В начале 1809 года снова началось противостояние между Францией и Австрией. Россия была союзницей Франции, но Быченский, который командовал русской эскадрой после смерти Салтанова, не знал, как должен действовать в изменившихся условиях. Да и австрийцы не желали делать из России врага, если этого можно избежать. Исход дела решило отступление австрийских сил и оккупация Триеста французами 18 мая. А уже 29 мая подошла британская эскадра. Русские источники говорят о пяти линкорах и трех фрегатах, но в действительности она состояла, как мы увидим позже, из трех 74-пушечников, трех фрегатов и двух бригов. Ожидая атаки, русские сформировали линию у берега и установили орудия на берегу, но встречное течение и полное отсутствие ветра удерживало противников на расстоянии до тех пор, пока все надежды на внезапное нападение исчезли. Англичане ушли, сделав несколько выстрелов с большого расстояния. В октябре все русские суда в Триесте, Венеции и на Корфу были переданы Франции.
Вернемся теперь к флоту Коллингвуда у Дарданелл. Сенявин увел свои корабли оттуда 26 августа 1807 года, и 7 сентября флот отбыл с Тенедоса на Корфу. Подозревая, что русские корабли могут быть отданы французам, Коллингвуд решил последовать за ними. Он оставил «Куин» 100 и «Кент» 74, чтобы поддержать посла, который наконец получил разрешение проследовать в Константинополь на фрегате «Тетис» 38, а остальные корабли отплыли 16 сентября вслед за русскими. Так Коллингвуд лично убедился, что русский флот находится на пути к выходу из Средиземного моря. Попытка договориться с турками провалилась, и в октябре посол отбыл восвояси.
После этого ситуация – в отношении Британии и Турции – не менялась больше года. Единственный существенный инцидент – стычка в июле 1808 года между британским фрегатом «Сихорс» 38 (на котором фактически было 42 орудия) с двумя турецкими кораблями – «Бадере Зафер» 52 и «Алис Фезан» 24. К этому привела активность некоторых греческих союзников русских, которые закрепились на островах, что к северу от Негропонта (Эвбеи), и занялись пиратством. Согласно Джеймсу, существовала договоренность между Коллингвудом и турками о том, что их корабли не должны заходить в Архипелаг. Несмотря на это, эскадра из трех фрегатов, двух шлюпов, двух бомбардирских кораблей и некоторого количества мелких судов в конце июня прошла Дарданеллы и взяла курс на остров Дромо (или Хелиодромия), где пираты устроили базу.
Новость о появлении турок достигла фрегата «Сихорс», который находился в 150 милях к югу – у острова Сира (Сирое), 1 июля. Британцы сразу подняли якорь и уже вечером 5-го заметили два турецких корабля и две галеры между островами Скопелос и Дромо. Бой между «Сихорс» и «Бадере Зафер» начался вскоре после девяти часов вечера. Он прервался на некоторое время появлением между ними корабля «Алис Фезан», но его вскоре оттеснили, и к 10.30 два фрегата снова вступили в бой. Попытки абордажа были легко отбиты британцами, и «Бадере Зафер» остался только с двумя мачтами, причем уцелели лишь их нижние части. К часу ночи турецкий фрегат прекратил огонь. «Сихорс» дождался рассвета и выпустил всего один бортовой залп, после чего турецкий корабль сдался. Из команды в 500 человек 165 человек погибли и 195 получили ранения. На корабле «Сихорс» было только 5 убитых и 10 раненых, а самым серьезным повреждением стала потеря бизани.
Вскоре после этого действа, 28 июля, очередная революция привела к смещению султана Мустафы и восхождению на престол его младшего брата Махмуда II. После этого возобновились переговоры о мире, и 5 января 1809 года они успешно завершились.
Тем временем британцы блокировали Корфу и порты Адриатики, находившиеся в руках французов. Они же подбивали Али-пашу нападать на те французские владения, до которых он мог дотянуться. В начале французской оккупации разные группы кораблей отправлялись на Корфу из Тулона и по большей части достигали своих целей. «Помона» 40, «Паулин» 40 и «Викторьез» 24 вышли из Тулона в октябре 1807 года. За ними последовали бриги «Экурейль», «Меркурий» и «Циклоп», потом судно «Сен-Филиппе» и шебека «Жубер»13. Однако блокада не позволяла обеспечить доставку необходимых запасов на Корфу из итальянских портов, и эта трудность привела к отправке весной 1808 года крупного флота из Тулона. Это был первый за десять лет французский флот, появившийся к востоку от Италии.
В качестве первого шага к этому контр-адмирал Аллеман покинул Рошфор 17 января. В составе его флота были следующие корабли: «Мажестьё» 120, пять 74-пушечников – «Аях», «Лион», «Магнаним», «Жемап», «Суффрен», фрегат «Флора» и бриг «Рекен». Флот воспользовался преимуществом ухода блокирующей эскадры, чтобы пополнить запасы. «Жемап» вернулся в Рошфор, но остальные корабли беспрепятственно вышли в Средиземное море и 9 февраля прибыли к Тулону. На следующий день адмирал Гантом, новый командующий тулонским флотом, вывел свои корабли на соединение с флотом Аллемана. Речь идет о «Коммерс де Пари» 110, «Робуст» 80, «Женуа» 74, «Борей» 74, «Аннибал» 74, фрегате «Урани» 40, двух шлюпах, шхуне и трех снабженческих судах. Один из последних сел на мель при выходе из порта и был оставлен вместе с «Рекеном», который тоже сел на мель, и шхуной «Редбридж», признанной непригодной для плавания. Плохая погода разделила тулонские корабли и их адмирала и привела к потере стеньги на флагмане, но эскадра Рошфора оставалась рядом, и, когда 23 февраля корабли прибыли на Корфу, у Гантома осталось шесть линкоров. Британских блокирующих кораблей они так и не встретили. Французский флот был замечен с кораблей «Стандард» 64 и «Поркьюпайн» 22, и они оба сразу взяли курс на Сиракузы, чтобы проинформировать Коллингвуда. Но «Поркьюпайн» встретил в море «Эктив» 38, и они вместе вернулись, чтобы наблюдать за перемещениями противника, предоставив «Стандарду» доставить информацию Коллингвуду. Как оказалось, он прибыл в Сиракузы слишком поздно.
Гантом выгрузил запасы на Корфу, отправил малые суда в итальянские порты, чтобы привести оттуда другие снабженческие суда, а потом, оставив «Коммерс де Пари» для производства ремонта, 25 февраля вывел в море пять линкоров. Он рассчитывал найти контр-адмирала Космао с отставшими тулонскими кораблями в месте встречи у мыса Санта-Мария («пятки» итальянского сапога). Однако только 13 марта, когда он вторично прибыл на Корфу, к нему присоединились эти корабли. Тем временем он дошел до Сицилии и вернулся мимо Занте и других Ионических островов, а «Эктив» и «Поркьюпайн» следовали за ним по пятам. Космао зашел в Таранто и первоначально намеревался идти оттуда в Неаполь – по приглашению короля, брата Наполеона, но, услышав, что его ищет Гантом, отказался от этой идеи и направился на Корфу.
21 февраля контр-адмирал сэр Ричард Стрэчен, в обязанности которого входило наблюдение за рошфорской эскадрой и который абсолютно верно предположил, что она направилась на Средиземноморье, прибыл в Палермо с шестью линкорами. Он присоединился к вице-адмиралу Торнборо, который находился там с еще пятью линкорами. Коллингвуд в это время был в Сиракузах. Он побывал в окрестностях Корфу в конце декабря и еще раз в середине января. После этого он пришел к выводу, что нет необходимости оставлять там тяжелые корабли, тем более что оставшиеся русские корабли находились в это время в другом конце Адриатики. 23 февраля он услышал, что Аллеман на Средиземном море, на следующий день направился на соединение с Торнборо. При этом он чуть-чуть разминулся со «Стандардом», от которого мог узнать, что французы уже на Корфу. Тот прибыл в Сиракузы вечером того дня, когда Коллингвуд увел из порта свои корабли.
Коллингвуд и Торнборо встретились на западе Сицилии 2 марта, и уже на следующий день главнокомандующему поступила информация со «Спартана» 38, что корабли Гантома видели незадолго до этого у Сардинии. А уже 6-го они встретили «Аполлон» 38, команда которого наблюдала за выходом французов из Тулона. Помимо этого у британцев не было никаких сведений о передвижении французов до 13-го, когда они подошли к Неаполю. Утверждают, что здесь до него наконец дошло сообщение со «Стандарда», но если да, то лишь в очень туманной форме, поскольку 4 апреля Коллингвуд писал, что получил определенную информацию о передвижениях противника только накануне. В любом случае теперь он возвращался вдоль западного побережья Сицилии в Сиракузы и прибыл туда 21-го с 12 линкорами. Предварительно он отослал контр-адмирала Мартина обратно в Палермо с еще тремя линкорами.
Тем временем Гантом 16 марта направился домой, взяв с собой корабли «Помона» 40, «Паулин» 40 и «Викторьез» 24 из прошлогодней экспедиции. Он оставил на Корфу «Урани» 40 и снабженческое судно «Вар». Британцы не видели французов до 1 апреля, когда со «Спартана» 38 заметили французские корабли, идущие в западном направлении между Сардинией и африканским побережьем, в 100 милях к западу от Сицилии. К этому времени британский флот уже не представлял для французов никакой опасности, поскольку находился у восточной оконечности острова. Коллингвуд покинул Сиракузы 22 марта и направился к мысу Санта-Мария, ожидая в любой момент встретить французов. 28-го британцы находились в районе Капо-Риццуто – на полпути между Сиракузами и Корфу, когда стало известно, что Гантом покинул Адриатику больше недели назад. Судя по всему, Коллингвуду было известно, что со «Спартана» был замечен противник, еще до 3 апреля, поскольку 4-го он писал: «Их видели три дня назад идущими по Средиземному морю, полагаю, что к Минорке для соединения с испанцами». Также он писал, что получил точную информацию о местонахождении французов только накануне.
Тем не менее к французскому флоту британцы даже не приблизились: 10 апреля, когда они все еще находились к югу от Сардинии, французский флот вошел в Тулон. Коллингвуд продолжал следовать прежним курсом до того, как его корабли оказались к югу от Минорки. Тогда он узнал, что Гантом там не появлялся. 16 апреля он повел флот обратно, чтобы прикрыть Сицилию, и курсировал между этим островом и Сардинией до тех пор, пока не узнал, что 28-го французы вернулись в Тулон. Он направился туда. К Тулону британский флот подошел 3 мая, а в конце месяца Коллингвуд направился в Кадис, оставив Торнборо продолжать блокаду.