18 февраля 2014 года ученые прибыли в Манаус, город с двухмиллионным населением и столицу бразильского штата Ама-зонас. Основанный в 1669 году, он находится посреди самого большого на Земле тропического леса, в том месте, где черные воды реки Негро и грязно-коричневые воды реки Со-лимойнс сливаются в Амазонку. Странно, но эти две реки, черная и коричневая, текут бок о бок на протяжении почти четырех миль, прежде чем окончательно смешиваются. Город в основном выглядит современно: высокие здания, мосты, пляжи, а по краям - трущобы. Есть здесь и исторические здания, в основном построенные в XIX веке, когда здесь находился процветающий центр каучуковой промышленности.
По словам Хоффмана, написанным в неопубликованном журнале, который он вел, все пошло наперекосяк почти сразу после прибытия в Манаус, и путешествие превратилось в комедию (и трагедию) ошибок, препятствий, хороших и плохих актеров и просто дрянной удачи, которую он окрестил "Шоу дерьма Амазонки".
Для начала пятидневная поездка за образцами заняла в итоге семнадцать дней, причем задержки начались уже по прибытии ученых в Манаусе, но их снаряжение так и не появилось. Оно появилось через три дня, но только после постоянных звонков Гильерме Оливейры и Сары Куадрос в компанию, которая должна была предоставить все необходимое для их экспедиции. Наконец, - пишет Хоффман, - юрист из их института позвонил кому-то высокопоставленному и сказал: "Мы - государственный институт, и у нас с вами контракт. Если это оборудование не будет доставлено как можно скорее, вы будете исключены из правительства и не будете использоваться". Удивительно, но оборудование было доставлено на следующую ночь!"
Получив оборудование, ученые с ужасом обнаружили, что нанятое ими судно под названием Special K было продано во время трехдневной задержки оборудования. Новый владелец быстро выгнал команду и ученых с корабля, хотя Хоффмана в этот момент не было рядом. Когда позже он прибыл на место, где была пришвартована лодка, ее уже не было, как и его паспорта, компьютера и прочего оборудования. "Мы с Гильерме быстро сели на катер (ну не очень быстро), - пишет Джефф, - и через час обнаружили, что катер заправляется. Владелец сказал, что мы сможем забрать свои вещи, когда они причалят к причалу. Мы последовали за ними. Я зашел в свою комнату, но все мои вещи были в порядке, поэтому я собрал вещи и отправился обратно на маленькую лодку".
В те выходные бесстрашные ученые взяли новую, гораздо большую лодку с командой из десяти человек, семеро из которых, по словам Хоффмана, были просто в качестве пассажиров, поскольку на самом деле ничего не делали. В то воскресенье, 23 февраля, они взяли пробы в реках Негро и Солимойнс и отправились обратно в Манаус на ночлег.
Команда планировала покинуть Манаус и отправиться вниз по течению на следующее утро с первыми лучами солнца, однако отплытие заняло у команды до 16:00. "Затем на лодке отказала электрическая система", - пишет Хоффман. "Лампочки взрывались". Среди пострадавших был смартфон Джеффа, который он заряжал от корабельной электросети. Электрический компрессор для взятия проб микроорганизмов тоже "сгорел", и команде пришлось на следующий день искать новый с аккумулятором в городке Паринтинс, расположенном ниже по реке в двухстах милях от Манауса, - компрессор, который, конечно, не работал.
Эта поездка, напоминающая сценарий "Сердца тьмы" в комедийном ключе, продолжалась, когда практически все, что только можно было себе представить, шло не так - проблемы с электричеством, попытки исправить ситуацию, попытки получить новые лодки, которые наталкивались на препятствия, и так далее, и тому подобное.
Когда через пять дней команда наконец покинула Паринтинс, они свернули с реки Амазонки на реку Тапахос, еще один приток Амазонки. "Это была одна из лучших частей путешествия, и мы действительно чувствовали себя как в тропическом лесу, - рассказывает Хоффман, - с множеством диких животных, включая обезьян, прыгающих с дерева на дерево". Но катастрофы продолжались, поскольку ученые опасались, что электрическая система может вызвать пожар. В речном городе Сантарем они начали искать новую лодку. Это привело в ярость партнера капитана, так как он не хотел терять деньги, обещанные ему за путешествие. Он начал кричать на Куадроса, в результате чего Хоффман - крупный парень - поднялся и сказал ему, чтобы тот успокоился и отвел их к причалу, где они собирались сойти с лодки.
Новая лодка принадлежала человеку по имени Филиппи, которого Хоффман считал "хорошим парнем". "Они мгновенно перенесли все наше снаряжение, припасы и личные вещи на одну из своих лодок", - пишет Хоффман. Затем команда подготовилась к оставшейся части путешествия вниз по реке, в то время как Куадрос отправила первые замороженные образцы в свой институт для секвенирования".
Ученые продолжали брать пробы, несмотря на то, что двое мужчин были вынуждены спать на матрасах на палубе, потому что их кондиционированная комната была заполнена парами топлива. Их атаковали насекомые, а жара и влажность означали жалкие ночи со скудным сном. Когда комната Куадроса, где был кондиционер, оказалась кишащей тараканами, пауками и другими насекомыми, они нашли другую лодку - более новую, с кондиционером, но без горячей воды для душа. Тем не менее, они продержались и закончили сбор образцов в реке и в устье Амазонки.
Во время последней пробы, в многокилометровом устье, где река впадает в море, их ждал еще один сюрприз: новое судно, на котором они плыли, было поднято на борт бразильскими военно-морскими силами. К сожалению, капитан оставил свои права в одном из городов вверх по реке. Бразильские моряки заставили судно причалить к военно-морской станции в Манаусе и приказали Хоффману и ученым покинуть судно со всем их снаряжением. Это создало дилемму: у них не было сухого льда, чтобы охладить образцы, а компания, которая должна была это организовать, не появилась. Когда Хоффман связался с ними, они заявили, что ничего не знают о льде. Куадрос попросил менеджера отеля в Макапе, городе недалеко от устья Амазонки, хранить образцы в холодильнике отеля, пока не будет найден альтернативный источник льда. Сухой лед был доставлен через два дня, поскольку в городе начался праздник Карнавала. "Все это ради науки, - сказал Хоффман.
Ученые покинули Макапу 25 февраля. Гильерме Оливьера и Сара Куадрос вернулись в свой институт в Белу-Оризонти, взяв с собой замороженные образцы, как и было оговорено в разрешении, выданном бразильским правительством.
Хоффман отправился обратно в Сан-Диего. В Белу-Оризонти он уже провел время, обучая Оливеру, управляющего секвенирующим комплексом института, точному процессу, который JCVI использовал для извлечения и дробного секвенирования ДНК, чтобы методы совпадали с другими образцами, взятыми в Саргассовом море в 2003 году. После того как в Бразилии все пошло не так, бразильские ученые проделали потрясающую работу и отправили цифровые последовательности в JCVI, а две команды работали над анализом вместе.
ДО и ПОСЛЕ "Амазонки" экспедиции JCVI по изучению микробиома планеты продолжались, в основном на борту Sorcerer II, но не всегда. В их число вошли две дополнительные экспедиции в Антарктиду в 2012 и 2015 годах.18 Еще одна экспедиция JCVI в 2016 году исследовала горячие глубоководные источники в Тихом океане, а также ученые совершили множество небольших путешествий у западного побережья Северной Америки, в Карибском бассейне, а также вверх и вниз к восточному побережью Северной Америки.
Проект Sorcerer II прочесывал планету в поисках микробов вплоть до 2018 года, когда корабль был окончательно выведен из состава экспедиций по сбору образцов. В общей сложности с 2003 по 2018 год великое судно преодолело более 65 тысяч морских миль в поисках новой жизни, исследуя Тихий, Индийский и Атлантический океаны, Балтийское, Средиземное, Эгейское и Черное моря, добывая образцы из морей и водных путей примерно тридцати трех стран и территорий. Ученые собрали в общей сложности 477 образцов с борта корабля, включая 147, взятых во время кругосветного путешествия, и еще 218 образцов с борта судна - сокровищницу мельчайших живых организмов Земли, которые до сих пор лишь частично вскрыты, секвенированы и вновь собраны. Миллионы микробов остаются замороженными в огромных металлических морозильных камерах в JCVI в Ла-Джолле, ожидая секвенирования, ана-лиза и раскрытия своих секретов.
Сбор и секвенирование образцов были лишь началом процесса. Далее предстояло проанализировать, чем на самом деле занимаются эти микробы - как они живут и умирают, как вписываются в экониши и микробные сообщества и какова их роль в планетарных циклах жизни и смерти.
Мы уже рассказывали о результатах экспедиции 2003 года в море Сар-Гассо, с которой все началось. А теперь давайте вернемся в тот знойный день в море Кортеса в марте 2007 года, когда "Сор-Серер II" проплывал вблизи крошечной рыбацкой деревушки Лорето, Мексика. Именно тогда экипаж получил известие о том, что первый пакет документов о глобальной экспедиции выходит в свет в виде специальной коллекции PLoS Biology. Над этим трудилась большая команда ученых в JCVI и за ее пределами с тех пор, как первые сорок один образец был выловлен из океанов от Галифакса и Саргассо до Галапагосских островов.
И что же они обнаружили?
Часть 3. Итоги
Глава 7. Взгляд в бесконечность
Известное ограничено, неизвестное - бесконечно.
-Томас Генри Хаксли, о прочтении книги «Происхождение видов»
В ЯНВАРЕ 2007 года на побережье Панамы Даг Раш почувствовал тошноту. Задиристый ученый-вычислитель с худым лицом и короткими каштановыми волосами, Раш был первым автором главного исследования о глобальной экспедиции, которое должно было быть опубликовано в журнале PLoS Biology. Крейг пригласил его присоединиться к экипажу "Колдуна II" на несколько дней.
В течение нескольких дней он хотел увидеть, каково это - быть в открытом море, собирая образцы, которые он помогал анализировать на компьютере в JCVI на протяжении почти двух последних лет.