Германское командование, ожидая выхода войск 3-го Украинского фронта на болгаро-югославскую границу не ранее 10 октября, решило сорвать планомерность этого оперативного маневра. С этой целью немецкие войска 25 сентября в излучине Дуная, в районе Турну-Северина, нанесли сильный удар по соединениям 2-го Украинского фронта, потеснили их, вышли к реке (Дунаю) и создали серьезную угрозу плацдарму 75-го стрелкового корпуса на Дунае. Чтобы помочь правофланговому соседу, командующий 3-м Украинским фронтом Маршал Советского Союза Ф. И. Толбухин решил, не дожидаясь сосредоточения всех сил 57-й армии, 28 сентября нанести контрудар по противнику уже вышедшим на болгаро-югославскую границу 68-м стрелковым корпусом и совместно с 75-м стрелковым корпусом уничтожить его. Ставка ВГК одобрила это решение и для надежности его реализации передала 75-й стрелковый корпус в состав армии генерала Н. А. Гагена, обязав последнего разгромить противника в районе Неготина и овладеть рубежом Дони Милановац, Заечар.
113-я и 93-я стрелковые дивизии 68-го стрелкового корпуса получили приказ ударом в северо-западном направлении овладеть опорными пунктами врага в Кобишнице и Неготине, установить тактическое взаимодействие с 75-м стрелковым корпусом и совместно с его 299-й стрелковой дивизией генерал-майора Н. Г. Травникова и Дунайской военной флотилией уничтожить группировку противника в районе населенных пунктов Неготин и Штубик. 223-я стрелковая дивизия полковника А. Г. Сагитова, наступавшая на левом фланге корпуса, должна была в это время очистить от противника узлы дорог Рготина, Слатина, перехватить дороги, идущие с юга от Заечара, и воспретить таким образом подход резервов противника в район Неготина. К исходу 2 октября частям 75-го и 68-го стрелковых корпусов надлежало прочно овладеть рубежом Дони Милановац, Клокочевац, Поповица, Табаковец и далее по реке Тимок до Заечара. 64-й стрелковый корпус сосредоточивался в это время в районах юго-восточнее Заечара в готовности нанести удар в направлении Заечар, Вратарница.
Наступление правофланговых корпусов поддерживала авиация 17-й воздушной армии, базирующаяся на населенный пункт Лом. Авиации Софийского аэродромного узла предстояло обеспечивать боевые действия 64-го стрелкового корпуса. 13 сентября 1944 года Ставка ВГК дала указание перебазировать в район Софии часть сил 17-й воздушной армии. Им предстояло прикрыть болгарскую столицу с воздуха и во взаимодействии с наземными войсками воспрепятствовать вторжению в Болгарию немецких соединений из Греции и Югославии.
Приграничное сражение. В ночь на 28 сентября 1944 года войска 3-го Украинского фронта пересекли болгаро-югославскую границу и вступили на землю Югославии. С наступлением темноты передовой отряд 113-й стрелковой дивизии полковника Л. Ш. Мухамедьярова покинул село Брегово и двинулся к пограничной реке Тимок. Рассеяв немногочисленные патрули противника, подразделения переправились через реку вброд и вскоре заняли станцию Мокраня. Однако дальнейшее продвижение из-за сильного огня пришлось приостановить. Утром в район Брегово подошли главные силы этой дивизии. В полдень 28 сентября после короткого, но мощного артиллерийского налета части 113-й стрелковой дивизии перешли в наступление в направлении населенных пунктов Кобишница и Неготин. Совершив обходный маневр и полуокружив гарнизон в Кобишнице, два полка дивизии сломили сопротивление противника и к исходу дня овладели этим опорным пунктом.
Освободив Кобишницу, советские войска устремились к Неготину. Германское командование, придавая этому городу большое значение как крупному узлу дорог и важному опорному пункту, прикрывающему правый фланг и тыл ударной немецкой группировки в большой излучине Дуная, стремилось любой ценой удержать его в своих руках. Получив сведения о начале наступления советских войск с рубежа реки Тимок, оно начало спешно перебрасывать в район Неготина крупные подкрепления. Авиаразведка доносила, что колонны войск противника непрерывно идут с севера и юга. Фронтальная атака города могла привести к излишним потерям и снижению темпов наступления. Поэтому было решено обойти город с северо-запада и овладеть им комбинированной атакой с двух сторон. Одновременно Дунайская флотилия под командованием контр-адмирала С. Г. Горшкова должна была высадить десант в тылу врага, в порту Радуевац, а затем совершить нападение на Неготин с этого направления. Если десант удастся, было намечено высадить десант у Прахово и воспрепятствовать отходу противника из Брза-Паланки на юг.
Для обеспечения наступления привлекались восемь артиллерийских полков, штурмовая инженерная бригада, два полка гвардейских минометов. К району боевых действий подошли главные силы Дунайской военной флотилии. Кроме того, командующий 3-м Украинским фронтом Маршал Советского Союза Ф. И. Толбухин получил указание Ставки для разгрома группировки противника в районе Неготин, Дони Милоновац привлечь две трети авиации фронта, а также 236-ю истребительную и 10-ю гвардейскую штурмовую авиационные дивизии, предназначенные для передачи Народно-освободительной армии Югославии.
В ночь на 29 сентября десантный отряд, сформированный из состава Керченской бригады речных кораблей, подошел к устью реки Тимок и принял на борт бронекатеров автоматчиков из 93-й стрелковой дивизии, которой командовал полковник С. В. Салычев. Общее руководство высадкой десанта в Радуеваце возлагалось на командира бригады Героя Советского Союза капитана 2-го ранга П. И. Державина. Командиром высадки был назначен командир 1-го гвардейского дивизиона бронекатеров капитан-лейтенант С. И. Барботько.
Десантный отряд в 03.00 двинулся вверх по Дунаю и через час достиг пункта высадки. Под прикрытием огня корабельной артиллерии автоматчики внезапно атаковали Радуевад и вскоре овладели им. С рассветом десантники развернули наступление, обходя Неготин с северо-востока. Воспользовавшись успехом десанта и замешательством противника, в наступление перешли главные силы 68-го стрелкового корпуса, которые стали обходить Неготин с севера и юга. Во второй половине дня сопротивление противника усилилось. Перебросив часть сил из района Брза-Паланка, Каменица, германское командование предприняло контратаки, сдерживая продвижение советских войск. Однако, усилив свою неготинскую группировку, противник ослабил нажим на подразделения 75-го стрелкового корпуса, которые вскоре восстановили положение и развернули наступление навстречу частям 68-го стрелкового корпуса.
К полудню 30 сентября части 113-й стрелковой дивизии подошли к окраине Неготина. Командир дивизии полковник Л. Ш. Мухамедьяров решил перед штурмом города уточнить группировку неприятеля и расположение его огневых средств. Разведгруппа 1292-го стрелкового полка во главе с опытным разведчиком Б. М. Носовым скрытно проникла в город, собрала ценные сведения о противнике и, захватив трех пленных, возвратилась в свою часть. Эти сведения помогли артиллеристам и летчикам подавить огневые средства врага.
Неоценимую помощь частям дивизии оказали бойцы и офицеры 1202-го самоходно-артиллерийского полка. В уличных боях за Неготин экипажи самоходных установок сопровождали атакующую пехоту как танки непосредственной поддержки, ведя за собой стрелковые подразделения от одного квартала к другому. К исходу дня части 68-го стрелкового корпуса во взаимодействии с 75-м стрелковым корпусом, Дунайской военной флотилией и 1-м батальоном 9-й бригады 23-й ударной дивизии Народно-освободительной армии Югославии овладели городом Неготин. Корпуса соединили свои фланги и получили возможность развивать наступление совместными усилиями.
Одновременно с боями за Неготин части левофланговой 223-й стрелковой дивизии 68-го стрелкового корпуса форсировали реку Тимок и завязали бои за село Рготина, с овладением которым открывался путь в долину реки Велика Морава. Село Рготина расположено на перекрестке шоссейных дорог, ведущих к Жагубице, Неготину и Заечару. Германское командование, придавая важное значение удержанию Рготины, сосредоточило в нем крупный гарнизон — около 500 человек, четыре штурмовых орудия, два средних танка, несколько бронетранспортеров, значительное количество артиллерии. На перекрестках дорог были сооружены ДЗОТы.
Командир 223-й стрелковой дивизии полковник А. Г. Сагитов решил охватывающими ударами двух полков с севера и юга окружить и уничтожить противника в этом опорном пункте. Успех боя обеспечил командир 1041-го стрелкового полка майор Мехтиев, который сумел в ночь на 1 октября скрытно сосредоточить свои подразделения севернее Рготины. На рассвете два батальона полка с севера и востока ворвались в село и во взаимодействии с другими частями дивизии к исходу дня освободили этот важный узел дорог.
Германское командование после потери Неготина стало отводить свои войска на линию Дони Милановац, Клокочевац, Ябуковац, Заечар. Одновременно в район Заечара оно начало спешно стягивать новые части 1-й и 7-й горнострелковых дивизий, спецдивизии «Бранденбург», готовя контрудар по левому флангу 57-й армии.
Командующий армией, учитывая выгодную конфигурацию линии фронта, образовавшуюся в результате выхода частей 75-го и 68-го стрелковых корпусов на линию Тополница, Ябуковац, западнее Неготина, Рготина, решил прижать штубик-клокочевацкую группировку противника к хребту Дели Иован и уничтожить ее. Одновременно левофланговые соединения получили задачу разгромить с помощью частей 14-го корпуса Народно-освободительной армии Югославии врага в районе Заечар, Слатина, Брестовац, Бор и обеспечить таким образом перегруппировку основных сил армии на направление главного удара.
75-й стрелковый корпус, усиленный пятью артиллерийскими полками, получил задачу нанести удар своим правым флангом, овладеть рубежом Дони Милановац, Милошева Кула, Црнайка, Плавна и перерезать пути отхода противника на запад. 68-й стрелковый корпус с шестью артиллерийскими полками своими двумя правофланговыми дивизиями во взаимодействии с частью сил 75-го стрелкового корпуса должен был освободить населенные пункты Штубик, Трняне и изолировать таким образом немецкую группировку, действовавшую восточнее хребта Великий Крш. Левофланговая дивизия корпуса овладев