В ночь на 3 ноября Энвер-паша, Талаат-паша, Джемаль-паша и несколько других видных младотурок сели на германский военный корабль и отплыли из Стамбула в Одессу, еще занятую австро-германскими войсками, а оттуда – в Германию.
7 ноября, в связи с окончанием войны, группа армий «Йылдырым» и 7-я армия были расформированы. Кемаль остался командующим 2-й армией и вернулся в Константинополь. Великий визирь Ахмет Иззет-паша предписал ему не препятствовать продвижению английских войск и предложил вернуться в Стамбул. Но Кемаль отказался брать на себя ответственность за возможную британскую оккупацию турецкой территории, подал в отставку и возвратился в столицу. В тот же день, 8 ноября, под давлением союзников ушел в отставку Иззет-паша, которого обвинили в том, что он позволил бежать вождям младотурок.
Во время отступления к Алеппо Кемаль оставался в контакте со своими друзьями и был в курсе того, что происходит в Стамбуле. Когда 10 октября рухнуло правительство партии «Единение и прогресс», Кемаль был слишком занят отступлением и никак не мог немедленно войти в правительство, которое сформировал Ахмет Иззет-паша. Напрасно Кемаль просил зарезервировать за ним место в кабинете. Вот Рауф и Фетхи вошли в правительство, но националисты все равно не смогли убедить Иззета не принимать соглашения о перемирии. Когда Кемаль 3 ноября смог наконец ознакомиться с полным текстом соглашения о перемирии, он пришел в ярость от его условий, передающих союзникам контроль над всеми ключевыми пунктами страны, включая Стамбул, Дарданеллы, Киликию и Мосул, а также над туннелем Позанти в Адане. Кемаль направил в Стамбул телеграммы протеста и утверждал, что будет сопротивляться, если британские войска попытаются захватить Искандерун. Иззет, однако, приказал ему оставить Искандерун без боя, принял его отставку, а затем и сам ушел с поста премьер-министра. 10 ноября Кемаль сдал командование 2-й армией и поездом из Аданы отправился в Стамбул.
10 ноября 1918 года Кемаль-паша покинул Адану, столицу Киликии, и отправился в Стамбул. 13 ноября паша сошел на перрон вокзала Хайдарпаша на азиатском берегу Босфора и увидел столицу под прицелом орудий противника. Флот союзников прибыл в тот же день в Стамбул и встал на якоре в Босфоре, направив свои пушки на дворец султана. Повернувшись к своему адъютанту, Кемаль прошептал: «Они уйдут так же, как и пришли». И ведь не ошибся. Эти слова свидетельствовали о решимости уже тогда «начать великую борьбу» с интервентами.
Кемаль остановился в «Пера Паласе», одном из лучших отелей Стамбула. Там с ним беседовал корреспондент французской газеты «Тан» и описал Кемаля как «мужчину с несколько асимметричным взглядом и каракулевой папахой на голове». Он мрачен и молчалив, но взгляд его таков, что создается ощущение, что перед тобой «или безумец, или гений».
Из отеля Кемаль перебрался в собственный дом в районе Шишли на севере города. Кемаль безуспешно пытался получить в Стамбуле какую-нибудь командную или штабную должность. Ему не удалось также заручиться поддержкой правительства в деле противодействия иностранной военной интервенции. В это время началась охота за Энвером, Талаатом, Джемалем и другими бежавшими из Турции лидерами «Единения и прогресса» как за военными преступниками. Турецкое правительство, дабы угодить союзникам, согласилось с их обвинениями вождей младотурок в организации геноцида армян и плохого обращения с военнопленными. Несколько друзей Кемаля арестовали в рамках этой кампании, но сам он избежал преследования. Неизвестно, планировали ли союзники его арестовать. Во всяком случае, хотя Кемаль и был видным членом партии «Единение и прогресс» и активным националистом, его имя никогда не ассоциировалось ни с какими преступлениями периода Первой мировой войны, в том числе и с геноцидом армян, хотя ему и пришлось воевать на Кавказе.
Кемаль утверждал, что хотел сразу создать организацию национального сопротивления в Анатолии. По прибытии в Стамбул он, сопровождаемый Рауфом, встречается с Иззетом. Перед уходом в отставку бывший великий визирь пригласил нескольких молодых энергичных офицеров, включая Кемаля, вернуться в столицу. Но встреча Кемаля с маршалом началась плохо, хотя Иззет его очень ценил. Кемаль упрекал маршала в том, что тот ушел в отставку. Иззет, как утверждал Кемаль, в конце концов признал свою ошибку в том, что ушел в отставку под давлением союзников. Кемаль предлагал ему вернуться и возглавить правительство, включив туда тех министров, которых ему он, Кемаль, порекомендует.
Кемаль считал, что достаточно будет, чтобы преемник Иззета не получил поддержку парламента, и тогда Иззет вновь займет кресло великого визиря. Он вспоминал: «Я говорил с депутатами, которых знаю уже давно. Я хотел установить контакт с максимальным числом парламентариев. Я был в здании парламента, во дворце Фындыклы, одетый в штатское… Я хотел, чтобы парламент не выразил вотума доверия новому великому визирю… Я сделал всё возможное, чтобы убедить в этом моих знакомых депутатов. Однако они считали, что парламент будет распущен, если они не проголосуют за доверие. Я же им объяснял, что в любом случае парламент будет распущен и что следовало выиграть время с новым кабинетом Иззета». Но подавляющим большинством голосов парламент выразил доверие преемнику Иззета, рассчитывая таким образом продлить и собственное существование.
Как отмечал Фетхи в своих «Мемуарах», Кемаль все же не рассматривал всерьез вариант с возвращением к власти Иззета-паши: «Иззет-паша, даже если бы он остался у власти, не смог бы сопротивляться давлению оппозиции, и султан все равно убрал бы членов “Единения и прогресса” из правительства».
В течение трех ночей Фетхи, Рауф и их друзья собирались в доме Исмаила Канболата, бывшего префекта полиции, бывшего губернатора Стамбула и бывшего министра внутренних дел, «человека умного и отважного», по признанию Кемаля. Как отмечали англичане, младотурки еще были сильны «в администрации, армии и полиции». Тайная организация младотурков «Каракол» («Часовой») была создана в ноябре 1918 года такими убежденными деятелями движения, как Кара Кемаль, возглавлявший организацию «Единения и прогресса» в Стамбуле, дядя Энвера-паши Халиль-паша и полковник Кара Васыф. Сначала «Каракол» помог бежать тем, кто был ответствен за геноцид армян, а затем стал переправлять оружие и боеприпасы в Анатолию. «Мы сообща решили, – вспоминал Фетхи, – что только в Анатолии можно организовать национальное сопротивление».
Мустафа Кемаль-паша встречался с Карой Кемалем, одним из руководителей общества «Каракол» – секретной разведывательной организации, созданной руководством иттихадистов в Стамбуле в конце октября 1918 года. Эта организация помогала кемалистам, снабжая оружием возникавшие группы сопротивления. 16 марта 1920 года, после оккупации Стамбула, её руководители были арестованы, и организация фактически перестала существовать. Одновременно Кара Кемаль управлял стамбульским отделением формально ликвидированной партии «Единение и прогресс». На одной из таких встреч Кара Кемаль предложил даже организовать похищение великого визиря Ахмеда Тевфика-паши, но оно не было принято.
Кемаль формально оставался в распоряжении военного министерства. Он много встречался с видными политиками, депутатами парламента и был принят султаном. Вахидеддин принял Кемаля, и они беседовали с глазу на глаз в течение часа. Кемаль вспоминал, будто султан заявил: «Я уверен, что генералы и офицеры тебя очень любят. Можешь ли ты дать гарантии, что они ничего не предпримут против меня?» Кемаль в ответ заявил, что совсем недавно прибыл в столицу и ничего не слышал о заговоре. Но султан настаивал. И Кемаль, не моргнув глазом, заявил: «Я могу вас заверить, что вам нечего опасаться». Но султан совсем не был в этом уверен, особенно применительно к ближайшему будущему. А в конце беседы султан едва ли не с мольбой сказал: «Вы умный офицер, и я уверен, что вы сумеете просветить и успокоить ваших товарищей».
В конце 1918 года Кемаль еще несколько раз был во дворце как адъютант султана. Согласно записям императорского камергера, Кемаль встречался с Мехмедом VI 15 и 29 ноября и 20 декабря. Ходили даже слухи о браке Кемаля с любимой дочерью султана принцессой Сабихой, но вряд ли они имели под собой хоть какое-то основание.
Союзники оккупировали столицу и проливы под предлогом необходимости наблюдать за демобилизацией турецкой армии. Последняя была сокращена до 20 кадрированных пехотных дивизий общей численностью не более 50 тыс. человек и с очень ограниченным количеством тяжелых вооружений. Союзники отняли у Оттоманской империи Аравию, Йемен, Палестину, Сирию, Ливан, Трансиорданию и Ирак. Итальянцы, греки и армяне претендовали на различные терртории в Анатолии, а бессильные султанские правительства, сменявшие друг друга, не могли защититься от этих притязаний. Офицеры-националисты решили защитить Турцию от распада и гибели, а Кемаль, как самый искусный и популярный турецкий полководец, закономерно стал их лидером.
Через три дня после окончания войны и в нарушение положений Мудросского перемирия британская армия оккупировала Александретту и окружающую ее территорию, а также Мосул. Англичане потребовали немедленной демобилизации, перемещения артиллерии и продовольственных баз и ухода турецких войск из указанных районов до 15 ноября.
Правительство в Стамбуле пыталось протестовать, но безуспешно. Из Аданы Кемаль протестовал с явной издевкой: «Я должен заявить, что лишен деликатности, позволяющей понять и оценить как джентльменский поступок английского представителя, так и необходимость отвечать на него ожидаемой любезностью». Почти каждый день Кемаль отправлял телеграммы в Стамбул, гневно осуждая поведение англичан и предлагая сопротивляться. Но Иззет-паша не поддержал его и ушел в отставку. Надо сказать, что почти все время своего 25-дневного правления Иззет проболел «испанкой» и был лишен возможности активно участвовать в государственных делах.
В конце ноября правительство под влиянием либералов и давлением союзников создало военные трибуналы для суда над лидерами «Единения и прогресса». Энвер и Джемаль, сбежавшие в Германию, были лишены армейских званий. В Германию был послан запрос на их экстрадицию, который никто не стал исполнять.