В августе 1956 г. Чэнь Юнь был по совместительству назначен председателем государственного комитета по капитальному строительству.
Начиная с 1958 г., в работе партии в области экономики проявилось то, что в КНР называют «левыми» «ошибками». Возникли большие трудности для людей и в деревне, и в городе; по сути дела, «великий скачок» и кампания по созданию «народных коммун» привели к массовому голоду и гибели людей от недоедания.
Чэнь Юнь сравнительно рано обнаружил проблемы, которые стали результатом политики «великого скачка» и кампании по созданию «народных коммун».
В декабре 1958 г. Чэнь Юнь предложил не обнародовать завышенные показатели, которых следовало добиваться в области производства стали, угля, зерна, хлопка в соответствии с решениями 6-го пленума ЦК КПК 8-го созыва. Затем он указал на то, что этих показателей трудно будет добиться. Однако его предложения тогда не были приняты во внимание Мао Цзэдуном.
В апреле 1959 г. Чэнь Юнь предложил осуществить целый ряд мер, которые могли бы смягчить чрезвычайную напряженность в снабжении населения товарами, которое тогда осуществлялось по карточкам. В частности, увеличить производство зерна и экономить зерно, организовать снабжение городов продовольственными товарами, специально организовать производство товаров повседневной необходимости, сокращать число лишних рабочих и служащих в городах, заблаговременно наладить транспортировку необходимых в городах товаров и т. д.
В мае того же года, по поручению Мао Цзэдуна, Чэнь Юнь произвел расчеты с целью урегулирования завышенных показателей производства стали, исходя из общей ситуации в экономике. Вслед за этим он, будучи болен и нуждаясь в лечении после болезни, посетил ряд районов страны — Гуаней, Цзилинь, Хэбэй, Шаньдун, Хэнань, Аньхой, Чжэцзян, Цзянсу, а также Шанхай, где изучал ситуацию в области сельского хозяйства, производства стали, горнорудной продукции, химических удобрений и проблему обеспечения жизненных потребностей населения. Посетив одно из хозяйств в окрестностях Шанхая, он пришел к выводу о необходимости — в целях скорейшего восстановления и развития свиноводства — в массовом порядке передать свиней из «народных коммун» в частные руки крестьян и оставить крестьянам приусадебные участки.
Весной 1961 г. Чэнь Юнь внес предложение об импорте зерна, а также о повышении цен на некоторые виды товаров с той целью, чтобы вернуть деньги и побудить городское население отправляться в деревню. Все это были важные решения, которые вытекали из общей обстановки в стране.
В январе 1962 г. во время расширенного рабочего совещания, проведенного ЦК КПК, выступая на заседании одной из групп участников этого совещания, Чэнь Юнь говорил о необходимости правильного понимания ситуации, обращая внимание на имевший в то время уклон, суть которого состояла в одностороннем преувеличении фактора субъективной воли.
Чэнь Юнь говорил, что при рассмотрении вопросов необходимо непременно обмениваться мнениями, необходимо всестороннее сопоставление и сравнение мнений; нужно также, основываясь на фактах, снова и снова возвращаться к изучению вопросов, так как только при этих условиях можно добиться того, чтобы понимание проблем стало более всесторонним, в большей мере отвечало практике, реальному положению вещей. Чэнь Юнь подчеркивал, что только при этих условиях можно правильнее руководить работой.
В феврале того же года он выступал на расширенном заседании постоянного комитета политбюро ЦК КПК и на заседании правительства со своими соображениями относительно положения в области финансов и экономики и о некоторых методах преодоления трудностей. Эти выступления сыграли важную направляющую роль, содействовали единому пониманию партией проблем, урегулированию экономики страны и повороту к лучшему в сфере экономики и финансов.
Стремясь стимулировать производственную активность крестьян, разрешить серьезные трудности, с которыми тогда столкнулись крестьяне, Чэнь Юнь выдвинул предложение о доведении производственных заданий до крестьянских дворов.
В апреле 1962 г. Чэнь Юнь снова был назначен руководителем группы ЦК КПК по финансово-экономическим вопросам. Он содействовал преодолению негативных последствий «великого скачка» и кампании за создание «народных коммун». Предложил целый ряд верных мероприятий. Благодаря, в частности, этим предложениям менее чем за три года удалось исправить положение. Вклад Чэнь Юня в эти годы общепризнан в КНР и в КПК.
Во время «культурной революции» Чэнь Юнь подвергся критике, которая впоследствии была признана ошибочной, потерял пост заместителя председателя ЦК КПК, но тем не менее не только не был исключен из партии, но всегда оставался членом ЦК КПК. Чэнь Юнь не подвергался репрессиям, с его головы не упал ни один волос.
В 1969 г. его направили на один из заводов в городе Наньчане в Гуанси. Это тогда называлось «отправить человека посидеть на корточках на одном месте», то есть имелось в виду, что тот или иной политический деятель или кадровый работник партии должен был покинуть свое постоянное место жительства и «обосноваться в низовой точке», «руководить и знакомиться с работой на месте», «углубленно изучать опыт на месте». Там Чэнь Юнь провел три года. За это время он прочитал много классических марксистских сочинений, особенно, как утверждалось, работы В.И. Ленина, написанные после октября 1917 г. Чэнь Юнь при этом увязывал прочитанное с ситуацией в Китае, с практикой в Китае, исследовал некоторые проблемы строительства социализма в КНР.
С 1973 по 1974 г. Чэнь Юнь проводил исследования некоторых вопросов работы в сфере внешней торговли.
Он также пришел к выводу о том, что необходимо должным образом изучать современный капитализм. С точки зрения Чэнь Юня, если не изучать современный капитализм, потерпишь поражение. Без этого невозможно занять должное место на мировом рынке. Он также заявил о том, что не следует противопоставлять курс опоры на собственные силы и использование займов у капиталистов. В этой связи, по мнению Чэнь Юня, банк КНР должен был смело привлекать иностранный капитал и выполнять именно эту задачу. Это тогда имело большое значение.
В январе 1975 г. Чэнь Юнь был избран заместителем председателя постоянного комитета Всекитайского собрания народных представителей.
В 1976 г. он активно участвовал в устранении от власти «четверки». Чэнь Юнь говорил тогда маршалу Е Цзяньину, под руководством которого «четверка» и была отстранена от власти: борьбы против «четверки» избежать невозможно.
На созванном в марте 1977 г. рабочем совещании ЦК КПК Чэнь Юнь выдвинул предложение о том, чтобы снова позволить Дэн Сяопину участвовать в работе по руководству партией, и со всей решительностью отстаивал это предложение.
Тогда же Чэнь Юнь выступал за то, чтобы правильно понять и заново дать верную оценку событиям на площади Тяньаньмэнь 5 апреля 1976 г., то есть событиям, которые, по сути дела, выражали протест людей против политики, проводившейся во время «культурной революции».
Он активно поддержал критику ошибочного курса, который выражался в формулировке «во всем поступать в соответствии с указаниями Мао Цзэдуна».
Чэнь Юнь активно поддержал развертывание кампании обсуждения вопроса о критерии истины. Он полностью одобрил тезис о том, что «практика — это единственный критерий истины».
В марте 1978 г. Чэнь Юнь был снова избран заместителем председателя постоянного комитета Всекитайского собрания народных представителей.
В ноябре — декабре того же года на рабочем совещании ЦК КПК он призвал возвратить доброе имя Бо Ибо и другим людям, которых причисляли к так называемой «группировке 61 предателя», необоснованно обвиняя в предательстве Компартии Китая и переходе на службу к Гоминьдану в 1930-х гг.
Чэнь Юнь выступил за то, чтобы целиком и полностью пересмотреть ошибочные политические выводы, которые были сделаны в отношении Тао Чжу и Ван Хэшоу, двух известных деятелей КПК, репрессированных во время «культурной революции».
Чэнь Юнь также полагал, что Пэн Дэхуай, доведенный Мао Цзэдуном до смерти за выступление в защиту крестьян в годы «великого скачка» и осуществления кампании создания «народных коммун», является членом партии, который внес очень большой вклад в дело партии.
Одновременно Чэнь Юнь указал на то, что во время «культурной революции» Кан Шэн, осуществлявший под непосредственным руководством Мао Цзэдуна, с помощью подчиненных ему специальных органов партии и государства, широкие репрессии, совершил серьезные ошибки, и предложил, чтобы ЦК КПК провел расследование по этому вопросу.
Во всех вышеперечисленных случаях Чэнь Юнь никогда прямо не упоминал о Мао Цзэдуне.
На этом же совещании он также выдвинул мысль о том, что при осуществлении модернизации в четырех областях (промышленность, сельское хозяйство, наука и образование, оборона) необходимо проявлять активность и осмотрительность.
Он выступал за то, чтобы придать устойчивость, уверенность в своем положении крестьянам, которые являются «головой всего и вся», и благодаря этому добиться, чтобы было восстановлено благосостояние страны, дать стране оправиться от последствий случившихся в Китае несчастий (то есть от последствий правления Мао Цзэдуна).
В промышленности, по мнению Чэнь Юня, при заимствовании зарубежной передовой техники необходимо шаг за шагом, постепенно продвигаться вперед. Тут следовало действовать в определенной последовательности и никак нельзя было «хватать все подряд, скопом и тащить к себе».
Чэнь Юнь также полагал, что необходимо предоставить всем провинциям и городам центрального подчинения определенную свободу маневра финансовыми средствами.
Все это в совокупности сыграло чрезвычайно важную роль при исправлении того, что тогда в КНР именовалось «левыми» ошибками, имевшими место внутри КПК.
В декабре 1978 г. на 3-м пленуме ЦК КПК 11-го созыва Чэнь Юнь был снова избран членом постоянного комитета политбюро ЦК КПК, заместителем председателя ЦК КПК и первым секретарем комиссии ЦК КПК по проверке дисциплины.