ЧК всячески стремилась контролировать бывшие офицерские кадры оказавшиеся в Одессе, что являлись перманентной угрозой для большевистского режима в городе. Несколько раз объявлялись сроки, когда все бывшие белогвардейские офицеры должны были пройти регестрацию, объявлялись страшные кары для ослушников этих приказов. Но регистрировалась обычно только 1/3 бывших офицеров. К. Паустовский считал, что в Одессе и на окраинах города «застряло около семидесяти тысяч деникинских офицеров и солдат. Союз ники рассчитывали, опираясь на них, поднять в Одессе восстание.»
Беспокоили чекистов и одесситы — рабочие самого крупного в Одессе предприятия — судоремонтного завода «РОПИТ». На заводе началась забастовка, в ходе которой чекисты обнаружили не только «подпольную антисоветскую организацию», «антисоветскую литературу», но и тайный склад оружия и взрывчатки. По решению Одесского губкома КП(б)У «РОПИТ» временно закрыли, большенство рабочих — забастовщиков уволили, «подозрительных» рабочих отправили в концлагерь. Вместо кадровых рабочих власти набрали «абсолютно надежных рабочих и служещих». Благо было из кого выбирать — в Одессе тогда было зарегистрировано на Бирже Труда более 40 тысяч безработных (практически каждый 10-й житель).
Огромный дом на Маразлиевской, где размещалось в 1920 г. ГубЧК (одной стороной выходил на Канатную 29) наводил ужас, не только на потенциальных жертв «карательных органов», но даже на обыкновенных, ни в чем не «замешанных» прохожих.
За 1920 г. одесской ЧК были арестованы 10–13 тысяч человек, из которых расстреляны ок 1500 человек. В то же время эмигрантский историк С. Мельгунов считает, что только в 1920 году в Одессе карательными советскими органами, были уничтожены до 7 тысяч человек. Надо отметить, что уничтожали не только Одесская ЧК, но и Ананьевская, Балтская уездные ЧК, 26-я и 31-я отдельные чекистские бригады, которые стояли под Одессой.
В Одессе на територии бывшего Одесского кадетского корпуса был создан концлагерь для «политических и заложников». Еще один концлагерь для жителей Одессы и пригородов был организован в Березовке.
Масштабы «красного» террора настолько поразили Одессу, что рабочая конференция Одессы потребовала ликвидировать ЧК, а одесский губком требовал от «Центра» ограничить ее влияние и немедленно поставить под партийный контроль. В то же время А. Луначарский, который тогда находился в Одессе, написал из Одессы письмо В. Ленину с предложением о том, что бы «т. Дзержинский приехал в Одессу и поддержал своим огромным авторитетом местную ЧК».
В подвалах одесского ЧК на Маразлиевской «отсидел» будущий классик советской литературы Евгений Котаев. Еще в 1915 г., не окончив гимназии, 18-летний Е. Катаев попал добровольцем — вольноопределяющимся на фронт первой мировой войны, дважды был ранен, отравлен газами, заслужил офицерские пагоны и награды за храбрость. В мае 18-го Е. Катаев поступает в армию гетмана Скоропадского, а в начале 19-го — в одесские офицерские формирования Гришина-Алмазова. С приходом в Одессу «красных» (апрель 1919 г.) Катаев становится «рупором» советской пропаганды, работет в «красном» Бюро украинской печати (БУП). Но когда в Одессе снова устанавливается режим белогвардейцев Е. Катаев получает командирский пост на бронепоезде армии генерала Деникина. Во время эвакуации Одессы Е. Катаев заболевает тифом и остается в городе. А весной 1920 г. Е. Катаев был арестован как «белогвардейский заговорщик», полгода ждет расстрела в ЧК и спасается, по выражению его сына, только «чудом».
Во время белогвардейского режима в Одессе некоторые коммунисты — одесситы завязали знакомства с уголовным миром или получили убежище торговцев и бандитов. В одном чекистском документе раскрывались тайны одесской партийной коррупции большевиков, которые «…после возвращения советских войск оказались «в долгу» у этих врагов советского строя. Одесские спекулянты и даже бандиты широко пользовались этой слабостью местных работников. Работа Одесского губернского ЧК все время ограничивалась просьбами за отдельных арестованных. Нужно было прислать в Одессу новых решительных коммунистов, не связанных никакими «особыми отношениями».» Станислав Реденс попробовал тягаться с «одесским блатом» и подправить «одесские нравы» местных чекистов. Под страхом осуждения на два года принудительных работ он запретил чекистам показываться на работе в пьяном виде, запретил работникам ЧК «хлопотать об освобождении арестованных», лично обращаться в советские и государственные учреждения от имени ЧК, работать под псевдонимами, а женщинам — чекисткам являться на службу с «размалеванным лицом и подведенными глазами».
С. Реденс вошел в конфликт с местной партийной властью, распустив комиссию по проверке деятельности ЧК, отказавшись от каких либо форм партсоветского контроля за своим «ведомством». В центральные органы ушла жалоба на то, что на заседание большевистского партийного Бюро: «…врываются тт. Реденс, Дейч и Заковский. Реденс поднимает крик, что бюро не имеет права в рабочее время собираться, заявляя, что я считаю бюро распущенным». С. Реденс просил Дзержинского о своем отзыве из Одессы, по причине невозможности сосуществования с одесской партноменклатурой.
С. Реденса в мае 20-го поддержал Дзержинський, написав: «Все, что я слышал о вашей работе, свидетельствует, что вы полностью на месте. Железной рукой вы должны искоренить преступления и разного рода свинство советских работников».
Но в конце июля 1920 г. С. Реденса, на посту руководителя Одесского Губ ЧК, сменил сначала В. Яковлев, а через месяц — М. Дейч.
Именно тогда весной — летом 1920 г. одесская ЧК расскрыла белогвардейскую, польскую и петлюровскую подпольные организации. Большинство членов этих подпольных организаций было расстреляно.
Одесское ГубЧК сотнями «изымало из жизни» «контрреволюционеров», на которых падало подозрение в «шпионстве» в пользу иностранных розведок. В большинстве случаев обвинения были необоснованными. В мае 1920 г. было арестовано 30 жителей Одессы по делу о «французском шпионаже» (французского гражданина А. Леляна Балаева и инженера Г. Марданова). В июне 20-го в Одессе была ликвидирована «Азбука» — разведовательная «врангелевская группа» из 46 человек (из 21 арестованный был расстрелян), чекисты раскрыли антисоветскую организацию бывшего командира Дроздовского конного полка полковника Гусака — Гусаченко и «объединенную одесскую врангеливско-петлюровскую организацию», 54 члена которой были расстреляны.
По делу подпольного одесского филиала «Польской организации войсковой» (руководитель — Новосельский) было арестовано около 100 поляков, большинство из которых в августе 1920 г. были расстреляны одесскими чекистами (в том числе гимназисты 15–16 лет, женщины).
«Железный Фелекс» Дзержинский, приехав в Одессу в первых числах июня 1920 г. (ЦК РКП(б) направило его в Украину для активизации борьбы с «контрреволюцией»), потребовал от «местных товарищей» усиления репрессий. Заместитель Одесской губЧК П. Подзаходников утверждал, что благодаря этому приезду Дзержинского в Одессе были уничтожены многочисленные «контрреволюционные организации» с сотнями членов. Приезд Дзержинского совпал с обострением обстановки в городе, когда, по словам одесского чекиста П. Подзаходникова ежедневно «…приходилось вести ликвидацию многочисленных контрреволюционных организаций, которые иногда насчитывали до нескольких сот человек».
В июле 1920 г. одесские чекисты провели широкие аресты «учасников офицерского подполья» и нескольких одесских милиционеров, что якобы имели «контрреволюционные связи» с греческим консульством в Одессе. По этому делу было арестовано около 300 человек, многих из арестованных расстреляли, в том числе греческого консула Серафадиса, грека Равтонуло, поручика Голяске, 6 одесских милиционеров и военных командиров.
В августе — октябре 1920 г. ЧК ликвидировало подпольную белогвардейскую группу полковника Евстафьева и подпольный «Союз возрождения России». В Одессе было арестовано 194 «заговорщика», из которых росстреляно более 100 человек.
Приказом Бюро губЧК в Одессе началась компания массовых арестов бывших офицеров и царских чиновников, которая имела целью «профильтровать и провести изъятия личностей политически не совсем благонадежных». В ходе этой компании было арестовано 310 одесситов, что находились месяц в тюрьме ЧК, после чего около 100 человек оказались в концлагерях, а 90 — «отделались» увольнениями с мест работы, 120 — «легким испугом».
В ноябре — декабре 1920 г. органы ЧК провели массовые расстрелы пленных офицеров армий Деникина и Врангеля.
Весной 1920 г. чекисты разгромили одесскую «Просвіту» и Одесский союз потребительских товариществ. Среди арестованных ЧК оказались секретари «Просвіти» — М. Кравець и К. Сиренко, члены правления А. Комарецкая и П. Климович. В июне 1920 г. группа одесских просвитян была расстреляна чекистами.
Но, несмотря на все трагические события, жизнь в Одессе постепенно налаживалась. В городе, на ст. Одесса — Товарная, 28 февраля 1920 г., прошел первый коммунистический субботник, подобные субботники восстановления разрушенной инфроструктуры города стали проводиться каждую субботу. «Субботник — это значит, что каждую субботу, в таком-то часу, все истинные сыны Советской Республики должны собираться на такую-то улицу… На, Пасху, которая быта 29 марта, было большое торжество… после целой зимы беспросветного мрака на три дня Пасхи дали электричество во все квартиры» (В. Шульгин).
Современники отмечали, что в Одессе 1920 г., при ужасающей бедности быта, власти устраивали многочисленные парады и демонстрации — что у партийного руководства существовала «парадомания».
Летом 1920 г. был восстановлен одесский завод сельскохозяйственных машин бывшего «Гена», многие рабочие семьи были переселены из бараков в комфортабельные «дома буржуазии» из которых были выселены их прежние хозяева — «бывшие люди».
В середине октября 20-го у Одессы были установлены две восьмидюймовые батареи, после чего весь Одесско-Очаковский район был более защищенным от возможного десанта или обстрела кораблям Антанты или генерала Врангеля.