крРНК – короткие молекулы РНК, участвующие в системе КРИСПР. Английский вариант: crRNA.
Л
Ламаркизм – учение, согласно которому биологическая эволюция происходит путем наследования благоприобретенных признаков. Основоположником учения был французский биолог конца XVIII – начала XIX века Жан Батист Ламарк.
Лигаза – фермент, залечивающий однонитевой разрыв («ник») в молекуле ДНК.
Лимфоциты – клетки крови, ответственные за иммунитет.
ЛНП – липопротеины низкой плотности. Жировые тельца, служащие для переноса молекул холестерина.
М
Макро – – приставка, означающая, что речь идет о чем-то, состоящем из очень большого числа атомов.
Матрица – полимерная молекула, последовательность которой используется для задания последовательности другой полимерной молекулы. ДНК служит матрицей для синтеза ДНК при репликации и РНК при транскрипции. РНК служит матрицей для синтеза белка при трансляции и ДНК при обратной транскрипции.
Метастаз – вторичный очаг злокачественного перерождения. Признак далеко зашедшего заболевания раком. Способность давать метастазы – одна из наиболее неприятных особенностей ракового заболевания.
Метилаза – фермент, осуществляющий метилирование.
Метилирование – присоединение метильной группы СН3.
Метионин – одна из 20 канонических аминокислот.
Микро – приставка, означающая, что речь идет о чем-то, содержащем не очень большое число атомов.
Митохондрия – сигарообразное тело, расположенное в цитоплазме. Является энергостанцией клетки, перерабатывающей продукты питания в энергию АТФ.
Мономер – повторяющийся элемент полимерной цепи. Например, в полиэтилене это группа СН2, в белке – аминокислотный остаток, в ДНК – нуклеотид. Правильнее говорить не «мономер», а «мономерное звено», так как мономером химики часто называют исходный продукт для синтеза полимера (этилен, аминокислота и т. д.).
Мусорная ДНК – часть генома высших организмов, которая не имеет функционального значения. Английский вариант: Junk DNA.
Мутаген – агент, вызывающий мутацию.
Мутация – наследуемое изменение генетического материала. Мутации могут быть спонтанными, т. е. вызванными естественными причинами, и индуцированными, т. е. вызванными искусственно (радиация, химические вещества и т. д.). В результате мутации происходит изменение последовательности нуклеотидов в ДНК.
Н
Нанометр (нм) – единица измерения длины (миллиардная доля метра, 1 нм = 10–9 м).
Нанопора – отверстие в мембране диаметром несколько нм.
Неоантиген – новый антиген, возникший в результате соматической мутации в раковой клетке.
Ник – однонитевой разрыв, т. е. разрыв сахарофосфатного остова в одной из двух цепей ДНК.
Нуклеаза – фермент, расщепляющий ДНК или РНК.
Нуклеиновые кислоты – ДНК и РНК.
Нуклеосома – основной структурный элемент хромосомы. Представляет собой белковую (гистоновую) сердцевину, на которую намотана ДНК длиной в 140 пар оснований, делающая около двух оборотов.
Нуклеотид – мономерное звено ДНК и РНК.
О
Однонитевой разрыв («ник») – разрыв сахарофосфатного остова в одной из двух цепей ДНК.
Олигомер – нечто промежуточное между мономером и полимером.
Олигонуклеотид – одиночная цепь ДНК или РНК, содержащая от нескольких до нескольких десятков мономерных звеньев.
Онкоген – ген, вызывающий рак.
Онкогенный вирус – вирус, вызывающий рак.
Основание (нуклеиновое или азотистое) – класс химических соединений, к которому принадлежат аденин, гуанин, тимин, цитозин и урацил.
П
Пенициллин – первый антибиотик. Открыт Александром Флемингом в 1929 году.
Пенициллиназа – фермент, расщепляющий пенициллин. Выработка этого фермента бактерией защищает ее от действия пенициллина.
Перевертыш – фраза, которая звучит одинаково, читать ли ее слева направо или справа налево. При написании перевертыша не принимаются во внимание промежутки между словами и знаки препинания. Примеры: ТОНЕТЕНОТ; ЛЕЗУВУЗЕЛ; НЕГНИПАПИНГЕН; ЛЁШАНАПОЛКЕКЛОПАНАШЁЛ; УЖРЕДКОРУКОЮОКУРОКДЕРЖУ. В приложении к ДНКовым текстам такие перевертыши называют зеркальными. Просто перевертышем (палиндромом) называют отрезок двойной спирали, который имеет одинаковую последовательность при чтении по одной и по другой нити в одном и том же направлении, диктуемом химическим строением цепей ДНК. Например:
Пиримидин – класс химических соединений, к которому принадлежат тимин, урацил и цитозин.
Пиросеквенирование – метод чтения последовательности ДНК, основанный на том, что на каждом шаге синтеза ДНК на матрице высвобождается один пирофосфат.
Плазмида – кольцевая молекула ДНК, размножающаяся вместе с бактерией и способная переходить из клетки в клетку.
Поли– – приставка, обозначающая, что речь идет о полимере.
Полимер – химическое соединение, представляющее собой цепочку повторяющихся группировок. Простейшим полимером является полиэтилен… – СН2 – СН2 – СН2 – …, из которого делают пакеты, сумочки и многое другое. Гомополимеры состоят из совершенно одинаковых мономерных звеньев. Биологические полимеры являются гетерополимерами, так как в каждом из них звенья хотя и принадлежат к одному классу (аминокислоты в белке и нуклеотиды в нуклеиновых кислотах), но отличаются по своему строению. Белок состоит из мономеров 20 типов, нуклеиновая кислота – четырех типов.
Половые клетки – клетки, служащие для продолжения рода (сперматозоиды и яйцеклетки). В отличие от остальных клеток эукариот, половые клетки содержат только одиночный набор хромосом (23 в случае человека).
Половые хромосомы – женская хромосома X и мужская хромосома Y. Во всех клетках, кроме половых, мужчины имеют набор половых хромосом XY, а женщины – XX.
Популяционное «бутылочное горлышко» – резкое снижение численности популяции.
Порядок зацепления – количественная характеристика степени зацепления двух контуров. Порядок зацепления равен числу раз, которое один контур протыкает поверхность, натянутую на другой контур. Обозначается через Lk.
Праймаза – специальная РНК-полимераза, синтезирующая РНКовые праймеры при репликации ДНК в клетке.
Праймер – короткий кусочек однонитевой ДНК или РНК, служащий затравкой при работе ДНК-полимераз и ревертаз.
Прививка – введение в организм вакцины. Смысл прививки – выработать иммунитет к болезни без того, чтобы переболеть ею.
Прогенот – гипотетический общий предок всего живого на Земле.
Прокариоты – одноклеточные, не имеющие клеточных ядер.
Промотор – участок ДНК, с которым связывается РНК-полимераза, чтобы начать синтез мРНК.
Протеаза – фермент, расщепляющий белок (протеин).
Протеин – то же, что и белок.
Пуассоновское распределение – одно из важнейших понятий теории вероятностей.
Пурин – класс химических соединений, к которому принадлежат аденин и гуанин.
ПЦР – полимеразная цепная реакция. Используется для размножения молекул ДНК в пробирке.
Р
Райзинг – понятие теории полос. Величина райзинга зависит только от того, какую форму в пространстве имеет ось полосы, но не зависит от того, как полоса закручена вокруг этой оси. Обозначается через Wr.
Рамка считывания – фаза чтения рибосомой последовательности нуклеотидов в мРНК. Поскольку код триплетный, для любой последовательности существует три рамки считывания. Для всех трех рамок считывания последовательность аминокислотных остатков будет разной.
Ревертаза – фермент, ведущий синтез ДНК по матрице РНК. Этот процесс называется обратной транскрипцией.
Редактирование генома – направленное изменение последовательности ДНК в живой клетке по воле экспериментатора.
Рекомбинатная ДНК – искусственная молекула, составленная методами генной инженерии из участков разных природных ДНК. Тот же смысл имеют термины «гибридная» и «химерная» ДНК.
Рентгеновские лучи – коротковолновое электромагнитное излучение с длиной волны порядка 10–10 м.
Рентгенограмма – изображение на фотопластинке в результате ее засвечивания рентгеновскими лучами, рассеянными кристаллом.
Рентгеноструктурный анализ – метод определения внутренней структуры кристаллических веществ путем специальной обработки получающихся от них рентгенограмм. Является наиболее прямым и наиболее мощным методом определения строения вещества. Наши знания о строении молекул любой сложности, в том числе основных биологических молекул, белков и нуклеиновых кислот, являются прямым результатом использования этого метода.
Репарация – залечивание повреждений в ДНК.
Репликация – удвоение генетического материала. Синтез ДНК на ДНК.
Репрессор – белок, очень прочно связывающийся с определенным участком ДНК, расположенным между промотором и самим геном. Связавшись с ДНК, репрессор препятствует продвижению РНК-полимеразы от промотора к гену и тем самым блокирует синтез мРНК. Служит для регуляции транскрипции.
Репрограммирование клетки – направленное изменение программы экспрессии генома, приводящее к перерождению одного типа клеток многоклеточного организма в другой тип клеток.
Рестриктаза – фермент, разрезающий двойную спираль в местах с определенной последовательностью нуклеотидов. Главный инструмент генной инженерии.
Рестрикционный фрагмент – кусок ДНК, вырезанный из молекулы при помощи рестриктаз.