Ли снова на мгновение увидел Джексона, когда тот уезжал со своим штабом, и остановился, чтобы перекинуться с ним парой слов.
Ли больше никогда не увидит Джексона живым.
В течение всего дня 2 мая Ли полагался на два предположения: первое - Хукер не сможет обнаружить, что в его центре находятся 14 000 солдат, а второе - корпус генерал-майора Джона Седжвика во Фредериксбурге останется бездействующим. Оба варианта были дикой авантюрой, но они оправдались. Хукер не предпринял никакой попытки наступать на Ли, а приказы, которые он телеграфировал Седжвику, были настолько беспорядочными, что Седжвик решил подождать с развитием событий. Его дар принимать неудачные решения в бою был уже хорошо известен. Позже он закончит свою жизнь одной из самых известных реплик Гражданской войны. Обращаясь к своим людям, которые уклонялись от огня снайпера, он сказал: "Мне стыдно, что вы так уклоняетесь, ведь они не могут попасть в слона на таком расстоянии", и был убит пулей в лоб. 2 мая решение Седжвика о том, что двусмысленные приказы Хукера оставляли за ним право решать, атаковать или нет, спасло Ли от поражения с тыла еще до того, как фланг Джексона атаковал противника.
Суждения Ли о своем противнике были настолько же верными, насколько ошибочными были суждения Хукера. К середине утра командующий войсками Союза получил информацию о движении конфедератов справа от него, но по причинам, известным только ему самому, решил, что это доказательство того, что конфедераты отступают. Хукер приказал своим войскам атаковать, но без чувства срочности, возможно, думая, что ускорит отступление конфедератов. Кроме того, к середине утра в Кэтрин Фернэйс завязался ожесточенный и неприятный бой, охвативший тыловое охранение Джексона, Двадцать третью пехоту Джорджии. На помощь джорджийцам были отправлены подкрепления, но они не успели предотвратить окружение и подавление большинства из них.
Если бы Хукер правильно представлял себе ситуацию, он мог бы понять, что, хотя его правая сторона находится в смертельной опасности, смелая атака на центр Конфедерации, учитывая ее слабость в численном отношении, все равно может привести к успеху. Но он был обездвижен масштабами и сложностью сражений и не мог составить четкого представления о том, что происходит на самом деле. Хотя он и предупредил генерал-майора Оливера Говарда о том, что на него могут напасть, он не передал никакого чувства срочности или тревоги. Он так и не удосужился проехать три четверти мили к юго-востоку и посмотреть своими глазами, что делает Говард.
В 14:00 Фицхью Ли доложил Джексону, что нашел холм, с которого открывается панорамный вид на правую часть армии Союза. По тону Фицхью Джексон понял важность этого открытия, потому что он остановил свою колонну и последовал за Фицем через густой лес к частично расчищенному холму. К своему облегчению, Джексон увидел, что люди Говарда отдыхают, их оружие аккуратно сложено, видимо, не зная, что менее чем в полутора милях от них маршируют более 20 000 солдат Конфедерации, а также большая часть кавалерии Стюарта. Джексон был настолько восхищен этим зрелищем, что решил провести своих людей на две мили дальше и атаковать войска Говарда сзади, что означало, что он сможет провести свою атаку только после пяти часов.
Как и при Шилохе, первым предупреждением людей Говарда о готовящейся атаке стало внезапное появление запаниковавших диких животных, выходящих из Дикой местности, когда линия конфедератов продвигалась через лес. Мгновением позже люди Джексона "выскочили из леса с криками "Rebel Yell"". Как написал Ли в своем отчете, "позиция за позицией были захвачены, пушки захвачены, и все попытки врага сплотиться были разбиты стремительным натиском наших войск". Сначала это был разгром, приведший к фактическому краху правой части войск Союза, но, хотя Джексон надеялся отбросить федеральные войска в беспорядке до форда Соединенных Штатов в четырех милях, офицеры Союза наконец начали сплачивать своих людей, в то время как войска Конфедерации, измотанные четырнадцатимильным маршем, были не в состоянии поддерживать первоначальный темп своего продвижения. Хотя Джексон отбросил федералов более чем на милю назад, он не смог ни взять Чанселлорсвилл, ни прорваться через оставшиеся линии войск Союза, чтобы соединиться с Ли. Несмотря на гениальность его успешного флангового марша, который во многом стал высшей военной точкой Конфедерации, его победа была скомпрометирована промедлением. Он оптимистично сказал Ли, что начнет атаку в 4 утра, но на самом деле выступил только после 7 утра. Его решение последовать совету Фицхью и продвинуться дальше на запад, хотя и было тактически верным, стоило ему еще двух часов. Когда он все-таки начал атаку, до рассвета оставалось всего два часа. По мере того как сопротивление федералов усиливалось, Джексон начал беспокоиться, что его атака может зайти в тупик и что он все еще сильно уступает в численности. Он поскакал вперед по Планк-роуд далеко впереди своих людей, чтобы оценить возможность ночной атаки. Джексон уже предлагал такую атаку во Фредериксбурге, добавив, что "нам всем следует раздеться догола", чтобы избежать путаницы, которая является бичом всех ночных военных атак. Ли отверг эту идею как слишком рискованную и, возможно, эксцентричную, но мысль о ночной атаке явно не покидала его. 2 мая она могла сработать, поскольку было полнолуние.
Возвращаясь с разведки, Джексон и его помощники были приняты своими же солдатами за федеральную кавалерию и обстреляны. Некоторые солдаты из Северной Каролины зарядили "buck and ball" - шары 69-го калибра, в которых было три картечины - грозный заряд на коротких и средних дистанциях. Джексон был ранен в три места, два шарика раздробили его левую руку выше и ниже локтя. Малыш Соррел, отреагировав на внезапный шум и вспышку, бросился бежать, и его всадник был сбит на землю низко нависшей веткой. Джексон был лишь оглушен падением, и ни одно из его ранений не представляло угрозы для жизни, но левую руку пришлось ампутировать. Началась пневмония. Через восемь дней он умер.
Если бы Джексон выступил в 4 утра, как он сказал Ли, и если бы он не выбрал, по предложению Фицхью, более длинный маршрут, который добавил два часа к его маршу, у него было бы больше дневного времени, чтобы встретиться с Ли. Это, конечно, избавило бы его от необходимости ехать впереди своих линий в темноте.
Для Ли это было "несчастьем первого порядка": Джексон был, безусловно, его лучшим генералом. Меньшая проблема заключалась в том, что Джексон, как обычно, никому не сообщил о своем плане. Собирался ли он утром продвинуться на север и отрезать армию Хукера от Форда Соединенных Штатов или перегруппировать свои разрозненные части и атаковать у Оранж-Пайк, а затем снова соединиться с Ли?
Сам Ли 2 мая провел серию мелких атак на центр Хукера, чтобы отвлечь его внимание вправо, и услышал "громогласный рев атаки Джексона" только в сумерках. Артиллерийский залп за залпом озарял ночное небо, а мушкетная стрельба была слышна до одиннадцати часов. Однако новостей с поля боя не поступало, и Ли в конце концов прилег отдохнуть на небольшой поляне. "Около 2:30 его разбудил Тейлор, разговаривавший с одним из сигнальщиков Джексона, капитаном Уилборном, который рассказал о необычном фланговом марше своего командира, закончившемся тем, что Джексон был ранен своими же людьми.
Ни у Уилборна, ни у Ли не было причин предполагать, что раны Джексона окажутся смертельными, но Уилборн позже писал, что Ли "громко застонал" от этой новости и "казалось, вот-вот разрыдается". Тем временем левое крыло его армии осталось без командующего, за исключением А. П. Хилла, с которым Джексон не поделился своими планами. Вскоре после этого Хилл был ранен, и командование принял Джеб Стюарт, который был генерал-майором на месте. В 3 часа ночи Ли написал Стюарту письмо, призывая его наступать "с максимальной энергией" и "лишить" противника Шанселорсвилля, "что позволит объединить всю армию".
Для Ли было очевидно, что "славная победа", одержанная Джексоном 2 мая, теперь находится на волоске. Хукер был сильно потрепан, но у него все еще было 76 000 человек против 43 000 у Ли; его центр и левый фланг были хорошо окопаны, и любая попытка выбить его оттуда должна была быть кровавой.
Рана Джексона продолжала беспокоить Ли. Он позвал Тревеллера, но как только тот сел на коня, появился Хотчкисс с очередным докладом. Ли терпеливо слушал, пока Хотчкисс не описал рану Джексона, и тогда Ли мягко заставил его замолчать: "Я знаю об этом все и не хочу больше слушать - это слишком болезненная тема". Ли было ясно, что ему и Стюарту придется пробиваться вперед, чтобы соединить два крыла армии. Если этого не сделать, то предыдущая победа Джексона станет бессмысленной. В этом Ли помогла еще одна ошибка Хукера, который отвел свои артиллерийские батареи с возвышенной поляны, с которой открывалось прекрасное поле для обстрела как с запада, так и с востока. Пехоте Конфедерации было бы трудно или даже невозможно взять ее, если бы Хукер решительно удерживал ее.
Теперь линия войск Союза представляла собой подкову вокруг Чанселлорсвилла и прямую линию, идущую от него к Раппаханноку. Около пяти тридцати утра следующего дня Ли и Стюарт одновременно атаковали обе стороны подковы, и это был один из самых тяжелых боев за всю войну. Ли оставался в гуще событий, хотя и не мог знать, что пушечное ядро конфедератов попало в колонну дома в Чанселорсвилле, к которой прислонился Хукер. Большая часть ядра "с силой" упала на голову Хукера, лишив его сознания. Хукер отказался от командования, вероятно, потому, что ему не нравился его второй командир, генерал-майор Коуч. Именно Коуч заявил, что Хукера "выпороли" еще до начала сражения. Возможно, поэтому к десяти часам утра он отвел свои артиллерийские батареи с Фэрвью-Хилл, фактически отказавшись от попыток удержать Чанселорсвилл, и тем самым обрек свою армию на паническое бегство к дальнему берегу Раппаханнока. Менее чем за пять часов обе стороны понесли потери, которые уступали только потерям при Антиетаме: более 17 000 союзников и более 13 000 конфедератов, но Ли достиг своей цели и выиграл то, что Фуллер назвал "идеальным сражением". Также в 10 часов утра две части армии Ли соединились в пределах видимости от таверны "Чанселорсвилл". Ли выехал вперед на "Тревеллере" под бурный прием, описанный майором Чарльзом Маршаллом, его военным секретарем: