Толчком к вооруженному восстанию послужили кровавые бесчинства японского и белогвардейского отрядов в селе Мазапово. Крестьяне этого села в начале января 1919 года выступили с оружием в руках против японо-белогвардейских грабителей и убийц. Восстание поддержали окрестные села и деревни. Под руководством революционного военного штаба, созданного перед этим на крестьянской конференции в деревне Сохатино, повстанцы уничтожили карателей. Интервенты бросили против повстанцев большие силы. Восстание было подавлено, и повстанцы ушли в тайгу Японские захватчики сожгли Сохатино и Мазаново. Оставшиеся жители, в том числе женщины, старики и дети, были расстреляны. Во время восстания погиб один из его организаторов член ВЦИК 3. Ф. Кулинич.
После Мазановского восстания партизанское движение охватило почти всю область. По решению Благовещенского подпольного партийного комитета для руководства движением был создай в январе в деревне Красный Яр областной военно-революционный штаб. В него вошли коммунисты В. А. Бородавкин, С. Г. «Пашкевич, И. Ф. Матвеев и другие. Командующим армией был избран И. Г. Безродных, а после его ранения в февральских боях — Г. С. Дрогошевский. Начальником штаба был назначен В. К. Аксенов. Партизанская армия Амурской области, объединившая многие отряды, насчитывала в начале 1919 года до 10 тысяч бойцов. Она провела в январе — марте несколько крупных боев с японскими войсками и нанесла им большие потери. Интервенты были вынуждены признать, что волна партизанского движения «захлестнула Дальний Восток». Японская газета «Иордзу-Чиохо» 3 марта 1919 года писала о том, что советские партизаны — весьма серьезный противник для японских войск. Японское командование отмечало, что войска в безуспешной борьбе с партизанами несут огромные потери. И действительно, в зиме-весенних боях 1919 года амурские партизаны уничтожили до 7 тысяч японцев и белогвардейцев. Они сковали значительные силы врага. Интервенты сосредоточили против партизанской армии 14-ю японскую пехотную дивизию, части 13-й, 17-й японских дивизий и несколько белоказачьих полков.
В марте партизанское движение на Амуре понесло тяжелую утрату. Белогвардейская разведка раскрыла подпольный большевистский комитет в Благовещенске и арестовала 66 руководящих партийных работников В числе их был арестован и Ф. И. Мухин, который был убит белогвардейцами по дороге в тюрьму. Но эта утрата не ослабила воли к борьбе с интервентами. В апреле был избран новый состав подпольного Амурского обкома, в который вошли Я. Ф. Яковлев (председатель), З. А. Нестеров, О. Н. Иогансон, М. А. Трилиссер, М. Шергов, П. В. Яницкий.
С наступлением весны и началом полевых работ часть партизан была распущена по домам. Опыт прошедших боев показал, что создание большой, малоподвижной партизанской армии нецелесообразно. Интервенты и белогвардейцы, имея численное и техническое превосходство и удерживая в своих руках важнейшие дороги, имели возможность изолировать и блокировать такую армию. Поэтому революционный военный штаб принял решение перестроить тактику борьбы. Амурская армия разделилась на мелкие отряды, которым было приказано действовать самостоятельно в отведенных им районах. Партизанам, которые могли жить легально, было предложено на время разойтись по домам.
Летом колчаковские власти начали проводить мобилизацию нескольких возрастов молодежи в армию. В ответ на это большинство призывников вступало в партизанские отряды. Партизанское движение разрасталось.
Широко развернулось партизанское движение в Приамурье. Началось оно с восстания в Хабаровске. Здесь группа партийных работников, оставшихся в подполье после занятия города интервентами и белогвардейцами, несмотря на жесточайший террор, уже в сентябре 1918 года сумела начать активную деятельность, завязать связи и создать подпольную организацию. В начале октября была установлена связь с союзом грузчиков, рабочими арсенала, матросами речной флотилии Амура, железнодорожниками депо Хабаровска и станции Вяземская. В районе Вяземской в декабре 1918 года был сформирован один из первых партизанских отрядов под командованием паровозного машиниста, большевика А. Е. Погорелова. Здесь же в январе 1919 года организовался отряд под командованием Г. Ф. Коваля — бывшего командира красногвардейского бронепоезда.
Хабаровские коммунисты подготовили в январе 1919 года восстание в одном из калмыковских полков, куда попали бывшие красногвардейцы. Восстание началось в ночь на 28 января. Повстанцы перебили часть офицеров и юнкеров. Был убит начальник хабаровского гарнизона полковник Бирюков. Самого Калмыкова захватить не удалось, он успел скрыться в японском штабе, где поднял тревогу. Японские части отрезали пути отхода повстанцам. Но часть повстанцев все же прорвалась и ушла через Амур в сторону китайской границы.
После хабаровского восстания подпольная организация перенесла центр тяжести революционной работы на периферию. 10–11 марта в деревне Соколовке состоялся нелегальный областной съезд трудящихся Приамурья, на котором присутствовало 76 делегатов. Съезд положил начало массовому партизанскому движению в Приамурье. Для руководства партизанами съезд избрал военно-революционный штаб во главе с рабочим хабаровского арсенала, коммунистом Д. И. Бойко-Павловым, на которого было возложено командование партизанскими отрядами Приамурья. По решению съезда уже в марте — апреле было сформировано несколько новых отрядов.
На левобережье Амура из мелких партизанских групп еще в начале 1919 года выросли крупные, боеспособные отряды. Среди них были такие, как 1-й Тунгусский отряд, которым командовал хабаровский грузчик И. П. Шевчук, а политическим руководителем был видный партийный работник П. П. Постышев; 2-й Тунгусский отряд под командованием Алексея Кочнева и его братьев — рабочих базы Амурской флотилии; отряд под командованием матроса Мизина, действовавший в районе озера Катар, и другие.
На правобережье Амура, между Вяземской и Хабаровском, сражались отряды Гармашова, Рубеля, М. Изотова, И. Федотенко, И. Жукова, Н. Найденова и другие. В апреле 1919 года в Приамурье действовало свыше 20 партизанских отрядов.
Японское командование не один раз посылало карательные отряды против партизан, но все они возвращались битыми. Никакими мерами белогвардейские власти и интервенты не могли задушить разраставшееся движение. Население сел и деревень встречало карательные отряды огнем или уходило в тайгу к партизанам.
Хабаровская подпольная организация большевиков, возглавлявшаяся последовательно Б. Славиным, Я. Луненко, Б. Ждановым, настойчиво вела работу среди трудящихся и солдат гарнизона. На многих предприятиях, в воинских частях и учреждениях были созданы подпольные группы. Добывалось оружие, боеприпасы. Среди населения собирали одежду, белье, медикаменты, и все это переправлялось партизанам.
Подпольная организация неоднократно терпела провалы и несла потери. Мучительной смертью погибли в калмыковском «вагоне смерти» сотни подпольщиков, среди них активные коммунисты Н. Гаврилов, Б. Славин (члены «Центросибири»), Г. Штылев (председатель хабаровского союза грузчиков), Г. Аксенов, Болотин и Болотина (члены Хабаровского комитета партии), Я. Луненко и многие другие. На смену погибшим вставали новые бойцы и самоотверженно продолжали работу.
Приамурье стало ареной ожесточенных боев с интервентами, которые имели здесь значительные силы. Почти на каждой станции Амурской и Уссурийской железных дорог стояли японские гарнизоны. Условия борьбы требовали объединить действия партизанских отрядов, сделать их более целеустремленными. В 20-х числах августа в деревне Алексеевке была созвана конференция представителей партизанских отрядов и хабаровского подполья. Было принято решение: всем партизанским отрядам начать разрушение железнодорожных и. водных коммуникаций врага и усилить работу по разложению вражеского тыла. Конференция постановила также создать в селах нелегальные ревкомы и возложить на них оказание помощи партизанским отрядам. После конференции в Алексеевке партизанское движение в Приамурье приобрело еще больший размах. Оно стало более организованным; отряды сосредоточили теперь основные усилия на разрушении вражеских коммуникаций.
Огромного размаха достигло партизанское движение в Приморской области. Здесь основными центрами его были Сучанские каменноугольные копи, Тетюхинские серебро-свинцовые рудники, таежные селения Ольга, Анучино, Фроловка и другие.
Начало партизанскому движению в Приморье было положено осенью 1918 года, когда в Сучанской долине учителя Н. К. Ильюхов, Т. А. Мечик и группа рабочих-шахтеров, крестьян и фронтовиков образовали нелегальный комитет по подготовке сопротивления внешней и внутренней контрреволюции. Благодаря энергичной деятельности комитета в разных местах Приморья стали создаваться боевые дружины. В них охотно вступало трудящееся население, чтобы бороться против интервентов и белогвардейцев. В начале января 1919 года вспыхнуло восстание на Сучане, которое получило отклик почти по всему Приморью. Началось повстанческое движение в Цемухинской долине. На вооружённую борьбу поднялись шахтеры Тетюхинского рудника. В районе Спасска действовал крупный партизанский отряд А. Д. Борисова, в Иманском уезде — отряд владивостокского грузчика И. Я. Мелехина.
Колчаковцы направили в Ольгинский и Никольск-Уссурийский уезды карательные отряды. Но они потерпели поражение. Партизаны освободили целые районы. В марте 1919 года в Сучанской районе в селении Фроловке собрался съезд руководителей партизанских отрядов Ольгинского и Никольск-Уссурийского уездов. На съезде был создан Временный военно-революционный штаб партизанских отрядов Ольгинского уезда, который стал высшим органом военной и гражданской власти на освобожденной территории. Председателем штаба был избран И. В. Слинкин. 19 апреля на конференции коммунистов во Владивостоке было принято решение укрепить партизанское движение рабочими кадрами, оказать помощь вооружением, продовольствием и медикаментами. Благодаря этой помощи к маю весь обширный район Сучана, а также Ольгинский уезд были почти полностью очищены от интервентов и белогвардейцев. Только на шахтах Сучана и на станциях Сучанской железнодорожной ветки с большим трудом удерживались американские и японские гарнизоны. Центр уезда, селение Ольга, находился