Через 30 минут, когда самолетов в воздухе уже не было, "Скейт" всплыл, чтобы продолжать поиск сбитых летчиков. Японцы снова и снова вынуждали лодку погружаться, но она продолжала решать поставленную перед ней задачу. После наступления темноты "Скейт" по-прежнему вел безуспешный поиск экипажей в районе падения самолетов. Через два дня после удара авиации по Уэйку находившийся в Пирл-Харборе Локвуд назначил "Скейту" рандеву с эскадренным миноносцем, чтобы быстрее оказать медицинскую помощь раненому на подводной лодке. На случай, если рандеву не состоится, Маккинни получил указание следовать к Мидуэю.
Утром 7 октября "Скейт" опознал приближавшиеся к нему американские самолеты. Те в свою очередь опознали "Скейт", так как сделали над ним несколько кругов, запросили место цели и потом исчезли в указанном направлении. Вскоре после этого атолл Уэйк дал о себе знать взрывами бомб и огнем зенитной артиллерии. Когда "Скейт" подошел к атоллу, вокруг него стали падать тяжелые снаряды. "Скейт" срочно погрузился, чтобы уйти из-под обстрела в подводном положении. Примерно через час он всплыл и получил радиограмму, в которой сообщались места трех сбитых летчиков. "Скейт" направился к ним. Около полудня он подошел к резиновой лодке и снял с нее первого летчика. Через 15 минут один из членов спасательной партии спустился за борт, чтобы помочь подняться на лодку другому летчику.
Согласно сообщению, в районе мыса Пикок находился третий летчик, и Маккинни отправился на поиск. В пяти милях от берега огонь береговой батареи стал настолько точным, что "Скейту" пришлось погрузиться. Через 30 минут он снова всплыл и обнаружил над мысом Пикок три самолета. Маккинни надеялся на то, что это американские самолеты, но один из них, приблизившись к "Скейту", сбросил бомбы в 18,3 метра впереди него. Бомбы взорвались довольно близко и причинили лодке легкое повреждение. К заходу солнца "Скейт" всплыл и продолжал обследовать район. Вести поиск ночью было трудно. "Скейт" буквально обшаривал поверхность воды, осторожно используя для этого ручной сигнальный фонарь; регулярно через мегафон делались вызовы. Однако все было безрезультатно, и Маккинни решил направиться к Мидуэю. Вскоре после этого находившийся в Пирл-Харборе Локвуд получил радиограмму от командира оперативного соединения (Монтгомери), в которой указывались места девяти летчиков, державшихся на спасательных плотиках неподалеку от атолла Уэйк, и приказал подобрать их.
Около 11.00 9 октября был спасен ещё один летчик.
На следующий день удалось спасти ещё трёх. И хотя подводная лодка находилась в назначенном ей районе до 14 октября, дальнейший поиск ничего не дал.
Нападение противника на атолл Уэйк показалось Кога началом американского наступления у Уэйка или в северной части Маршалловых островов. Подводная лодка "I-36", имевшая на борту разведывательный самолет, почти месяц находилась в районе Гавайских островов, ожидая благоприятного момента, чтобы произвести разведку Пирл-Харбора. Каждая ее попытка пресекалась радиолокационной системой обороны Гавайских островов и силами прибрежного дозора. Вскоре после американского нападения на Уэйк "I-36" отошла на 300 миль и подняла свой разведывательный самолет. Однако самолет не мог взять достаточного количества горючего для выполнения поставленной задачи и возвращения на подводную лодку. Обреченный летчик появился над Пирл-Харбором, сделал донесение о нахождении в базе четырех линейных кораблей, четырех авианосцев, пяти крейсеров и семнадцати эскадренных миноносцев и исчез.
Тревога Кога, вызванная нападением на атолл Уэйк, усилилась донесением летчика о сосредоточении в Пирл-Харборе американских сил. Он приказал еще четырем подводным лодкам выйти в район Гавайских островов, а сам на линейном корабле "Ямато" с мощными кораблями Объединенного флота перешел от островов Трук к атоллу Эниветок, пытаясь перехватить силы Нимица в неблагоприятный для него момент и одержать победу в морском сражении, с которым он связывал все свои надежды.
Несмотря на то что в бою, имевшем место в бухте Императрицы Августы, не было потоплено ни одного американского корабля, японскому командованию казалось, что американское оперативное соединение разгромлено. Кога решил, что появилась благоприятная возможность уничтожить американские силы на острове Бугенвиль "одним ударом". Он выслал с островов Трук к Рабаулу под командованием Куриты восемь крейсеров и четыре эскадренных миноносца из состава японского 2-го флота в надежде нацелить их на повторение победы (в виду имелась победа у острова Саво). К счастью, Хэлси не был введен в заблуждение неоднократными сообщениями 5-ой воздушной армии о полном разгроме японских сил в Рабауле. Он ждал перехода японских сил от островов Трук к Рабаулу и принял необходимые меры для наблюдения за ними.
Пять подводных лодок Файва были высланы на перехват любого следующего в Рабаул японского оперативного соединения. Однако сделать это им не удалось. Подводной лодке "Граулер", находившейся непосредственно у островов Трук с целью наблюдения за Южным проходом, в самое критическое время пришлось оставить район из-за аварии электрооборудования. Другие подводные лодки находились на линии разведки в открытом море. Случайно или вследствие хорошего планирования Курита обошел эту линию, и подводные лодки контакта с ним не имели.
Кроме разочарования, это ничего не вызвало. Однако несложный расчет показал, что при подобном развертывании подводных лодок вероятность перехвата быстроходного соединения являлась незначительной. Очертания южных проходов островов Трук таковы, что для достаточно надежного наблюдения за ними требуются три подводные лодки, в то время как для этой цели предназначалась лишь одна подводная лодка "Граулер". И даже если бы на позиции находились еще две подводные лодки, все равно существовала бы достаточно большая вероятность скрытного выхода ночью через проходы быстроходного соединения. Разведывательная линия из четырех подводных лодок в открытом море также была слишком незначительной по фронту и глубине и обеспечивала малую вероятность перехвата противника. И все же на перехват стоило идти, но не следовало рассчитывать на то, что он гарантирует успех. Хэлси понимал это и при получении информации о передвижениях японского флота не полагался только на подводные лодки.
Авиация, базировавшаяся на Соломоновы острова, осуществляла интенсивный воздушный поиск на подходах к Рабаулу. На рассвете 4 ноября в районе Кавиенга она обнаружила танкеры, обеспечивавшие силы Куриты. Два из них самолеты повредили бомбами. Курита выделил тяжелый крейсер и эскадренный миноносец для буксировки поврежденных танкеров на острова Трук. Примерно в полдень того же дня американская авиация обнаружила главные силы Куриты. О появлении противника был немедленно информирован Хэлси.
Но он не имел ни линейных кораблей, ни тяжелых крейсеров, чтобы оказать противодействие японскому 2-ому флоту. В южной части Тихого океана собрали все возможное для создания мощных сил под командованием вице-адмирала Спрюэнса. Силы эти были необходимы для предстоявшей операции в районе островов Гилберта. К счастью, оперативное соединение Шермана, в которое входили два авианосца, все еще находилось в подчинении Хэлси, а на переходе в южную часть Тихого океана находился Монтгомери с еще тремя авианосцами. Не дожидаясь Монтгомери, Шерман нанес авианосной авиацией удар по Рабаулу. Для двух авианосцев наносить такой удар было рискованно. В Рабауле находилось более 150 японских самолетов, но, к счастью для Шермана, подготовка японских летчиков к тому времени резко ухудшилась. Удар, нанесенный авианосной авиацией, застал Куриту врасплох. Через 15 минут после того, как японские корабли встали на якорь в Рабауле, самолеты с авианосцев были уже над бухтой Симпсон-Харбор. Через час в бухте разгорелась самая настоящая бойня. Без хороших торпед потопить бронированные корабли трудно, и тем не менее шесть крейсеров и два эскадренных миноносца оказались поврежденными настолько сильно, что не смогли принять участия в наступательных боевых действиях в течение многих месяцев.
11 ноября Монтгомери и Шерман нанесли совместный удар по Рабаулу авианосной авиацией. Были повреждены еще два крейсера и три эскадренных миноносца. При контратаках японская авиация понесла тяжелые потери. Уничтожение японской авиационной группы авианосной авиации практически завершилось. Уцелевшие самолеты этой группы Кога отвел, заменив их самолетами с Маршалловых островов. Этими ударами авианосной авиации плацдарм на острове Бугенвиль был надежно обеспечен, а японский 2-ой флот и японская авианосная авиация больше не представляли угрозы предстоящему наступлению в районе островов Гилберта.
Опознавание своих подводных лодок с воздуха всегда являлось трудной проблемой, требовавшей тщательного обучения летного состава, инструктажа и постоянной практики. Особенно трудной эта проблема была для района острова Новая Гвинея. В июле австралийский самолет едва не потопил подводную лодку "Тьюна". 8 ноября подводная лодка "Альбакор" (командир Хэгберг) преследовала японский конвой в надводном положении. Она находилась на экваторе, на 149° в. д., когда появился бомбардировщик 5-ой воздушной армии. Американский самолет вместо конвоя противника неожиданно атаковал бомбами "Альбакор", но, к счастью, безуспешно. Следующей ночью в центральной части Ново-Гвинейского моря при ярком лунном освещении "Альбакор" обнаружил впереди примерно в двух милях четырехмоторный бомбардировщик и пошел на срочное погружение. Первая серия бомб взорвалась вблизи носовой части лодки, когда она миновала 18-метровую глубину. "Альбакор" получил серьезные повреждения. Однако "Альбакору" повезло: он смог устранить их и продолжать патрулирование. Этот несчастный случай явился следствием недостаточно четкого инструктажа летчиков 5-ой воздушной армии. 25 ноября "Альбакор" потопил японское торговое судно, следовавшее к островам Палау.