Визит Гантома на Корфу стал последней попыткой Наполеона вести широкомасштабные военно-морские операции в Восточном Средиземноморье. Что касается суши, за получением от России в 1807 году Ионических островов последовала оккупация всего восточного побережья Адриатики, переданного Австрией в 1809 году. Однако на море влияние французов неуклонно падало, и относительно небольшие силы британцев смогли почти полностью контролировать Адриатику и даже захватить некоторые удаленные французские позиции.
В конце 1808 и начале 1809 года несколько британских фрегатов вели наблюдение за Венецией и соседними портами, а другая группа кораблей, в том числе «Стандард» 64, блокировала Корфу. 2 мая корабль «Юните» 36 захватил итальянский бриг «Ронко» у Полы. А 1 июня было захвачено еще два брига, «Неттуно» и «Телье», среди островов недалеко от Зары (Задар). В следующем году, 8 февраля, «Амфилог» 32 и «Редвинг» 18 также неподалеку от Зары, в районе острова Мелада (Молат), отрезали от берега вооруженный бриг и еще одно судно, перевозившее войска из Зары в Анкону. А лодки с «Меркурия» 28 1 апреля захватили «Леду», одну из пары итальянских канонерок. Это произошло в районе Ровиньо (Ровинь), между Полой и Триестом. Немного южнее 14 февраля с фрегата «Бель Пуль» 38 было замечено французское судно «Вар» 22, идущее с Корфу в Бриндизи за зерном. Французское судно пошло в Валону, но «Бель Пуль» его преследовал и захватил на следующее утро, без вмешательства турецких фортов. Два французских 40-пушечных фрегата, «Даная» и «Флора», которые покинули Тулон 15 февраля с оружием и боеприпасами для Корфу, были замечены 12 марта к югу от острова с кораблей «Топаз» 36 и «Кингфишер» 14. Последний не смог приблизиться на расстояние выстрела, но «Топаз» обменялся несколькими бортовыми залпами с обоими французскими кораблями, прежде чем они ушли вверх по каналу Корфу.
К этому времени уже было очевидно, что очень скоро начнется еще одна война между Францией и Австрией, причем, являясь врагом Франции, Австрия, надо полагать, станет врагом России и союзницей Британии. Это соображение придало новую важность военно-морским силам в Адриатике, и в особенности четырем русским линкорам в районе Триеста. Когда действительно началось противостояние между Францией и Австрией – это произошло 10 апреля, – в головной части Адриатики находилось три британских фрегата – «Амфион» 32, «Темза» 32 и «Меркурий» 28. На соединение с ними шел «Спартан». Такие силы, хотя и могли справиться с фрегатами и малым флотом французов и итальянцев, были бессильны против русских линкоров, и, соответственно, 2 мая Коллингвуд отправил три 74-пушечника из флота, блокировавшего Тулон, на Адриатику для поддержки австрийцев – насколько это будет возможно, конечно.
Случилось так, что события на суше решили судьбу Триеста и положение русских судов там еще до прибытия британского подкрепления. Наполеон вошел в Вену чуть больше чем через месяц после первого выстрела, и кампания на австро-итальянском фронте двигалась тем же курсом. Британские фрегаты 23 апреля и 2 мая захватили несколько торговых судов в районе Пезаро и Чезенатико, между Анконой и Равенной, организовали взаимодействие с небольшой австрийской флотилией, и 8 мая австрийские войска высадились на острове Луссин (Лосин). Там они без труда подавили сопротивление маленького французского гарнизона, но, естественно, никак не могли остановить наступление французской армии, которая вошла в Триест 18 мая. Австрийская флотилия, два брига и несколько канонерок, отошла к Луссину вместе с кораблями «Спартан» и «Амфион» и теми британскими призами, которые успели к ним присоединиться. На их место 22 мая прибыла из Венеции дивизия французских канонерок.
Через несколько дней снова появились британцы. Харгуд на «Нортумберленде» 74, а также «Экселлент» 74 и «Монтегю» 74 подошли к Луссину 28 мая. Взяв с собой «Спартан», «Амфион» и «Темзу», а также бриги «Имоджин» и «Редвинг», Харгуд направился к Триесту, к которому приблизился 29-го. К сожалению, отсутствие ветра и встречные течения не позволили ему атаковать внезапно и позволили русским и французам отвести свои корабли ближе к берегу под защиту орудий мощных береговых батарей. Капитаны «Спартана» и «Амфиона», хорошо знавшие эти места, высказались против атаки, и Харгуд нехотя удалился.
Вскоре после заключения мира между Британией и Турцией в январе 1809 года возобновилось противостояние между Турцией и Россией. Перемирие, договоренность о котором была достигнута в августе 1807 года, истекало в марте, и ни одна из сторон не выказывала желания его продлить. Поскольку русского флота в Средиземном море больше не было, морская часть войны велась на Черном море и на Дунае, где русскую армию поддерживала внушительная флотилия. В России опасались, что к туркам может присоединиться британский флот, но этого не произошло.
В апреле и мае некоторые русские корабли выходили из Севастополя. «Воин» 32, шхуна «Экспедицион», «Лилия» 36, бриг «Алексей», «Назарет» 44 и трабака (трабакколо) «Константин» выходили в море парами в период между 18 апреля и 2 июня, захватили несколько незначительных призов, но турецкого флота не видели. 31 мая «Воин» и «Алексей» ушли в Анапу, куда прибыли 3 июня. После обстрела города, имевшего место 11-го, к ним присоединились «Златоуст» 32, бриг «Лаврентий» и канонерка, и сразу последовал второй обстрел. Потом «Воин» вернулся в Феодосию с депешами, а остальные корабли вошли в Керченский залив – на входе в Азовское море. «Алексей» остался там для ремонта, а другие корабли направились дальше на восток, в Суджук-Кале, где теперь находится Новороссийск, и 28 июня провели еще один обстрел, после чего вернулись в Севастополь.
Тем временем более мощная эскадра, в которую вошли «Варахаил» 66, «Победа» 66, «Назарет» 44, «Лилия» 36, бомбардирский корабль «Евлампий» и транспорт, были посланы, чтобы занять Анапу. Это было сделано без боя 27 июня, и 5 июля эскадра вернулась в Севастополь.
На Дунае 30 русских канонерок в начале мая обстреляли крепость Брэила. После этого они помогали, в меру сил, армии в завоевании Добруджи, региона между Нижним Дунаем и морем. Одно время там не было турецкой флотилии, но в августе в Севастополе узнали, что в конце июля около 20 турецких канонерок пришли в Босфор и ждут лишь хорошей погоды, чтобы направиться на север вместе с линкором и двумя тяжелыми фрегатами. Также говорили, что к выходу в море у турок готовы шесть линкоров и фрегат.
Для оказания противодействия противнику 25 августа из Севастополя вышли следующие корабли: «Анапа» 74, «Крепкий» 54, «Воин» 32, «Лилия» 36 и бриг «Алексей» и начали курсировать между Варной и устьем Дуная. По возвращении этой эскадры «Назарет» 44 был заменен двумя более крупными судами, и эскадра снова вышла в море 4 октября. Они подошли к Варне 7-го, причем достаточно близко, чтобы обменяться выстрелами с береговыми батареями. Заметив в гавани два турецких фрегата, шлюп и несколько канонерок, русский командир Стулли отправил бриг «Алексей» обратно с сообщением, а сам остался в пределах видимости.
Получив информацию от Стулли, 21 октября из Севастополя в Варну вышли «Анапа» 74, «Правый» 74 и требака «Константин». Но еще раньше русские фрегаты были оттеснены превосходящими силами противника. 15-го, когда они находились к югу от Варны, был замечен турецкий флот из двух 100-пушечных кораблей, трех 74-пушечников, трех фрегатов, шлюпа и двух небольших судов. Понятно, что русские корабли ушли. К счастью для них, судя по всему, турки ошибочно приняли их за собственные фрегаты и зашли прямо в Варну, не устроив погони. Правда, на следующий день они все же организовали преследование и едва не захватили «Назарет», который отстал от других кораблей. Два турецких линкора открыли огонь и даже причинили небольшие повреждения, но ветер внезапно переменился и усилился настолько, что им пришлось сбавить ход, частично убрав паруса. В возникшей неразберихе фрегат скрылся. Он воссоединился со своей эскадрой в районе Фидониси – Змеиного острова, что недалеко от эстуария Дуная, и вернулся с ними в Севастополь.
Другая группа кораблей под командованием Патиниоти прибыла к Варне 26 октября и не обнаружила в гавани ничего, за исключением 16 канонерок и нескольких других малых судов. Зато более сильная группа, куда вошли «Ратный» 100, «Мария» 74, «Воин» 32, «Лилия» 36, бриги «Алексей» и «Елизавета» и шхуна «Экспедицион», вышедшая из Севастополя 4 ноября и прибывшая к Варне 10-го, обнаружила в гавани шесть турецких линкоров. Макшеев с «Ратного» срочно взял курс на Одессу, в надежде застать там Патиниоти, но вместо этого нашел там ожидавший его приказ возвращаться в Севастополь, куда он прибыл 22 ноября. Патиниоти вернулся 7-го.
Так завершились военно-морские операции года. На Дунае высшим достижением флотилии стало взятие 24 ноября Брэилы после 10-дневного обстрела. Измаил пал 26 сентября, но Силистрия, хотя и подверглась серьезному натиску, все еще оставалась в руках турок. В целом операции 1810 года велись по такому же шаблону, как годом раньше, но кампания началась несколько позже. Первые признаки активности со стороны русских появились 22 мая, когда из Севастополя вышли «Лилия» 36, «Або» 14 и требака «Константин». На Дунае флотилия участвовала в осаде Силистрии, которая капитулировала 11 июня, после недельного сопротивления. Тем временем «Лилия», «Або» и «Константин» побывали у Суджук-Кале и дальше на востоке. Они вернулись в Севастополь 14 июня с несколькими призами, причем один из них был захвачен под французским флагом. Немного позже, 1 июля, «Варахаил» 66, «Воин» 32, «Константин» и две канонерки вышли в море из Севастополя и взяли курс на Сухум-Кале, что в восточной части Черного моря. Они прибыли туда 19-го, обстреляли город 21-го, на следующий день высадили войска, и 23-го Сухум капитулировал.
Тем временем контр-адмирал Сарычев вывел в море главные силы русского флота, имея приказ отыскать турецкий флот на южной стороне Черного моря и навязать ему бой, если представится возможность. Выйдя из Севастополя 12 июля с семью линкорами, двумя фрегатами и тремя бригами