Из-за происшествий с "Альбакором" Макартур запретил использование бомб самолетами 5-ой воздушной армии против любых кораблей севернее 2° ю. ш. Все районы южнее этой широты, кроме узких фарватеров, по которым подводные лодки возвращались в свои базы, являлись зонами неограниченного бомбометания. В них 5-ая воздушная армия могла атаковать любую опознанную или неопознанную движущуюся цель. В результате подводные лодки лишались возможности находиться в наиболее удобных районах при развертывании из Брисбена. Для обеспечения действий подводных лодок в удаленных районах в Тулаги создали базу пополнения топливом, а для непосредственного обслуживания подводных лодок плавучую базу "Фултон" направили в залив Мили. Однако снижение интенсивности японского судоходства и трудности, связанные с материально-техническим обеспечением, ускорили переразвёртывание подводных сил с восточного на западное побережье Австралии. К концу ноября на Фримантл базировались четырнадцать подводных лодок, а на Брисбен — только девять.
Наращивание подводных сил, базировавшихся на Фримантл, сразу же сказалось на увеличении числа потопленных японских судов в Южно-Китайском море. Подводная лодка "Гёрнард" (командир Эндрюс) 8 октября потопила два судна у северо-западного побережья острова Лусон. Через два дня подводная лодка "Боунфиш" (командир Хоган) у берегов Индокитая потопила два судна, находившихся в составе конвоя. 8 ноября подводная лодка "Блюфиш" (командир Портер) потопила крупный танкер, а через десять дней — эскадренный миноносец "Санае" и сильно повредила эскадренный танкер "Ондо". Из подводных лодок, базировавшихся на Фримантл, в ноябре наиболее успешно провела патрулирование подводная лодка "Бауфин" (командир Гриффитс) "Бауфин" принял топливо в заливе Эксмут и через проливы Ломбок, Макассарский и Сибуту вошел в Южно-Китайское море. Здесь он потопил артиллерийским огнем четыре небольшие шхуны и, возможно, повредил два других небольших судна, но только в ночь на 26 ноября ему удалось обнаружить более крупную цель.
В непроглядной ночной темноте дождь лил сплошным потоком. Сигнальщики напряженно вглядывались в темноту. Радиолокатор работал неустойчиво. Неожиданно на его экране появились всплески от объектов, находившихся с обоих бортов лодки на удалении от 5 до 20 кабельтовых. Гриффитс испугался, подумав, что совершил ошибку и идет на небольшой островок, хотя эхолот непрерывно показывал глубину 137 метров.
"Бауфин" отвернул влево и вынужден был немедленно дать задний ход, чтобы не столкнуться с крупным танкером. Подводная лодка очутилась в середине японского конвоя, состоявшего из пяти судов. Гриффитс решил, что конвой движется на юг, и только когда он снова дал задний ход, чтобы избежать столкновения с другим судном, понял: все японские суда шли в северном направлении. Гриффитс вывел подводную лодку из сложного положения и в течение часа следовал за конвоем, пока обстановка полностью не прояснилась.
После оценки обстановки Гриффитс атаковал головное судно конвоя тремя торпедами, взрывом которых была оторвана носовая часть судна и снесена надстройка мостика. Пока "Бауфин" развертывался для залпа по другой цели, его первая жертва встала бортом к нему, и ее стало наносить на лодку. У Гриффитса хватило времени только на выпуск одной торпеды, перед тем как снова дать задний ход во избежание столкновения. Эта единственная торпеда и попала во второе судно. "Бауфин" развернулся, выпустил три торпеды, чтобы добить поврежденные суда, и отошел дяя перезарядки торпедных аппаратов.
Наступило утро, когда Гриффитс снова занял позицию для атаки. Эта первая дневная атака оказалась неудачной. "Бауфин" всплыл, произвел переразвертывание для следующей атаки, в ходе которой цель была уничтожена четырьмя торпедами. Японские данные подтверждают потопление в ходе этих атак двух грузовых судов тоннажем по 5000 тонн.
На следующий день "Бауфин" потопил небольшое судно, захваченное японцами в Индокитае. Рано утром 28 ноября Гриффитс получил радиограмму с подводной лодки "Биллфиш", которая навела "Бауфин" на японский конвои в составе пяти судов. В ночной атаке, находясь в надводном положении, "Бауфин" потопил два судна из состава конвоя. Одно из них оказалось танкером (9866 тонн). Артиллерийским огнем кораблей охранения была повреждена и подводная лодка. Но, несмотря на повреждения, "Бауфину" удалось выпустить две торпеды и по кораблю охранения. Оставшиеся две торпеды Гриффитс выстрелил по крупному грузовому судну. После того как торпеды прошли около 2,5 кабельтова, одна из них преждевременно взорвалась, сбив с курса другую. В результате обе торпеды не попаяй в цель.
В дальнейшем на переходе в Целебесское море "Бауфин" обнаружил японский конвой. Израсходовав до этого все торпеды, "Бауфин" не мог произвести атаку, но он преследовал конвой до тех пор, пока не навел на него подводную лодку "Биллфиш".
За время этого патрулирования подводная лодка "Бауфин" потолнла девять судов (70948 тонн)[41].
В октябре 1943 года на патрулировании в центральной части Тихого океана (между экватором я Охотским морем и от демаркационной линии времени до побережья Китая) находилось тридцать американских подводных лодок. Две или три подводные лодки постоянно использовались в районах Маршалловых островов и островов Гилберта для разведки по планам штаба Нимица. Число подводных лодок, действовавших против японскою тортового судоходства, за год удвоилось. Это увеличение привело к некоторым изменениям в тактике их применения.
1 октября первая группа (или "волчья стая") подводных лодок ("Сиро", "Шэд" и "Грейбэк") вышла из базы на Мидуэе и направилась в Восточно-Китайское море. Группой командовал Момсен, который находился на подводной лодке "Сиро". Ранее уже имели место примеры совместных действий подводных лодок, развернутых в соседних районах. Группа Момсена была первой специально организованной труппой подводных лодок, предназначенных для совместных действий.
На Атлантике эту тактику применяли немцы. Атлантические конвои иногда включали до 70 и более судов, находившихся в охранении большого числа кораблей. В этих условиях одиночная немецкая подводная лодка могла потопить немного судов из состава конвоя, а силы охранения способны были безболезненно выделить корабль для удержания одиночной подводной лодки на глубине, пока конвой продолжал свой путь. Немецкие "волчьи стаи" явились ответом на создание крупных конвоев с большим числом кораблей охранения. Японские конвои были небольшими — примерно пять судов и один-два корабля охранения. Против таких небольших конвоев действия одиночных подводных лодок оказывались эффективными при проведении атак, но при поисковых действиях лучшие результаты давало групповое использование подводных лодок.
Считалось, что "волчья стая" Момсена потопила пять судов и семь повредила, однако на самом деле потоплено было только три японских судна и сильно повреждены два крупных судна. В среднем действия подводных лодок этой "волчьей стаи" оказались менее эффективными по сравнению с действиями трех одиночных подводных лодок. Момсен высказался против применения совместных атак в той форме, в какой они тогда проводились. Он признавал, что групповое использование подводных лодок могло быть более успешным при поиске целей, но это преимущество сводилось на нет потерей той свободы действий, которую имели подводные лодки при проведении самостоятельных атак.
Момсен предложил следующее: командир "волчьей стаи" не должен находиться на подводной лодке своей группы. Ему следует оставаться на береговой базе, где он имеет большие возможности для сбора всей информации и лучшую систему связи для ее передачи необходимым адресатам. Немцы применяли такую систему. Однако осуществлять связь на Атлантике, где расстояния не такие большие, как на Тихом океане, легче. Предложение Момсена не приняли. Считали, что это вызовет увеличение объема радиопередач с подводных лодок при их нахождении в операционных районах и тем самым даст дополнительный материал для работы японских радиолеленгаторов. Для борьбы с радиопеленгованием на Атлантике немцы создали систему "импульсной передачи", в которой длинное сообщение сжималось электронной аппаратурой для передачи. Немецкие подводные лодки могли принимать и отправлять донесения одним коротким импульсом без вызова станции и без подтверждения получения. Надо признать, что на просторах Тихого океана связь ВМС США не была столь действенной. Американским подводным лодкам часто приходилось всплывать, иногда в течение ряда часов находиться в опасной обстановке в надводном положении, чтобы вызвать радиостанцию для передачи важного донесения о контакте с противником.
3 ноября вышла в море вторая группа американских подводных лодок под командованием Уордера, который раньше командовал подводной лодкой "Сивулф". Уордер подтвердил наблюдения Момсена. Он считал, что в будущем любая "волчья стая" должна управляться командиром соединения, а не специально назначаемым командиром группы.
Поскольку время проведения операции "Галваник" (операция по захвату островов Гилберта) приближалось, для обеспечения ее было привлечено значительное число подводных лодок. От командира 5-го амфибийного соединения (командир Тернер) поступила заявка на фотографирование подводными лодками атоллов Тарава, Макин и Абемама. До этого времени фотографирование через перископ давало недостаточно хорошие результаты. Выбор Локвуда пал на подводную лодку "Наутилус" (командир Ирвин), которая сумела решить поставленную задачу. "Наутилус" возвратился в базу в конце октября, имея необходимые фотографии и дополнительную информацию о том, что карты атолла Тарава были составлены с отклонением 11° от правильной ориентации. Если бы эту ошибку не обнаружили, она затруднила бы нанесение бомбового удара с воздуха, артиллерийский обстрел берега кораблями и высадку морского десанта.