Московское правительство, несмотря на продолжающуюся войну с Крымом, Речью Посполитой, Швецией, на борьбу с многочисленными бандами грабителей и «воров», не оставляло попыток навести государственный порядок на Дону и Волге. На Дон посылались: пшеница и мука, оружие и боеприпасы, деньги и сукно. Донское войско почти единогласно обещало «служить и прямить» царю Михаилу.
Волжским казакам царь Михаил направил грамоты, подтверждающие их вольности, а также отправил «разные запасы»: деньги, сукна, вино и пр. Москва начала переманивать на свою сторону и ногайцев, послав грамоту князю Иштерику. Волжские казаки в большинстве своём заявили о верности Москве. Лишь несколько отрядов, стоявших близ Астрахани, во главе с атаманом Верзигой, остались на стороне Заруцкого. Пятьсот шестьдесят казачьих сабель – «охотников за зипунами» отправились в Астрахань и присоединились к Заруцкому.
Из Терского городка пришла грамота, что терские казаки поддерживают «астраханских сидельцев» и царицу Марину с царевичем Иваном. От имени царицы и царевича Заруцкий вступил в переговоры с персидским шахом Аббасом и пытался склонить его наступательному союзу против Москвы. Но что нужды в том было Марине?
Шах в начале обещал дать войско Заруцкому, помочь деньгами и продовольствием. Но одно дело обещать, другое – жениться. В последствие шах уверял московское посольство, что казаки ввели его в заблуждение, де при них находился царь московский Иван Димитриевич, а Москва занята литовскими людьми, от которых казаки будут её освобождать. Де как узнал Аббас о воровстве Марины и Заруцкого, то отказал им в помощи.
Весной 1614 года, когда сошёл ледоход, Заруцкий намеревался идти стругам на Самару и на Казань. Союзная казакам Ногайская орда собиралась идти с ними берегом Волги. Однако, этим замыслам не удалось осуществиться. В марте воевода Пётр Головин уговорил терских казаков и служилых людей Терского городка «отложиться от воров и целовать Крест» царю Михаилу. Затем Головин собрал отряд из семисот воинских людей и приказал им идти на Астрахань под началом терского стрелецкого головы Василия Хохлова.
Ещё до прихода отряда Хохлова в Астрахани началось восстание против Заруцкого. Город оказался во власти восставших. Казаки с Заруцким и Мариной заперлись в кремле. Узнав о приближении отряда Хохлова, воры на стругах бежали вверх по Волге. По прибытии в Астрахань терский стрелецкий голова привёл к присяге ногайских татар во главе с Иштереком. Затем со стрельцами во главе Хохлов бросился в погоню за Заруцким. Он нагнал его и разгромил казаков. Однако, самому казачьему атаману и Марине с сыном на трёх стругах удалось уйти в дельту Волги и затеряться в протоках и рукавах. Там располагается целый архипелаг островов и почти непроходимые плавни. В этих иестах укрылись три казачьих струга. Следом по протокам беглецы обошли стороной Астрахань, вышли в море, и пошли вдоль берега на восток. Так они достигли дельты реки Яик (Урал) и двинулись вверх по реке. На Яике они остановились у Медвежьего городка и оказались в руках у яицкого казачьего атамана Уса.
Тем временем князь Одоевский, прибыв в Астрахань, узнал о том, что Заруцкий с Мариной оказались в Медвежьем городке на Яике. 6 июня 1614 года воевода направил на Яик флотилию с отрядом, возглавляемым стрелецкими головами – Пальчиковым и Онучиным. Уже 24 июня царский отряд осадил Медвежий городок. Атаман Ус и яицкие казаки на следующий же день сдались на милость победителя. Они били челом и целовали Крест государю Михаилу Феодоровичу. Заруцкий и Марина с сыном были выданы царским воеводам и немедленно отправлены к Одоевскому.
6 июля 1614 года караван стругов с пленными прибыл в Астрахань. Там Марину разлучили с Заруцким «воров» отправили в Казань под большой охраной. Из Казани их также порознь отправили в Москву сухим путём.
Летом 1614 года татарские орды разграбили Подолию, Буковину, Брацлавские и Волынские земли. Во главе крымско-татарской орды стоял Батырь Гирей Дивеев (Батер-бей).
В том же 1614 году 20-тысячная ногайская орда из Приазовья тайно и неожиданно прорвалась через Большую Засечную Черту, вышла к окрестностям Москвы и разорила южные замоскворецкие слободы. Другие ногайские отряды опустошили Темниковский и Алатырский уезды. Зимой татары «повоевали многие города», разорив окрестности Курска, Рыльска, Комаричей, Карачева и даже Брянска. Царское правительство не сумело собрать войска и отразить нашествие. В результате непрерывных набегов в Крым было уведено огромное количество русских пленников.
Официальная польская историография утверждает, что в Москве Марина была разлучена с сыном. Какое жестокое разочарование, безысходность и ожидание вероятной скорой погибели постигли её в тот час! А ведь она не забывала, что являлась венчанной российской царицей. Как рвали ей сердце разлука с сыном и неизвестность?! Польские историки стоят на том, что она была утоплена. Российские историки на основе документов свидетельствуют, что царица Марина умерла от горя в монастырской тюрьме. Однако, не исключено, что она была удушена в постели. Впрочем, Марина, как венчаная русская царица, разделила участь многих царствующих особ (в том числе великих княгинь) и наследниц женского пола.
Четырёхлетнего Ивана отняли у матери в одной рубашонке. Стоял холодный зимний день, и палач нёс мальчика на казнь, завернув его в свою шубу. Ивана повесили при большом стечении народа. По свидетельствам очевидцев, ребенок был столь лёгок, что петля не затянулась на его шее. На морозе он оледенел, а через несколько часов замёрз и погиб от переохлаждения. Безвинно убиенное дитя – ещё одна трагедия Смутного времени! Но можно ль было московскому правительству поступить иначе, учитывая нравы, порядки и законы того сурового времени?
Заруцкий же принял более жуткую смерть – он был посажен на кол. Ну а на что ему было ещё надеяться, после стольких преступлений и казней, совершённых по его приказу?
Зимой 1614–1615 году казачьи отряды Баловня разорили Каргопольский уезд, перебив более 2-х тысяч человек мирного населения. Расправы сопровождались жестокими и бессмысленными истязаниями пленных и заложников. Сжигались сёла, осквернялись храмы, забивался скот. По словам летописца Ивана Слободского, отряд Баловня совместно с запорожскими казаками пана Голеневского и «гетмана» Щелковицкого в декабре 1614 года опустошил Спасо-Прилуцкий Димитриев монастырь. Наверно в те годы и родилась запорожская поговорка: «Як козак саблэю блысне, дак москаль у штани дрысне».
Наконец 27 декабря воевода Валуев, получив подкрепление, нанёс поражение отряду казаков во главе с атаманом Карташовым под Вологдой. 4 января 1615 года воевода Лыков под Балахной разбил пришедшего с запорожцами Захария Заруцкого (брата Ивана Заруцкого) и двинулся через Ярославль к Вологде.
Когда в январе 1615 года отряд Лыкова числом в 2 тысячи сабель вошёл в Вологду, Михаил Баловень заявил о намерении перейти на государеву службу. Из повстанцев был сформирован отряд, который через Белозерск направили к Тихвину на войну со шведами. Но оттуда весной 1615 года 5-тысячный отряд Баловня неожиданно повернул вспять и предпринял бросок к самой Москве. В столице начинался переполох, так как лучшие царские войска были направлены навстречу отряду пана Лисовского, вторгшегося на западные земли России. В июне отряд Баловня разбил стан в Ростокино. Но повстанцы не торопились брать приступом столицу. Они желали выслушать предложение царского правительства. Переговоры затягивались. Тем временем воевода Борис Лыков привёл к Москве свои войска из Ярославля. Казаки передвинули свой стан ближе к Донскому монастырю. Во время очередных переговоров Баловень был схвачен, а его отряд окружён. Свыше 3 тысяч «воровских казаков» было взято в плен. Часть их целовала Крест государю Михаилу, часть казнена или отправлена в ссылку. Изувера и переветника (предателя) Баловня наконец настигла жестокая кара. 23 июля 1615 года он был повешен в Москве на железный крюк за ребра.
Весной того же 1615 года татарское нахождение вновь развернулось в полную силу. Первоначально отдельные татарские отряды приходили на кромские и орловские места. Но это были лишь небольшие банды крымских ратных людей. Весной-летом 1615 года главные силы крымских ратных – до 25 тысяч сабель по Кальмиусскому шляху ворвались в южнорусские уезды. Основную массу нападающих составили Большие и Малые ногаи и азовские татары
Татары и ногайцы проникли далеко вглубь территории Русского государства и встали кошем под Серпуховом. Оттуда их летучие отряды нападали на соседние земли. Разорению подверглись: Коломенский, Серпуховской, Калужский и Боровский уезды. В июле того же года азовские татары и ногайцы – до 3 тысяч сабель совершили новый набег на южнорусские рубежи.
Зимой и весной 1615 года крымско-татарская орда под предводительством Батырь Гирея Дивеева и Нурэддина Азамат-Гирея дважды разоряла Правобережную Украину. В августе-сентябре сам крымский хан Джанибек-Гирей с огромным войском, в котором, кроме татар, были турки, жестоко опустошил Малороссию. Разорению подверглись территории вплоть до Бара, Тернополя и Львова. Русское посольство из Крыма сообщало об огромном количестве пленных, взятых в украинных русских землях Речи Посполитой. Однако, коронный гетман Станислав Жолкевский не имел сил для отражения вражеских набегов.
В том же 1615 году польско-литовский отряд под рукой пана Лисовского прорвался во внутренние уезды России. У Лисовского было от 1200 до 2000 сабель. Приготовления к походу проходили в Смоленске и были согласованы с польскими военачальниками и лично с гетманом Ходкевичем. Поход был одобрен гетманом для отвлечения русских от Смоленска. Однако, казна Речи Посполитой не финансировала поход, а отряд кормился целиком за счёт военной добычи. Состав отряда пана Лисовского был пёстрым. Помимо литовцев, поляков и белорусов, в нём принимали участие немцы, татары и запорожцы. Первоначальное ядром отряда являлись около 600 «лисовчиков», которые делились на 6 кавалерийских хоругвей (сотен). С одной стороны, отряд обладал манёвренностью, но с другой – не имел тяжёлых орудий и не мог осаждать русские крепости.