея Руси, в Троицкий храм была перенесена из Донского монастыря частица святых мощей патриарха Тихона и помещена в икону святителя, написанную к этому дню. Так же в Троицком храме имеются иконы с частицами мощей преподобных Серафима Саровского, Амвросия Оптинского и Сергия Радонежского. Особо чтима икона блаженной Матроны Анемнясевской, по молитвам у которой известны случаи исцеления от бесплодия.
Троицы в Троице-Лыкове церковь (Одинцовская улица, дом № 24).
Село Троицкое-Лыково расположено на высоком берегу Москвы-реки, напротив Серебряного бора. Оно получило свое название в XVII веке по прозвищу первого владельца этих мест боярина Бориса Михайловича Лыкова-Оболенского, родственника царской династии Романовых. В 1610 г., получив поместье, Лыков построил свой усадебный дом на берегу Москвы-реки у деревни Черевково и перенес в усадьбу деревянную церковь в честь праздника Святой Троицы. Каменный Троицкий храм начали возводить в стиле нарышкинского барокко в последние годы XVII в. по заказу и на средства стольника М.К. Нарышкина. Считается, что храм возводил известный строитель той эпохи Яков Бухвостов. В 1708 г. церковь была освящена.
Центральный объем храма подобен по формам церкви Покрова в Филях, за исключением лепесткового плана и увеличенного четверика. Боковой ярусный объем с запада расположен над трапезной, восточный – над алтарем. Обычно храмы нарышкинского типа были краснокирпичными с белокаменным декором. Троицкий же – весь белый. Декоративные детали на стенах были сделаны мастерами наивысшего уровня, которые работали, в частности, на церкви Николы Большой Крест на Ильинке. Троицкую церковь возвели на самом высоком месте берега Москвы-реки и освятили в 1704 г. Занимавший это место деревянный Троицкий храм перенесли в глубину усадьбы и переосвятили в честь праздника Успения Пресвятой Богородицы.
Около 1917 г. в Троице-Лыково была создана Свято-Троицкая женская община. Вначале 1930-х годов Троицкий храм закрыли. В 1979 г. рядом с Троицким-Лыковым вырос микрорайон Строгино, и парк бывшей усадьбы стал местом массового отдыха окрестных жителей. В 1970-1980-е гг. шла длительная реставрация Троицкого храма. В 1990 г. он был передан общине верующих.
Троицы в Троицкой слободе церковь (2-й Троицкий переулок, дом № 6).
Троицкий храм стоит на холме, возвышающемся над Самотечной площадью. Троицкая слобода известны с начала XVII века, когда царь Василий Шуйский подарил Троице-Сергиеву монастырю окрестные земли.
В XVII веке храм был деревянным, с северным приделом преподобных Сергия и Никона Радонежских. Он сгорел в пожаре в 1688 г. Вскоре начали возводить уже каменную церковь. Строили ее в новых тогда архитектурных формах: большой четверик, на котором возвели восьмерик. Строительство закончили в 1696 г., но отделкой занимались до начала XVIII века. Главный престол освятили в 1708 г. В 1726 г. был переложен верх восьмерика и сделана на нем маленькая железная главка. Церковь с трапезной и трехъярусной колокольней имеет декор, выдержанный в традиционных формах конца XVII века. В 1851 г. к Троицкому храму пристроили придел в честь Владимирской иконы Божией Матери. Архитектор А. А. Мартынов поставил его симметрично и абсолютно идентично уже существовавшему северному приделу во имя преподобных Сергия и Никона Радонежских.
На территории подворья Троице-Сергиевой лавры, несколько восточнее Троицкого храма, в 1760-х годах возвели дом архимандрита Троице-Сергиевой лавры. С 1815 г. его занимали московские митрополиты, которые были также настоятелями Троице-Сергиевой лавры. Около сорока лет прожил на Троицком подворье святитель Филарет, митрополит Московский.
Троицкий храм закрыли в 1930-х г.х. В 1979 г. начали его реставрацию. Церковное здание передали Московскому государственному симфоническому оркестру Министерства культуры РСФСР. 24 мая 1993 г. Троицкий храм возвратили Троице-Сергиевой лавре, и здесь было создано подворье лавры. Богослужения в Троицком храме возобновились в сентябре 1993 г.
Троицы в Хохловке, в Старых Садех церковь (Хохловский переулок, дом № 12/14, строение 5).
Каменный храм значится в этой местности с 1657 г. Современное церковное здание сооружено в последние годы XVII в. Постройка началась с северного придела Владимирской иконы Божией Матери. Вероятно, одновременно с ним возвели и трапезную. Колокольня датируется серединой – второй половиной XVIII в., а придел во имя святителя Димитрия Ростовского известен с 1757 г. Апсиду переложили в начале XIX века, в 1890 г. храм обновлялся. Объемно-пространственное решение храма – восьмерик на четверике. Для нарышкинского типа храмов вообще, и для Троицкого в частности, характерно сочетание кирпича и резных белокаменных деталей, хотя здесь декор намного проще. Четверик Троицкой церкви разделен двумя рядами окон, углы отмечают трехчетвертные колонки, собранные в пучки по три и по две и поставленные друг над другом. Тонко разработанный белокаменный карниз четверика скруглен над этими угловыми полуколонками. Большую полукруглую алтарную апсиду, по ширине равную основному объему, перестроили в начале XIX века, обработав в ампирных формах, и поэтому она отличается большой сдержанностью декора, который заключается в выделении белым цветом верхней оконной перемычки и замкового камня.
Храм увенчан кирпичной главкой. Такая же главка венчает северный придел. Грани светового восьмерика, но не все, прорезаны широкими окнами, обрамленными наличниками на тонких вытянутых колонках, со сложными криволинейными завершениями разорванных фронтончиков. Подобные наличники обрамляют и окна нижнего яруса, но сложность их рисунка как бы нарастает снизу вверх. В глухих восьмериках только отмечен простой белокаменный профиль предполагаемого места окна. Ребра всех восьмериков подчеркнуты тонкими полуколонками. Грани восьмерика завершались гребешками, но в XVIII веке, при изменении кровли, их уничтожили, остались только основания. Предполагают, что автором полихромных поливных изразцов, украшающих верх восьмерика, мог быть Степан Полубес. В целом же декор отличается сдержанностью и гармоничностью. Сейчас фасады церкви покрыты матово-розовой краской, на фоне которой особенно эффектно и тонко выделяется белый декор.
Двухъярусная колокольня (у входа в трапезную, с запада) не имеет таких гармоничных пропорций и является памятником другой эпохи и стиля, но осуществляет необходимую связь высокой и стройной церкви с окружающим пространством. Благодаря общему цветовому решению храм и звонница представляют собой единый ансамбль. Храм имел оригинальный иконостас середины XVIII века, деревянная посеребренная резьба изображала ниспадающие складки ткани.
В начале XX в. на территории, принадлежащей храму, юго-восточнее от него, выстроили большой трехэтажный дом, на первом этаже которого жил причт, а квартиры в верхних этажах сдавали в наем. Нет точной даты закрытия храма, но известно, что долгое время он стоял разоренный, обезглавленный, заброшенный. С конца 1960-х годов началась реставрация, к 1983 г. восстановили основной объем, наличники и поставили ажурный крест. В 1992 г. храм передали братству Святого Владимира и освятили.
Троицы при Черкасской богадельне церковь (Ленинградский проспект, дом № 16).
Правая сторона Петербургского шоссе после строительства Триумфальных ворот у Тверской заставы была выделена под застройку частным лицам. Один из участков под старым № 28 приобрели князья Черкасские. В 1857 г. Н.А. Черкасская основала богадельню для женщин, разместившуюся в деревянном усадебном доме. Вскоре к зданию пристроили со стороны двора каменную Троицкую церковь. Кубический объем храма, к которому с востока примыкают две полуциркульные апсиды, выстроен в классических формах. В 1882 г. богадельня перешла в ведение Императорского Человеколюбивого общества. 15 октября 1888 г. состоялось освящение придела святителя Николая. В 1893 г. выстроили звонницу и каменную паперть. Сохранившийся до наших дней архитектурный комплекс богадельни был создан в период с 1898 по 1902 год.
В 1898 г. И.П. Машков, состоявший архитектором Императорского Человеколюбивого общества в 1895–1913 гг., начинает перестройку богадельни, превратив ее в течение ряда лет в живописный ансамбль, выдержанный в модном тогда стиле русской архитектуры XVII в. Первым зданием, выстроенным во владении общества, стал каменный корпус Черкасской богадельни с примыкавшей к нему церковью. 26 ноября 1901 г. освятили богадельню для неизлечимых хроников имени А.С. Спиридонова, выстроенную на средства его вдовы В.Б. Спиридоновой. Оба корпуса разместились в глубине двора, по сторонам въездной аллеи: справа – Черкасская богадельня, слева – Спиридоновская. В том же 1901 г. при богадельне выстроили здание женского ремесленного училища (архитектор Ф.Ф. Воскресенский). В Черкасской богадельне призревалось 72 «лица женского пола всякого звания», из которых 32 – бесплатно. Спиридоновская богадельня была рассчитана на 15 мужчин и 15 женщин.
Двухэтажные кирпичные здания с нарядным силуэтом разновысоких завершений, с обилием декоративных деталей были выдержаны в традиционном для построек такого рода русском стиле. Ансамбль зданий обнесли глухой кирпичной оградой, сохранившейся по правой границе владения, парадный въезд со стороны Петербургского шоссе оформили нарядными въездными воротами.