В 1858 г. начался новый период. С того момента ученые стали заботиться обо всех древних артефактах, их начали защищать, причем начало этому положил тот самый исследователь, который обнаружил Серапеум. Мариэтт был назначен «мамуром» (директором) Службы древностей и занимал этот пост до самой своей смерти в 1881 г. Ему было назначено жалованье, и он получил разрешение нанимать помощников. В его распоряжении имелся пароход, он мог нанимать рабочую силу и время от времени получал определенные денежные суммы для выполнения конкретных задач. Мариэтт должен был проводить расчистку и реставрацию памятников и пересылать найденные объекты в специально созданный музей в Булаке. Несмотря на то что план его работы был весьма амбициозен, в реальности он проводил исследования только на четырех памятниках: в Танисе, Мемфисе, Абидосе и Фивах. В каждом случае ему удалось добиться выдающихся результатов. Достаточно перечислить только диоритовую статую Хефрена, львов с человеческими лицами, статуи людей с подношениями, гробницы Ти и Птахотепа, Рахотепа и Ноф-рет, сокровища царицы Яххотеп, надписи и царские списки.
Восхищение ученых, вызванное открытием такого большого количества сокровищ, сочеталось с некоторой тревогой, так как опубликованные результаты работы Мариэтта не соответствовали ее реальным масштабам. Египтологи, с нетерпением ждавшие свежих новостей, были вынуждены довольствоваться несколькими статьями в Revue archéologique и копиями текстов, сделанными без ведома Мариэтта.
В конце концов хранения египтологических библиотек пополнились несколькими превосходными изданиями, посвященными Дендере, Карнаку и Дейр-эль-Бахри, путешествию в Верхний Египет, а также альбомом с изображением артефактов, хранившихся в Булакском музее. В 1889 г. были опубликованы «Разные памятники» (Monuments divers) Мариэтта, причем это издание сопровождалось комментариями Масперо, издавшего на основе рукописей Мариэтта книгу о мастабах Древнего царства. Результаты других раскопок так и остались опубликованными лишь частично, а некоторые из запланированных исследований так и не были реализованы. В качестве примеров можно привести Танис, гробницу Ти, Серапеум и фиванский некрополь. Работа, начатая там, по разным причинам была завершена (или проводится до сих пор) другими исследователями.
Примерно в 1880 г. в библиотеке каждого египтолога стояли «Описание Египта», «Памятники…» Шампольона и Ро-зеллини, «Памятники» (Denkmäler) Лепсиуса, последний том которых был посвящен Берлинскому папирусу, и «Хрестоматия по истории египетского искусства» (L’Histoire de l’art égyptien d’après les monuments) Присса д’Авенна. Были опубликованы литографии с Лондонского, Лейденского и Туринского папирусов, а также папируса из Булакского музея и папируса Присса. Собрания надписей, составленные Бругшем, Дюмихеном и де Ружем, а также труды Мариэтта содержали все материалы, необходимые для работы исследователям, таким как де Руж, Шаба и Девериа во Франции, Бирч, Уилкинсон и Гудвин в Англии, Лиман, Лепсиус, Эберс и Бругш в Германии, занимавшимся расшифровкой иероглифической письменности, лингвистам и историкам. Эберс, автор нескольких очаровательных романов, издал очень интересную работу по истории Египта, которую Масперо перевел на французский язык. Этот немецкий исследователь также опубликовал великолепный медицинский папирус, зачастую называемый в его честь. Бругш преуспел практически во всех сферах. После смерти Шампольона изучение демотических текстов приостановилось. В 1855 г. Бругш издал «Грамматику демотики» (Grammar of Demotic), где была дана характеристика основам «народного» языка и письменности древних египтян. Затем свет увидели еще два основополагающих труда: «Иероглифическо-демотический словарь» (Hieroglyphisch-demotisch Wörterbuch) и «Географический словарь Древнего Египта» (Geographical Dictionary of Ancient Egypt), содержащий сравнительные алфавитные перечни географических названий, встречающихся на памятниках и в папирусах. Позднее, в монографии «Египтология» (Die Aegytologie) он в краткой форме изложил результаты всех исследований, проводившихся им на протяжении всей продолжительной научной карьеры. В Лейпциге в 1862 г. начал выпускаться «Журнал о египетском языке и истории древности» (Zeitschrift für Aegyptische Sprache und Altertumskunde), которому суждено было стать первым периодическим изданием, посвященным египтологии, и который продолжает выходить в свет и в наши дни. С другой стороны, «Сборник» (Mélanges) и «Египтология» (L’Egyptologie), выпускавшиеся Шаба, пользовались успехом только в течение непродолжительного времени. Большой вклад в египтологию внесли «Научные труды» (Transactions), «Записки Общества библейской археологии» (Proceedings of the Society of Biblical Archaeology), «Азиатский журнал» (Journal asiatique) и «Археологическое обозрение» (Revue archéologique).
В настоящее время нет человека, который недооценивал бы вклад Шампольона и его преемников, к числу которых относились наиболее прославленные исследователи периода, подарившего нам такое большое количество выдающихся умов. Каждый год в Египет приезжало все больше путешественников. На церемонии открытия Суэцкого канала собралась гигантская толпа. Выставки, проводившиеся в Лондоне в 1867 г., неизменно пользовались огромным успехом. Таковым было состояние египтологии, когда в 1881 г. умер Мариэтт.
Назначение Масперо на должность, которую до этого занимал Мариэтт, и его отъезд в Египет накануне Первой мировой войны ознаменовали новую эпоху в истории египтологии. Масперо направили в Каир, чтобы помочь Мариэтту, уже страдавшему от болезни, которая вскоре станет причиной его смерти, и организовать работу постоянной миссии, незадолго до этого созданной французскими властями. Он должен был подготовить египтологов и арабских исследователей, уже прошедших обучение в университете, и полностью опубликовать древнеегипетские памятники, не выбирая тексты, показавшиеся наиболее интересными, как это делалось прежде. Это было замечательное предприятие, первыми плодами которого стали издания текстов из фиванских гробниц, гробницы Сети I и храма в Эдфу. Несмотря на некоторые недоработки, они были (и до сих пор остаются) крайне ценными. Публикация текстов гробницы Рамсеса IX, появившаяся позднее, была благосклонно принята самыми въедливыми критиками. Издание текстов храма в Эдфу, прерванное после выхода второго тома, между двумя мировыми войнами было возобновлено и почти завершено. В целом эта работа сама по себе заслуживает установки памятника в ее честь.
На протяжении нескольких лет Служба древностей работала, анализируя два случайных открытия, впоследствии оказавшиеся крайне важными. Еще при жизни Мариэтта было установлено, что не все стены в пирамидах были пустыми, как считалось прежде, и что стены внутренних камер некоторых из них были покрыты текстами, позволяющими получить довольно обширные знания о языке, а также древнейших заупокойных и религиозных представлениях египтян. В 1881 и 1882 гг. исследователи по очереди вошли в пять пирамид – принадлежащие Унасу, Тети, Пепи I, Меренре и Пепи II. Масперо с помощью Эмиля Бругша, американского египтолога Вилбура и Буриана из французской миссии тотчас же приступил к снятию оттисков со стен этих памятников. Начиная с 1882 г. в виде отдельных фрагментов в новом периодическом журнале под названием «Сборник трудов» (Recueil de Travaux) стали выходить в свет тексты и их переводы. По мнению немецкого филолога К. Зете, это стало важнейшим вкладом, внесенным в египтологию Ма-сперо за все долгие годы его работы.
Другое открытие было сделано в Фивах, на левом берегу Нила. В 1875 г. на рынке стали появляться артефакты, которые могли происходить только из царской гробницы. Вскоре стало известно, что этим новым и очень прибыльным бизнесом занимаются жители деревни Курна. Они поссорились, и один из них привел полицейских к найденной ими гробнице, расположенной на склоне холма, отделявшего Долину царей от плодородной равнины. От дна шахты глубиной более 10 м в камеру продолговатой формы вел длинный коридор. Как он, так и сама камера были завалены саркофагами, ящиками, сосудами и сундуками. На гробах были написаны имена величайших царей и цариц, правивших в эпоху Нового царства. Вскоре удивительные находки были перевезены в Луксор, а оттуда на пароходе их доставили в Булак. Опись находок проводилась на протяжении нескольких лет. Мумии развернули в июне 1886 г. в присутствии хедива Египта. Их измерили и тщательно описали. Кроме того, было сделано все возможное для того, чтобы обеспечить их сохранность. Эти мумии принадлежали царям и царевичам, изначально похороненным в роскоши в огромных гробницах, вырубленных в толще скалы и украшенных рельефами и росписями. Однако в последние годы правления представителей XX династии по Египту прокатилась волна анархии и грабежей, заставившая верховного жреца Амона по имени Херихор поместить мумии в простые деревянные гробы, изначально предназначавшиеся для гораздо менее высокопоставленных людей. Их перевозили из одного тайника в другой и наконец поместили в гробницу, где они спокойно лежали до 1875 г. Одно из наиболее подробных своих исследований, впоследствии опубликованное в первом томе «Записок французской миссии в Каире» (Mémoires de la Mission française du Caire), Масперо посвятил царским мумиям из Дейр-эль-Бахри.
Начиная с 1881 г. Служба древностей перестала быть монополистом в сфере проведения археологических исследований на территории Египта. Она выдавала разрешение на проведение раскопок иностранным ученым, если, конечно, те обладали достаточной квалификацией. При этом археологам разрешалось увозить половину из найденных ими артефактов. Вначале их работа никак не регулировалась. Только в 1912 г. появилось правило, в соответствии с которым иностранным исследователям запрещалось вывозить свою долю находок, пока они приведут исследуемый ими памятник в надлежащий вид.